Nội dung được dịch bởi AI, chỉ mang tính chất tham khảo
Những kết quả đầu tiên về sự đa dạng di truyền của loài tôm càng đỏ xâm lấn Pacifastacus leniusculus (Dana, 1852) ở châu Âu sử dụng các vị trí microsatellite mới
Tóm tắt
Việc giới thiệu các loài tôm càng không bản địa vào hệ sinh thái thủy sinh rất phổ biến do hoạt động của con người (ví dụ như nuôi trồng thủy sản, các hoạt động đánh bắt thể thao và thương mại). Loài tôm càng đỏ tín hiệu, Pacifastacus leniusculus (Dana, 1852), là một trong những loài xâm lấn rộng rãi nhất ở châu Âu. Mặc dù đã có nhiều báo cáo về những tác động sinh thái và kinh tế quan trọng của loài này, nhưng việc xác định đặc điểm di truyền quần thể của nó tại châu Âu chưa bao giờ được thực hiện bằng cách sử dụng các dấu hiệu hạt nhân. Do đó, mục tiêu của nghiên cứu này là phát triển và xác định các dấu hiệu microsatellite mới cho tôm càng đỏ tín hiệu, có thể hữu ích cho các nghiên cứu trong tương lai trong vùng đã bị xâm lấn của nó, vì hiện tại chỉ có năm dấu hiệu có sẵn. Tổng cộng, 93 cá thể từ bốn quần thể châu Âu khác nhau về mặt địa lý (Bồ Đào Nha, Vương quốc Anh, Phần Lan và Thụy Điển) đã được đánh giá bằng các dấu hiệu mới và các dấu hiệu đã được mô tả trước đó, với phân tích Bayesian cho thấy sự phân biệt rõ ràng giữa các quần thể. Các dấu hiệu này phù hợp cho các nghiên cứu trong tương lai về cấu trúc di truyền quần thể của loài xâm lấn quan trọng này, bằng cách tăng cường thông tin về các con đường có thể xảy ra của việc giới thiệu và phân tán, và cung cấp những hiểu biết về các tác nhân quan trọng nhất trong việc xâm lấn.
Từ khóa
#tôm càng đỏ xâm lấn #Pacifastacus leniusculus #di truyền quần thể #microsatellite #châu ÂuTài liệu tham khảo
Alderman DJ (1996) Geographical spread of bacterial and fungal diseases of crustaceans. Rev Sci Tech 15:603–632
Azuma N, Usio N, Korenaga T, Koizumi I, Takamura N (2011) Genetic population structure of the invasive signal crayfish Pacifastacus leniusculus in Japan inferred from newly developed microsatellite markers. Plankton Benthos Res 6(4):187–194
Belkhir K, Borsa P, Chikhi L, Raufaste N, Bonhomme F. (1996–2004) GENETIX 4. 05, logiciel sous Windows TM pour la génétique des populations. Montpellier, France: Laboratoire Génome, Populations, Interactions, CNRS UMR 5000, Université de Montpellier II
Bohman P, Nordwall F, Edsman L (2006) The effect of the large-scale introduction of signal crayfish on the spread of crayfish plague in Sweden. Bull Fr Peche Piscic 380–381:1291–1302
Brownstein MJ, Carpten JD, Smith JR (1996) Modulation of non-templated nucleotide addition by Taq DNA polymerase: primer modifications that facilitate genotyping. Biotechniques 20:1004–1010
Chapuis MP, Estoup A (2007) Microsatellite null alleles and estimation of population differentiation. Mol Biol Evol 24:621–631
Evanno G, Regnaut S, Goudet J (2005) Detecting the number of clusters of individuals using the software STRUCTURE: a simulation study. Mol Ecol 14(8):2611–2620
Filipová L, Petrusek A, Matasová K, Delaunay C, Grandjean F (2013) Prevalence of the crayfish plague pathogen Aphanomyces astaci in populations of the signal crayfish Pacifastacus leniusculus in France: evaluating the threat to native crayfish. PLoS One 8:e70157
Froufe E, Sobral C, Teixeira A, Lopes A, Sousa R, Varandas S, Lopes-Lima M (2013) Development and multiplexing of microsatellite loci for the near threatened freshwater mussel Potomida littoralis (Cuvier, 1798) using 454 sequencing. Aquat Conserv 23:619–623
Fürst M (1977) Introduction of Pacifastacus leniusculus (Dana) into Sweden: methods, results and management. Freshw Crayfish 3:229–247
Harvey GL, Henshaw AJ, Moorhouse TP, Clifford NJ, Holah H, Grey J, Macdonald DW (2014) Invasive crayfish as drivers of fine sediment dynamics in rivers: field and laboratory evidence. Earth Surf Process Landforms 39:259–271
Henttonen P, Huner JV (1999) The introduction of alien species of crayfish in Europe: a historical introduction. In: Gherardi F, Holdich DM (eds) Crayfish in Europe as alien species. How to make the best of a bad situation? AA Balkema, Rotterdam, Brookfield, pp 13–22
Hulák M, Kašpar V, Kozák P, Buřič M, Filipová L, Petrusek A (2010) Cross-species amplification of microsatellite markers in the invasive spiny-cheek crayfish (Orconectes limosus): assessment and application. J Appl Genet 51:73–78
Kouba A, Petrusek A, Kozák P (2014) Continental-wide distribution of crayfish species in Europe: update and maps. Knowl Manag Aquat Ecosyst 413:05
Larson ER, Abbott CL, Usio N, Azuma N, Wood KA, Herborg L-M, Olden JD (2012) The signal crayfish is not a single species: cryptic diversity and invasions in the Pacific Northwest range of Pacifastacus leniusculus. Freshw Biol 57:1823–1838
Malausa T, Gilles A, Meglécz E, Blanquart H, Duthoy S, Costedoat C, Dubut V, Pech N, Castagnone-Sereno P, Délye C, Feau N, Frey P, Gauthier P, Guillemaud T, Hazard L, Le Corre V, Lung-Escarmant B, Malé PJG, Ferreira S, Martin JF (2011) High-throughput microsatellite isolation through 454 GS-FLX Titanium pyrosequencing of enriched DNA libraries. Mol Ecol Res 11:638–644
Miller GC (1960) The taxonomy and certain biological aspects of the crayfish of Oregon and Washington. Masters thesis, Oregon State College, Corvallis, OR
Nyström P, Brönmark C, Granéli W (1996) Patterns in benthic food webs: a role for omnivorous crayfish? Freshw Biol 36:631–646
Pritchard JK, Stephens M, Donnelly P (2000) Inference of population structure using multilocus genotype data. Genetics 155:945–959
Raymond M, Rousset F (1995) GENEPOP (version 1.2)—population genetics software for exact tests and ecumenicism. J Hered 86:248–249
Sambrook J, Fritsch EF, Maniatis T (1989) Molecular cloning: a laboratory manual. Cold Harbor Spring Press: New York
Skurdal J, Taugbøl T, Burba A, Edsman L, Söderbäck B, Styrishave B, Tuusti J, Westman K (1999) Crayfish introductions in the Nordic and Baltic countries. In: Gherardi F, Holdich DM (eds) Crayfish in Europe as alien species. How to make the best of a bad situation? AA Balkema, Rotterdam, Brookfield, pp 193–219