Nội dung được dịch bởi AI, chỉ mang tính chất tham khảo
Đặc điểm di truyền của virus cúm gia cầm bị cách ly ở Israel trong giai đoạn 2000–2006
Tóm tắt
Mục tiêu của chúng tôi là thiết lập các mối quan hệ phát sinh loài và di truyền giữa các virus cúm gia cầm (AIV) vừa được phân lập gần đây từ gia cầm ở Israel. Trong nghiên cứu này, chúng tôi đã phân tích cấu trúc nucleotide hoàn chỉnh của hai gen bọc (hemagglutinin và neuraminidase) và sáu gen nội bộ (polymerase B1, polymerase B2, polymerase A, nucleoprotein, không cấu trúc, và matrix) của 29 chủng H9N2 đã chọn và sáu gen nội bộ của năm virus H5N1 được phân lập ở Israel trong giai đoạn 2000–2006. Phân tích di truyền và phát sinh loài so sánh các chuỗi gen này cho thấy rằng các virus H5N1 địa phương có mối quan hệ gần gũi với các virus H5N1 được phân lập ở các nước châu Âu, châu Á và Trung Đông trong giai đoạn 2005–2006. Các chủng H9N2 bị cách ly ở Israel, cùng với các virus được phân lập ở Jordan và Ả Rập Saudi, tạo thành một nhóm duy nhất. Dữ liệu của chúng tôi hỗ trợ lập luận rằng trong những năm gần đây đã hình thành một ổ dịch H9N2 mới ở Trung Đông. Việc xuất hiện H5N1 và sự đồng lưu hành của hai kiểu phụ AIV này trong khu vực có thể làm tăng nguy cơ xuất hiện các chủng có khả năng gây đại dịch.
Từ khóa
#virus cúm gia cầm #quan hệ phát sinh loài #di truyền học #H9N2 #H5N1Tài liệu tham khảo
D.J. Alexander, Avian Dis. 47(Suppl 3), 792–797 (2003)
D.A. Senne, Avian Dis. 47(Suppl 3), 798–805 (2003)
World Health Organization, N. Engl. J. Med. 358, 261–273 (2008), http://www.nejm.org. Accessed 17 Jan 2008
I. Monne, G. Cattoli, E. Mazzacan, N.M. Amarin, H.M. Al Maaitah, M.Q. Al-Natour, I. Capua, Avian Dis. 51(Suppl 1), 451–454 (2007). doi:10.1637/7563-033106R.1
M.W. Jackwood, D.E. Stallknecht, Avian Dis. 51(Suppl 1), 448–450 (2007). doi:10.1637/7536-032706R.1
C. Banet-Noach, S. Perk, L. Simanov, N. Grebenyuk, E. Rozenblut, S. Pokamunski et al., Avian Dis. 51(Suppl 1), 290–296 (2007). doi:10.1637/7590-040206R1.1
U.B. Aamir, U. Wernery, N. Ilyushina, R.G. Webster, Virology 361(1), 45–55 (2007). doi:10.1016/j.virol.2006.10.037
R. Toroghi, R. Momayez, Acta Virol. 50, 163–168 (2006)
S. Perk, C. Banet-Noach, E. Shihmanter, S. Pokamunski, M. Pirak, M. Lipkind et al., Comp. Immunol. Microbiol. Infect. Dis. 29, 207–223 (2006). doi:10.1016/j.cimid.2006.06.004
S. Perk, A. Panshin, E. Shihmanter, I. Gissin, S. Pokamunski, M. Pirak et al., Dev. Biol. (Basel) 124, 201–209 (2006)
I.H. Brown, J. Banks, R.J. Manvell, S.C. Essen, W. Shell, M. Slomka et al., Dev. Biol. (Basel) 124, 45–50 (2006)
H. Nili, K. Asasi, Avian Pathol. 31, 247–252 (2002)
H. Nili, K. Asasi, Avian Dis. 47(Suppl 3), 828–831 (2003)
J. Banks, E.C. Speidel, P.A. Harris, D.J. Alexander, Avian Pathol. 29, 353–360 (2000). doi:10.1080/03079450050118485
K.S. Li, Y. Guan, J. Wang, G.J. Smith, K.M. Xu, L. Duan et al., Nature 430, 209–213 (2004). doi:10.1038/nature02746
T. Tiensin, P. Chaitaweesub, T. Songserm, A. Chaisingh, W. Hoonsuwan, C. Buranathai et al., Emerg. Infect. Dis. 11, 1664–1672 (2005)
G.J. Smith, T.S. Naipospos, T.D. Nguyen, M.D. de Jong, D. Vijaykrishna, T.B. Usman et al., Virology 350, 258–268 (2006). doi:10.1016/j.virol.2006.03.048
D.J. Alexander, Avian Dis. 51(Suppl 1), 161–166 (2007). doi:10.1637/7602-041306R.1
S. Perk, S. Pokamunsky, N. Elkin, B. Perelman, in Proceedings of the 5th International Symposium on Turkey Diseases, Berlin, ed. by H.M. Hafez (Verlag der DVG Service GmbH, Giessen, 2004), pp. 72–80
A. Leventhal, A. Ramlawi, A. Belbiesi, R.D. Balicer, Brit. Med. J. 333, 856 (2006)
S. Perk, C. Banet-Noach, N. Golender, L. Simanov, E. Rozenblut, S. Nagar et al., Virus Genes 35, 497–502 (2007). doi:10.1007/s11262-007-0120-1
World Health Organization, WHO Manual on Animal Influenza Diagnosis and Surveillance. http://www.who.int/csr/resources/publications/influenza/en/whocdscsrncs20025rev.pdf
E. Hoffmann, J. Stech, Y. Guan, R.G. Webster, D.R. Perez, Arch. Virol. 146(12), 2275–2289 (2001). doi:10.1007/s007050170002
Y. Guan, J.S. Peiris, A.S. Lipatov, T.M. Ellis, K.C. Dyrting, S. Krauss et al., Proc. Natl Acad. Sci. USA 99(13), 8950–8955 (2002). doi:10.1073/pnas.132268999
T.A. Hall, Nucleic Acids Symp. Ser. 41, 95–98 (1999)
R. Chenna, H. Sugawara, T. Koike, R. Lopez, T.J. Gibson, D.G. Higgins et al., Nucleic Acids Res. 31, 3497–3500 (2003). doi:10.1093/nar/gkg500
K. Tamura, J. Dudley, M. Nei, S. Kumar, MEGA4: Molecular Evolutionary Genetics Analysis (MEGA) software version 4.0. Mol. Biol. Evol. (2007). doi:10.1093/molbev/msm092
D.L. Noah, R.M. Krug, Adv. Virus Res. 65, 121–145 (2005). doi:10.1016/S0065-3527(05)65004-X
D.B. Finkelstein, S. Mukatira, P.K. Mehta, J.C. Obenauer, X. Su, R.G. Webster, C.W. Naeve, J. Virol. 81, 10292–10299 (2007)
K.M. Xu, G.J. Smith, J. Bahl, L. Duan, H. Tai, D. Vijaykrishna et al., J. Virol. 81(19), 10389–10401 (2007a). doi:10.1128/JVI.00979-07
K.M. Xu, K.S. Li, G.J. Smith, J.W. Li, H. Tai, J.X. Zhang, R.G. Webster, J.S. Peiris, H. Chen, Y. Guan, J. Virol. 81, 2635–2645 (2007)
H.J. Kwon, S.H. Cho, M.C. Kim, Y.J. Ahn, S.J. Kim, Avian Pathol. 35, 309–315 (2006). doi:10.1080/03079450600821166
P. Vannie, I. Capua, M.F. Le Potier, D.K. Mackay, B. Muylkens, S. Parida et al., Rev. Sci. Tech. 26(2), 351–372 (2007)
S. Zhao, M. Jin, H. Li, Y. Tan, G. Wang, R. Zhang et al., Avian Dis. 49, 488–493 (2005). doi:10.1637/7321-010405R1.1
T.M. Tumpey, R. Alvarez, D.E. Swayne, D.L. Suarez, J. Clin. Microbiol. 43(2), 676–683 (2005). doi:10.1128/JCM.43.2.676-683.2005
W.G. Dundon, S. Maniero, A. Toffan, I. Capua, G. Cattoli, Avian Dis. 51(Suppl 1), 209–212 (2007). doi:10.1637/7556-033106R.1
M. Shaw, L. Cooper, X. Xu, W. Thompson, S. Krauss, Y. Guan et al., J. Med. Virol. 66(1), 107–114 (2002). doi:10.1002/jmv.2118
N.R. Donelan, C.F. Basler, A. García-Sastre, J. Virol. 77(24), 13257–13266 (2003). doi:10.1128/JVI.77.24.13257-13266.2003
R.M. Krug, Science 311(5767), 1562–1563 (2006). doi:10.1126/science.1125998
R.P. Kamal, C. Tosh, B. Pattnaik, P. Behera, S. Nagarajan, S. Gounalan et al., Arch. Virol. 152(9), 1637–1644 (2007). doi:10.1007/s00705-007-1002-5
H. Zhou, M. Jin, H. Chen, Q. Huag, Z. Yu, Virus Genes 32, 85–95 (2006). doi:10.1007/s11262-005-5849-9
K.Y. Twu, R.-L. Kuo, J. Marklund, R.M. Krug, J. Virol. 81, 8112–8121 (2007). doi:10.1128/JVI.00006-07
G.W. Chen, S.C. Chang, C.K. Mok, Y.L. Lo, Y.N. Kung, J.H. Huang et al., Emerg. Infect. Dis. 12, 1353–1360 (2006)