Đa dạng di truyền được tiết lộ qua các đặc điểm hình thái và các dấu hiệu ISSR ở 48 cây đậu bắp (Abelmoschus esculentus L.)

Physiology and Molecular Biology of Plants - Tập 21 - Trang 359-364 - 2015
Cong-Ying Yuan1, Ping Wang1, Pang-Pang Chen2, Wen-Jun Xiao1, Cheng Zhang1, Shuai Hu1, Ping Zhou1, Hong-Ping Chang1, Zhuang He1, Rong Hu1, Xiu-Tao Lu1, Jia-Zhuo Ye3, Xin-Hong Guo1
1College of Biology, Hunan University, Changsha, People’s Republic of China
2Jiangxi Wugongshan Agriculture Development Limited Company, Luxi, People’s Republic of China
3College of Electrical and Information Engineering, Hunan University, Changsha, People’s Republic of China

Tóm tắt

Cây đậu bắp là một loại cây trồng được phân bố rộng rãi ở khu vực nhiệt đới, cận nhiệt đới và những vùng ấm áp của các khu vực ôn đới. Các ứng dụng tiềm năng chính của nó như một loại rau, nguồn dầu và protein, cũng như nguồn giấy bột và nhiên liệu, hoặc sinh khối là hoàn toàn tương hợp. Dự kiến cây sẽ có giá trị khai thác và ứng dụng cao. Do số lượng nghiên cứu phân tử tập trung vào cây đậu bắp còn hạn chế, phương pháp phân tích hình thái và dấu hiệu ISSR đã được sử dụng để phân tích đa dạng di truyền của 48 cây đậu bắp trong nghiên cứu này. 22 mồi đã được chọn cho ISSR-PCR, và tổng cộng có 154 đoạn được khuếch đại với mức đa hình trung bình chung là 54.55%. Chúng tôi đã sử dụng 154 dấu hiệu để xây dựng cây phát sinh chủng loại dựa trên phương pháp nhóm cặp không trọng số với trung bình số học (UPGMA). Một mức độ đa dạng di truyền cao đã được tìm thấy giữa 48 cá thể. 48 cây đậu bắp được chia thành bốn cụm tại hệ số Dice là 0.19 theo phân tích cụm. Dựa trên dữ liệu về đa dạng di truyền này, sẽ có thể tận dụng nguồn tài nguyên cây đậu bắp hiện có theo nhiều cách có giá trị hơn.

Từ khóa

#đậu bắp #đa dạng di truyền #dấu hiệu ISSR #cây trồng #phân tích hình thái

Tài liệu tham khảo

Babaei N, Abdullah NA, Saleh G, Abdullah TL (2012) Isolation and characterization of microsatellite markers and analysis of genetic variability in Curculigo latifolia Dryand. Mol Biol Rep 39(11):9869–9877 Bertoni BW, de C Telles MP, Malosso MG, Torres SC, Pereira JO, Lourenço MV, de C França S, Pereira AM (2010) Genetic diversity in natural populations of Jacaranda decurrens Cham. determined using RAPD and AFLP markers. Genet Mol Biol 33(3):532–538 Dhall RK, Sharma SR, Mahajan BV (2014) Development of post-harvest protocol of okra for export marketing. J Food Sci Technol 51(8):1622–1625 Earl DA, vonHoldt BM (2012) STRUCTURE HARVESTER: a website and program for visualizing STRUCTURE output and implementing the Evanno method. Conserv Genet Resour 4:359–361 Gul MZ, Bhakshu LM, Ahmad F, Kondapi AK, Qureshi IA, Ghazi IA (2011) Evaluation of Abelmoschus moschatus extracts for antioxidant, free radical scavenging, antimicrobial and antiproliferative activities using in vitro assays. BMC Complement Altern Med 11:64 Ibeawuchi IK (2007) Intercropping a food production strategy for resource poor farmers. Nat Sci 5(1):46–49 Nei M, Li WH (1979) Mathematical model for studying genetic variation in terms of restriction endonucleases. Proc Natl Acad Sci U S A 76:5269–5273 Oyelade OJ, Ade-Omowaye BIO, Adeomi VF (2003) Influence of variety on protein, fat contents and some physical characteristics of okra seeds. J Food Eng 57:111–114 Pritchard JK, Stephens M, Donnelly P (2000) Inference of population structure using multilocus genotype data. Genetics 155:945–959 Rohlf FG (2000) NTSYS-pc: numerical taxonomy and multivariate analysis system Version 2.1. Exeter Publications, New York Sethy NK, Shokeen B, Edwards KJ, Bhatia S (2006) Development of microsatellite markers and analysis of intraspecific genetic variability in chickpea (Cicer arietinum L.). Theor Appl Genet 112:1416–1428 Shamsul A, Arifuzzaman K (2007) Chemical analysis of okra bast fiber (Abelmoschus esculentus) and its physico-chemical properties. J Text Appar Technol Manag 5(4):1–9 Yuennan P, Sajjaanantakul T, Goff HD (2014) Effect of okra cell wall and polysaccharide on physical properties and stability of ice cream. J Food Sci 42:1750–1781