Xuất Khẩu Virus Đậu Mùa Khỉ Từ Lục Địa Châu Phi

Journal of Infectious Diseases - Tập 225 Số 8 - Trang 1367-1376 - 2022
Matthew R. Mauldin1, Andrea M. McCollum1, Yoshinori Nakazawa1, Anna Mandra2,1, Erin Whitehouse2,1, Whitni Davidson1, Hui Zhao1, Jinxin Gao1, Li Yu1, Jeffrey B. Doty1, Adesola Yinka-Ogunleye3, Afolabi Akinpelu3, Olusola Aruna4, Dhamari Naidoo5, Kuiama Lewandowski6, Babak Afrough6, Victoria Graham6, Emma Aarons6, Roger Hewson6, Richard Vipond6, Jake Dunning6, Meera Chand6, Colin Brown6, Inbar Cohen-Gihon7, Noam Erez8, Ohad Shifman7, Ofir Israeli7, Sharon Melamed8, Eli Schwartz9,10, Adi Beth-Din7, Anat Zvi7, Tze Minn Mak11, Yi Kai Ng11, Lin Cui11, Raymond Tzer Pin Lin11, Victoria A. Olson1, Tim Brooks6, Nir Paran8, Chikwe Ihekweazu3, Mary G. Reynolds1
1Poxvirus and Rabies Branch, Centers for Disease Control and Prevention, Atlanta, Georgia, USA
2Epidemic Intelligence Service, Centers for Disease Control and Prevention, Atlanta, Georgia, USA
3Nigerian Centre for Disease Control, Abuja, Nigeria
4International Health Regulations Strengthening Project, Global Public Health, Public Health England, London, United Kingdom
5World Health Organization–Country Office, Abuja, Nigeria
6Public Health England, London, United Kingdom
7Department of Biochemistry and Molecular Biology, Israel Institute for Biological Research, Ness-Ziona, Israel
8Department of Infectious Diseases, Israel Institute for Biological Research, Ness-Ziona, Israel
9Faculty of Medicine Sackler School of Medicine Tel Aviv University Tel Aviv Israel
10Institute of Tropical Medicine, Chaim Sheba Medical Center, Tel Hashomer, Israel
11National Public Health Laboratory, National Centre for Infectious Diseases, Singapore

Tóm tắt

Tóm tắt Thông tin nền Đợt bùng phát đậu mùa khỉ lớn nhất ở Tây Phi bắt đầu vào tháng 9 năm 2017, tại Nigeria. Bốn cá nhân từ Nigeria đến Vương quốc Anh (n = 2), Israel (n = 1) và Singapore (n = 1) đã trở thành những trường hợp đậu mùa khỉ đầu tiên được xuất khẩu từ châu Phi, và một sự kiện lây truyền nosocomial liên quan ở Vương quốc Anh đã trở thành sự kiện lây truyền đậu mùa khỉ từ người sang người đầu tiên được xác nhận ngoài châu Phi. Phương pháp Dữ liệu dịch tễ học và phân tử của các trường hợp xuất khẩu và Nigeria được phân tích phối hợp để hiểu rõ hơn về các vụ xuất khẩu trong bối cảnh thời gian và địa lý của đợt bùng phát. Kết quả Các mẫu từ tất cả những người du lịch và một trường hợp ở Bayelsa chia sẻ tổ tiên chung gần nhất và đã di chuyển đến các tiểu bang Bayelsa, Delta hoặc Rivers. Biến thể di truyền cho cụm này thấp hơn mức dự kiến từ một mẫu ngẫu nhiên các bộ gen từ đợt bùng phát này, nhưng dữ liệu không hỗ trợ các liên kết trực tiếp giữa những người du lịch. Kết luận Sự đơn dòng của các trường hợp xuất khẩu và mẫu Bayelsa, cùng với các mức độ biến đổi di truyền trung gian, gợi ý rằng một nhóm nhỏ các mẫu tương quan có thể là nguồn gốc khả thi cho các trường hợp lây nhiễm xuất khẩu. Điều này có thể là kết quả của mức độ biến thể di truyền hiện có trong các mẫu đậu mùa khỉ lưu hành trong khu vực liền kề của các tiểu bang Bayelsa, Delta và Rivers, hoặc một nguồn ở mức độ hạn chế khác, nhưng chưa được xác định.

Từ khóa


Tài liệu tham khảo

Ladnyj, 1972, A human infection caused by monkeypox virus in Basankusu Territory, Democratic Republic of the Congo, Bull World Health Organ, 46, 593

World Health Organization

Doty, 2017, Assessing Monkeypox virus prevalence in small mammals at the human-animal interface in the Democratic Republic of the Congo, Viruses, 9:283

Essbauer, 2007, Genus Orthopoxvirus: Monkeypox virus, 65

Learned, 2005, Extended interhuman transmission of monkeypox in a hospital community in the Republic of the Congo. Am J Trop Med Hyg 2003, 428

Nolen, 2016, Extended human-to-human transmission during a monkeypox outbreak in the Democratic Republic of the Congo, Emerg Infect Dis, 22, 1014, 10.3201/eid2206.150579

Likos, 2005, A tale of two clades: monkeypox viruses, J Gen Virol, 86, 2661, 10.1099/vir.0.81215-0

Nakazawa, 2015, A phylogeographic investigation of African monkeypox, Viruses, 7, 2168, 10.3390/v7042168

Sadeuh-Mba, 2019, Monkeypox virus phylogenetic similarities between a human case detected in Cameroon in 2018 and the 2017–2018 outbreak in Nigeria, Infection, Genetics, and Evolution, 8

Jezek, 1988, Human monkeypox: secondary attack rates, Bull World Health Organ, 66, 465

Monroe, 2015, Collection and utilization of animal carcasses associated with zoonotic disease in Tshuapa District, the Democratic Republic of the Congo, 2012, J Wildl Dis, 734

Yinka-Ogunleye, 2019, Outbreak of human monkeypox in Nigeria in 2017–18: a clinical and epidemiological report, Lancet Infect Dis, 19, 872, 10.1016/S1473-3099(19)30294-4

Erez, 2019, Diagnosis of imported monkeypox, Israel, 2018, Emerg Infect Dis, 980

Vaughan, 2018, Two cases of monkeypox imported to the United Kingdom, September 2018, Euro Surveill, 10.2807/1560-7917.ES.2018.23.38.1800509

Ng, 2019, A case of imported monkeypox in Singapore, Lancet Infect Dis, 19, 1166, 10.1016/S1473-3099(19)30537-7

Arita, 1968, Smallpox and monkeypox in non-human primates, Bull World Health Organ, 39, 277

von Magnus, 1959, A pox-like disease in cynomolgus monkeys, Acta Pathol Microbiol Scand, 156

Milhaud, 1969, Analyse dʼun cas de variole du singe (monkeypox) chez le chimpanzé (Pan troglogdytes), Experimentation Animale, 121

Reed, 2004, The detection of monkeypox in humans in the Western Hemisphere, N Engl J Med, 350, 342, 10.1056/NEJMoa032299

Vaughan, 2020, Human-to-human transmission of monkeypox virus, United Kingdom, October 2018, Emerg Infect Dis, 782

National Centre for Disease Control

Gao, 2018, Genome sequences of Akhmeta virus, an early divergent Old World Orthopoxvirus, Viruses, 10, 252, 10.3390/v10050252

Tcherepanov, 2006, Genome Annotation Transfer Utility (GATU): rapid annotation of viral genomes using a closely related reference genome, BMC Genomics, 7, 150, 10.1186/1471-2164-7-150

Bolger, 2014, Trimmomatic: a flexible trimmer for Illumina sequence data, Bioinformatics, 30, 2114, 10.1093/bioinformatics/btu170

Cohen-Gihon, 2020, Identification and whole-genome sequencing of a Monkeypox virus strain isolated in Israel, Microbiol Resour Announc, 10.1128/MRA.01524-19

Katoh, 2013, MAFFT multiple sequence alignment software version 7: improvements in performance and usability, Mol Biol Evol, 30, 772, 10.1093/molbev/mst010

Huelsenbeck, 2001, MRBAYES: Bayesian inference of phylogenetic trees, Bioinformatics, 17, 754, 10.1093/bioinformatics/17.8.754

Leigh, 2015, popart: full-feature software for haplotype network construction, Methods Ecol Evol, 6, 1110, 10.1111/2041-210X.12410

Kugelman, 2014, Genomic variability of monkeypox virus among humans, Democratic Republic of the Congo, Emerg Infect Dis, 20, 232, 10.3201/eid2002.130118

Adeola, 1992, Importance of wild animals and their parts in the culture, religious festivals, and traditional medicine, of Nigeria, 125

Afolayan, 2009, Erectile dysfunction management options in Nigeria, J Sex Med, 6, 1090, 10.1111/j.1743-6109.2008.01064.x

Soewu, 2008, Wild animals in ethnozoological practices among the Yorubas of southwestern Nigeria and the implications for biodiversity conservation, Afr J Agric Res, 421

Friant, 2015, Drivers of bushmeat hunting and perceptions of zoonoses in Nigerian hunting communities, PLoS Negl Trop Dis, 10.1371/journal.pntd.0003792

Luiselli, 2003, Seasonal incidence, sex-ratio, and population cohorts of hinge-back tortoises (genus Kinixys) in the wild and in bush-meat markets of the Niger Delta, southern Nigeria: are human predation effects random?, Revue d’écologie, 243

Silenou, 2020, Use of surveillance outbreak response management and analysis system for human monkeypox outbreak, Nigeria, 2017-2019, Emerg Infect Dis, 345

Jelinek, 2002, Cluster of African trypanosomiasis in travelers to Tanzanian national parks, Emerg Infect Dis, 8, 634, 10.3201/eid0806.010432

Leder K, 2009, Travelers as a sentinel population: use of sentinel networks to inform pretravel and posttravel evaluation., Curr Infect Dis Rep, 51–8

Thông tin
Thông tin xuất bản

Journal of Infectious Diseases

Tập 225 Số 8

1367-1376

Thông tin tác giả