Số phận và Vận chuyển của dư lượng kháng sinh và gen kháng kháng sinh sau khi áp dụng phân động vật lên đất

Journal of Environmental Quality - Tập 38 Số 3 - Trang 1086-1108 - 2009
Joanne C. Chee‐Sanford1,2, Roderick I. Mackie3,4, Satoshi Koike3, Ivan G. Krapac5, Yu‐Feng Lin6, Anthony C. Yannarell3, Scott Maxwell7, Rustam Aminov8
1Dep. of Crop Sciences, Univ. of Illinois, 1102 S. Goodwin Ave., Urbana, IL, 61801
2USDA-ARS, 1102 S. Goodwin Ave., Urbana, IL, 61801
3Dep. of Animal Sciences, and Division of Nutritional Sciences, Univ. of Illinois, 1207 W. Gregory, Urbana, IL, 61801
4Institute for Genomic Biology, Univ. of Illinois, 1206 W. Gregory, Urbana, IL, 61801
5Illinois State Geological Survey, 1910 Griffith Dr., Champaign, IL, 61820
6Illinois State Water Survey, 2204 Griffith, Champaign, IL, 61820
7Dep. of Natural Resources and Environmental Sciences, Univ. of Illinois, 1102 S. Goodwin Ave., Urbana, IL, 61801
8Rowett Research Institute, Greenburn Rd., Bucksburn, Aberdeen, AB21 9SB Scotland, UK

Tóm tắt

Kháng sinh được sử dụng trong sản xuất chăn nuôi gia súc để điều trị bệnh và ở mức độ dưới trị liệu nhằm thúc đẩy tăng trưởng và cải thiện hiệu suất thức ăn. Ước tính khoảng 75% kháng sinh không được hấp thụ bởi động vật và bị thải ra ngoài qua chất thải. Việc chọn lọc kháng kháng sinh xảy ra giữa các vi sinh vật đường tiêu hóa, mà cũng được bài xuất trong phân và được lưu trữ trong hệ thống chứa chất thải. Việc áp dụng chất thải động vật trên đất là một phương pháp thải bỏ phổ biến được sử dụng ở Hoa Kỳ và cũng là một phương tiện đưa cả kháng sinh và các yếu tố di truyền kháng thuốc vào môi trường. Những lo ngại về việc chọn lọc gen kháng vi sinh vật và sự truyền bá của các gen kháng thuốc đã thúc đẩy sự quan tâm về nồng độ và hoạt tính sinh học của dư lượng thuốc và các sản phẩm phân hủy của chúng, cùng với số phận và vận chuyển của chúng. Vi khuẩn phân có thể sống sót từ vài tuần đến vài tháng trong môi trường, tùy thuộc vào loài và nhiệt độ, tuy nhiên, các yếu tố di truyền có thể tồn tại bất chấp sự sống còn của tế bào. Phân tích phả hệ chỉ ra rằng các gen kháng kháng sinh đã tiến hóa, mặc dù một số gen đã tồn tại trong vi khuẩn trước thời kỳ kháng sinh hiện đại. Cần có các phép đo định lượng về dư lượng thuốc và mức độ gen kháng, bên cạnh việc hiểu các cơ chế môi trường của chọn lọc di truyền, tiếp nhận gen, và động lực không gian - thời gian của các gen kháng này cùng với các khoang vi khuẩn của chúng. Bài báo tổng quan này thảo luận về việc tích lũy các phát hiện liên quan đến khía cạnh số phận, vận chuyển, và sự tồn tại của kháng sinh và gen kháng kháng sinh trong môi trường tự nhiên, với sự nhấn mạnh vào các cơ chế liên quan đến môi trường đất sau khi áp dụng các chất thải động vật.

Từ khóa

#kháng sinh #kháng kháng sinh #vi khuẩn #môi trường tự nhiên #phân động vật

Tài liệu tham khảo

AHI, 2001, Survey shows decline in antibiotic use in animals

10.1016/j.chemosphere.2004.06.024

10.2134/jeq2005.0355

10.1016/0092-8674(92)90095-T

10.1128/AEM.68.4.1786-1793.2002

10.1128/AEM.67.1.22-32.2001

10.1111/j.1574-6968.2007.00757.x

Andremont A., 2003, Commensal flora may play key role in spreading antibiotic resistance, ASM News, 69, 601

10.1139/w04-090

10.3201/eid0807.010264

10.1128/AEM.69.1.285-289.2003

10.1529/biophysj.107.124792

Azadpour‐Keeley A., 2003, Movement and longevity of viruses in the subsurface

10.1128/AEM.70.2.758-764.2004

10.1021/es990910k

10.1046/j.1462-2920.1999.00004.x

10.1093/jac/17.4.409

10.1099/mic.0.27112-0

Bauer B., 1996, Genetic transformation in freshwater: Escherichia coli is able to develop natural competence, Appl. Environ. Microbiol., 62, 3673, 10.1128/aem.62.10.3673-3678.1996

10.1038/nature02241

10.1016/j.trac.2004.08.005

Beegle D., 1997, Using composted dairy manure, Adv. Dairy Technol., 9, 67

Bennett P.M., 2008, Plasmid encoded antibiotic resitance: Acquisition and tranfer of antibiotic resistance genes in bacteria, Br. J. Pharmacol., 153, 5347, 10.1038/sj.bjp.0707607

10.1073/pnas.70.8.2276

Bitton G., 1992, Environmental microbiology, 103

10.1016/j.jmb.2008.03.075

10.1128/JCM.11.4.309-313.1980

10.1016/S0723-2020(97)80021-5

10.1016/j.prevetmed.2005.02.007

10.1046/j.1365-2672.1999.00677.x

10.1007/s00248-001-1009-5

10.1016/S0378-4274(02)00063-2

10.1007/0-387-21729-0_1

10.1021/jf053041t

10.1089/fpd.2005.2.287

10.1128/MMBR.68.3.560-602.2004

10.1016/j.aca.2007.05.006

10.2134/jeq2004.0261

10.1128/AEM.64.2.733-741.1998

10.1016/j.soilbio.2005.05.019

10.1021/es0522985

10.1128/AAC.47.10.3290-3295.2003

10.1016/S0048-9697(02)00233-4

10.1128/AEM.70.10.6342-6346.2004

Chakrabarty A.N., 1990, ‘DNA’ as contaminants in antibiotics and its capacity to transform bacteria to drug resistance, Indian J. Exp. Biol., 28, 58

Chandler D., 1981, Persistence and distribution of pollution indicator bacteria on land used for disposal of piggery effluent, Appl. Environ. Microbiol., 42, 453, 10.1128/aem.42.3.453-460.1981

10.1139/m88-128

10.1128/AEM.67.4.1494-1502.2001

Chen I., 2004, DNA uptake during bacterial transformation, Nat. Rev., 2, 241

10.1128/AEM.02799-06

Cherry J.A., 2007, Contaminant transport through aquitards: A state‐of‐the‐science review

10.1016/0140-6736(93)91509-K

10.1016/S0168-6496(03)00247-2

10.1093/jac/39.suppl_1.7

10.1093/emboj/cdg093

10.1046/j.1365-2958.2002.03115.x

10.1016/j.biortech.2005.03.024

10.1046/j.1467-2920.2003.00467.x

10.1016/S0038-0717(97)00248-4

Cromwell G.L., 2001, Swine nutrition, 401

10.1128/AEM.62.2.515-521.1996

10.1007/s00248-007-9271-9

10.1007/978-3-662-09259-0_33

10.1126/science.1120800

10.1128/AEM.71.5.2766-2770.2005

10.1128/AEM.67.8.3440-3444.2001

10.1128/AEM.67.1.293-299.2001

10.1128/AEM.67.6.2617-2621.2001

Di Giovanni G., 1996, Gene transfer of Alcaligenes eutrophus JMP134 plasmid pJP4 to indigenous soil recipients, Appl. Environ. Microbiol., 62, 2521, 10.1128/aem.62.7.2521-2526.1996

10.1577/1548-8667(2000)012<0246:TKOODI>2.0.CO;2

10.2134/jeq2007.0391

10.2134/jeq2006.0266

Donohoe A.L., 1984, Biochemical studies on the fate of monensin in animals and in the environment, J. Anim. Sci., 58, 1528, 10.2527/jas1984.5861528x

10.1128/AAC.35.1.185

10.1007/BF01540093

10.1093/jac/dkh217

10.1093/jac/dki255

10.1080/09603120220129292

Feinman S.E., 1978, Bureau of Veterinary Medicine

10.1016/j.ijantimicag.2005.09.021

Fulhage C.D. andPost D.Swine manure management systems in Missouri. Available at (verified 16 Feb. 2009).. Available athttp://www.muextension.missouri.edu/xplor/envqual/eq0350.htm(verified 16 Feb. 2009).2005

10.1111/j.1574-6941.1994.tb00236.x

10.1016/j.chemosphere.2006.08.040

10.1016/j.chemosphere.2006.08.038

Gattinger A., 2006, Structure and function of archaeal communities in natural and agriculturally used soil ecosystems, 06426

10.1093/jaoac/77.2.481

10.1111/j.1574-6941.1999.tb00581.x

Gerba C.P., 1984, Groundwater pollution microbiology, 65

10.1007/978-1-4612-4464-6_18

10.1128/AEM.01435-07

10.1289/ehp.8837

10.1038/45724

10.1128/aem.63.5.1980-1986.1997

Goyal S.M., 1983, Viral pollution of the environment, 211

10.2134/jeq2003.3830

10.1111/j.1574-6968.2006.00270.x

10.4315/0362-028X-65.2.274

10.1046/j.1365-2672.1997.00280.x

10.1139/cjm-46-6-542

10.1016/S0045-6535(97)00354-8

10.1897/04-182R.1

10.1021/ac015588m

Hanzawa Y., 1984, Antibiotic‐resistant coliforms in the waste of piggeries and dairy farms, Japan. J. Vet. Sci., 46, 363, 10.1292/jvms1939.46.363

10.2134/jeq2004.1189

Harwood C., 2008, The uncharted microbial world: Microbes and their activities in the environment

10.1016/j.tim.2004.07.003

10.1128/AEM.65.8.3710-3713.1999

10.1128/AEM.70.2.921-928.2004

10.1007/PL00000796

10.1111/j.1574-6941.2002.tb01019.x

10.1111/j.1462-2920.2006.01185.x

10.1111/j.1745-6584.1996.tb02172.x

10.1016/S0048-9697(98)00337-4

10.1016/j.jphotobiol.2005.07.005

10.1002/jps.2600580412

10.2134/jeq1995.00472425002400030003x

Huang C.‐H., 2001, Proc. of the 2nd Int. Conf. on Pharmaceuticals and Endocrine Disrupting Chemicals in Water, 46

10.1128/AEM.70.9.5111-5118.2004

10.1128/JB.183.18.5445-5448.2001

10.1006/eesa.2000.2026

Institute of Medicine, 1989, Human health risks with the subtherapeutic use of penicillin or tetracyclines in animal feed

Isaacson R.E., 2002, The role of antibiotics in agriculture

10.1016/0044-8486(88)90120-2

10.1128/AEM.68.5.2605-2609.2002

10.1128/AEM.64.8.2780-2787.1998

10.1128/AEM.59.10.3513-3515.1993

10.1016/0168-1605(91)90090-C

10.1016/0167-7012(95)00026-H

10.1139/m90-154

10.1897/03-374

10.1016/j.chemosphere.2004.11.055

10.1128/AAC.01587-05

10.1021/es60171a602

Khachatourians G.G., 1998, Agricultural use of antibiotics and the evolution and transfer of antibiotic‐resistant bacteria, Can. Med. Assoc. J., 159, 1129

10.1128/AEM.58.6.1930-1939.1992

10.1128/AEM.35.4.711-717.1978

10.1111/j.1574-6968.2004.tb09529.x

10.1128/AEM.00665-07

10.1021/es011055j

10.2175/106143005X41618

10.1016/j.chemosphere.2005.02.094

Krapac I.G., 2004, Proc. of the 4th Int. Conf. on Pharmaceuticals and Endocrine Disrupting Chemicals in Water, 158

10.2134/jeq2005.0026

10.1093/jac/dkh325

10.1016/S0045-6535(99)00439-7

10.2134/jeq2005.0440

10.1128/AAC.48.8.3141-3146.2004

10.1016/S0038-0717(99)00062-0

10.1021/es047997g

10.1038/nature04983

Lenski R.E., 1997, The cost of antibiotic resistance—From the perspective of a bacterium, Ciba Found. Symp., 207, 131

Lesická‐Hupková M., 1996, Mobilization of antibiotic resistance for transfer in Pseudomonas aeruginosa., J. Chemother., 8, 261, 10.1179/joc.1996.8.4.261

10.1016/0921-8777(93)90075-R

Levy S.B., 1989, Gene transfer in the environment

10.1128/MMBR.63.3.507-522.1999

10.1128/AEM.63.4.1577-1583.1997

Livestock and Poultry Environmental Stewardship.Appendix C: Livestock and poultry manure characterization. Available at (verified 16 Feb. 2009).. Available athttp://www.lpes.org/Lessons/Lesson21/21_9_manure_character.pdf(verified 16 Feb. 2009).2005

10.1016/S0045-6535(02)00078-4

10.1128/AEM.53.12.2948-2952.1987

10.1128/mr.58.3.563-602.1994

10.1016/S0169-7722(02)00238-3

10.1023/A:1020127107028

10.1073/pnas.0408966102

MacDonald J.M., 2008, Econ. Information Bull. 38

10.1111/j.1745-6592.1995.tb00555.x

10.1111/j.1574-6968.2007.01030.x

10.1637/7105

10.1146/annurev.ge.25.120191.001051

10.1029/92WR02592

10.2134/jeq1998.00472425002700010013x

10.1023/A:1010278628468

10.1002/med.10052

10.1007/978-3-642-69974-0

10.1002/prot.21327

10.1016/S0043-1354(98)00380-7

Nasser A.M., 1993, Comparative survival of E. coli, F+ bacteriophages, HAV and poliovirus 1 in wastewater and groundwater, Water Sci. Technol., 27, 401, 10.2166/wst.1993.0381

Nebraska Beef Council, 2007, Beef industry information, State/industry facts

10.1128/AEM.66.1.206-212.2000

10.1016/S0038-0717(00)00147-4

10.1007/s00284-004-4430-4

10.1007/s00248-006-9199-5

10.1016/j.trac.2007.02.007

10.1080/00103629509369513

10.1021/es00173a020

10.1128/aem.58.6.2046-2052.1992

10.1046/j.1462-2920.2003.00459.x

10.1007/s10661-007-9805-0

10.1016/S0378-1097(03)00045-4

10.1128/AAC.39.11.2499

10.1016/0731-7085(95)01522-M

10.1111/j.1574-6968.1992.tb05435.x

Park N., 1994, CANVAS: A composite analytical‐numerical model for viral and solute transport simulation, version 2.0

10.1080/10807030701506223

10.1111/j.1365-2672.2005.02773.x

10.1111/j.1462-2920.2006.01190.x

Payment P., 1989, Virus removal by drinking water treatment processes, Crit. Rev. Environ. Contr., 19, 15, 10.1080/10643388909388357

Pillai S.D., 1997, Antibiotic resistance profiles of Escherichia coli isolated from rural and urabn environments, J. Environ. Sci. Health A, 32, 1665

10.1097/00010694-196101000-00006

10.1097/00010694-196102000-00003

Pinck L.A., 1962, Antibiotics in soils: 4. Polypeptides and macrolides, Soil Sci., 94, 121, 10.1097/00010694-196208000-00011

10.1016/S0043-1354(02)00280-4

Prescott L.M., 1999, Microbiology, 678

10.1016/S0045-6535(99)00442-7

10.1136/jcp.2004.024091

10.1128/AEM.59.12.4289-4294.1993

Richert B.T., 1995, J. of Extension

10.1111/j.1462-2920.2004.00664.x

10.1016/S0924-8579(98)00005-3

10.3109/10408419709115134

10.1128/aem.52.3.531-538.1986

10.1128/AEM.59.10.3438-3446.1993

Rotz C.A., 2004, Management to reduce nitrogen losses in animal production, J. Anim. Sci., 82, E119

10.2134/jeq2003.1865

10.1128/AAC.41.11.2321

10.1016/j.tim.2004.07.004

10.1128/MMBR.59.4.579-590.1995

10.1016/0044-8486(94)90044-2

10.1016/0968-0004(92)90507-6

10.1007/s002840010079

10.1289/ehp.9770

10.1016/j.chemosphere.2006.03.026

10.1128/AEM.71.3.1394-1404.2005

Scandura J.E., 1997, Viral and bacterial contamination of groundwater from on‐site sewage treatment systems, Water Sci. Technol., 35, 107, 10.2166/wst.1997.0724

10.1128/AEM.61.4.1637-1640.1995

10.1080/10643380091184174

10.1016/j.soilbio.2005.02.022

10.2134/jpa1995.0186

10.1016/S0160-4120(02)00084-3

10.1097/00013542-200201000-00002

10.1542/peds.2004-1233

10.1128/AEM.67.2.561-568.2001

10.1016/0147-619X(92)90053-D

10.1128/JB.184.6.1806-1810.2002

10.1021/es026000b

Sims J.D.Flow and transport through fractured clay till: A laboratory study. M.S. thesis. Dep. of Earth Sciences Univ. of Waterloo Waterloo ON.1993

Simunek J., 1999, The HYDRUS‐2D software package for simulating the two‐dimensional movement of water, heat, and multiple solutes in variably‐saturated media, Version 2.0

10.1007/BF00225116

10.1007/BF00225117

10.1054/drup.2000.0146

10.1126/science.156.3778.1114

10.1128/AEM.70.12.7372-7377.2004

Sobsey M.D. Khatib L.A. Hill V.R. Alocilja E. andPillai S.Pathogens in animal wastes and the impacts of waste management practices on their survival transport and fate.White Paper Summaries. Available online (verified 16 Feb. 2009).2001

10.1101/gad.9.5.547

10.1016/S0168-1605(02)00241-6

10.1051/vetres:2001121

10.1111/j.1462-2920.2006.00989.x

10.1016/j.anaerobe.2007.03.004

10.1128/AEM.69.7.3874-3882.2003

10.1128/AAC.49.3.1265-1266.2005

10.1128/AEM.70.6.3754-3757.2004

10.1128/jb.175.19.6134-6141.1993

Stewart G.J., 1989, Gene transfer in the environment, 139

10.2134/jeq1998.00472425002700060031x

10.2134/jeq2000.00472425002900030003x

10.3201/eid0304.970403

Timoney J.F., 1978, Heavy‐metal and antibiotic resistance in the bacterial flora of sediments of New York Bight, Appl. Environ. Microbiol., 36, 465, 10.1128/aem.36.3.465-472.1978

10.1021/es0003021

10.1007/BF00261679

10.1023/A:1008830914223

10.1023/A:1025693109248

Union of Concerned Scientists, 2001, Hogging it: Estimates of antimicrobial abuse in livestock, 109

USDA, 2001, Part I: Reference of swine health and management in the United States, 2000, National Animal Health Monitoring System

USDA, 2001, Part II: Reference of swine health and management in the United States, 2000, National Animal Health Monitoring System

USDA, 2007, Swine 2006, Part II: Reference of swine health and health management practices in the United States, 2006 USDA:APHIS:VS, CEAH

USDA NASS.Statistics of cattle hogs and sheep. Available at (verified 16 Feb. 2009).. Available athttp://www.nass.usda.gov/Publications/Ag_Statistics/2008/Chap07.pdf(verified 16 Feb. 2009).2002

USDA NRCS.Animal manure management. NRCS/RCA issue brief 7 Dec. 1995. Available at (verified 16 Feb. 2009).1995

USGAO, 1999, General Accounting Office

Utah Department of Health.Medication disposal summary report. Available at (verified 16 Feb. 2009).. Available athttp://health.utah.gov/prescription/pdf/NewHampshire_Disposal_technical.pdf(verified 16 Feb. 2009).2007

10.1128/jb.170.3.1319-1324.1988

10.1128/AEM.64.3.880-889.1998

10.1046/j.1365-2672.2003.02046.x

10.1007/s00248-006-9197-7

10.4315/0362-028X-61.6.662

10.1128/AEM.62.4.1242-1247.1996

10.1128/AAC.37.11.2379

10.1046/j.1462-2920.2003.00539.x

Wellings F.M., 1974, Virus survival in water and wastewater systems

Wellings F.M., 1975, Demonstration of virus in groundwater after effluent discharge onto soil, Appl. Microbiol., 29, 751, 10.1128/am.29.6.751-757.1975

10.1016/0378-1119(92)90559-8

10.1128/JB.184.14.3839-3847.2002

10.1128/AEM.65.8.3483-3486.1999

10.1111/j.1462-2920.2007.01374.x

10.1128/AEM.71.6.3119-3125.2005

10.1128/AAC.49.6.2490-2494.2005

10.1128/MMBR.64.1.69-114.2000

10.1016/S0043-1354(03)00399-3

10.2134/jeq1995.00472425002400060002x

Yates M.V., 2000, Project 262

10.1080/10643388809388339

10.1128/AEM.71.11.6926-6933.2005

10.1128/AEM.61.4.1290-1293.1995

10.2134/jeq1978.00472425000700040025x