Xuất Khẩu Virus Đậu Mùa Khỉ Từ Lục Địa Châu Phi
Tóm tắt
Đợt bùng phát đậu mùa khỉ lớn nhất ở Tây Phi bắt đầu vào tháng 9 năm 2017, tại Nigeria. Bốn cá nhân từ Nigeria đến Vương quốc Anh (n = 2), Israel (n = 1) và Singapore (n = 1) đã trở thành những trường hợp đậu mùa khỉ đầu tiên được xuất khẩu từ châu Phi, và một sự kiện lây truyền nosocomial liên quan ở Vương quốc Anh đã trở thành sự kiện lây truyền đậu mùa khỉ từ người sang người đầu tiên được xác nhận ngoài châu Phi.
Dữ liệu dịch tễ học và phân tử của các trường hợp xuất khẩu và Nigeria được phân tích phối hợp để hiểu rõ hơn về các vụ xuất khẩu trong bối cảnh thời gian và địa lý của đợt bùng phát.
Các mẫu từ tất cả những người du lịch và một trường hợp ở Bayelsa chia sẻ tổ tiên chung gần nhất và đã di chuyển đến các tiểu bang Bayelsa, Delta hoặc Rivers. Biến thể di truyền cho cụm này thấp hơn mức dự kiến từ một mẫu ngẫu nhiên các bộ gen từ đợt bùng phát này, nhưng dữ liệu không hỗ trợ các liên kết trực tiếp giữa những người du lịch.
Sự đơn dòng của các trường hợp xuất khẩu và mẫu Bayelsa, cùng với các mức độ biến đổi di truyền trung gian, gợi ý rằng một nhóm nhỏ các mẫu tương quan có thể là nguồn gốc khả thi cho các trường hợp lây nhiễm xuất khẩu. Điều này có thể là kết quả của mức độ biến thể di truyền hiện có trong các mẫu đậu mùa khỉ lưu hành trong khu vực liền kề của các tiểu bang Bayelsa, Delta và Rivers, hoặc một nguồn ở mức độ hạn chế khác, nhưng chưa được xác định.
Từ khóa
Tài liệu tham khảo
Ladnyj, 1972, A human infection caused by monkeypox virus in Basankusu Territory, Democratic Republic of the Congo, Bull World Health Organ, 46, 593
World Health Organization
Doty, 2017, Assessing Monkeypox virus prevalence in small mammals at the human-animal interface in the Democratic Republic of the Congo, Viruses, 9:283
Essbauer, 2007, Genus Orthopoxvirus: Monkeypox virus, 65
Learned, 2005, Extended interhuman transmission of monkeypox in a hospital community in the Republic of the Congo. Am J Trop Med Hyg 2003, 428
Nolen, 2016, Extended human-to-human transmission during a monkeypox outbreak in the Democratic Republic of the Congo, Emerg Infect Dis, 22, 1014, 10.3201/eid2206.150579
Nakazawa, 2015, A phylogeographic investigation of African monkeypox, Viruses, 7, 2168, 10.3390/v7042168
Sadeuh-Mba, 2019, Monkeypox virus phylogenetic similarities between a human case detected in Cameroon in 2018 and the 2017–2018 outbreak in Nigeria, Infection, Genetics, and Evolution, 8
Jezek, 1988, Human monkeypox: secondary attack rates, Bull World Health Organ, 66, 465
Monroe, 2015, Collection and utilization of animal carcasses associated with zoonotic disease in Tshuapa District, the Democratic Republic of the Congo, 2012, J Wildl Dis, 734
Yinka-Ogunleye, 2019, Outbreak of human monkeypox in Nigeria in 2017–18: a clinical and epidemiological report, Lancet Infect Dis, 19, 872, 10.1016/S1473-3099(19)30294-4
Erez, 2019, Diagnosis of imported monkeypox, Israel, 2018, Emerg Infect Dis, 980
Vaughan, 2018, Two cases of monkeypox imported to the United Kingdom, September 2018, Euro Surveill, 10.2807/1560-7917.ES.2018.23.38.1800509
Ng, 2019, A case of imported monkeypox in Singapore, Lancet Infect Dis, 19, 1166, 10.1016/S1473-3099(19)30537-7
Arita, 1968, Smallpox and monkeypox in non-human primates, Bull World Health Organ, 39, 277
von Magnus, 1959, A pox-like disease in cynomolgus monkeys, Acta Pathol Microbiol Scand, 156
Milhaud, 1969, Analyse dʼun cas de variole du singe (monkeypox) chez le chimpanzé (Pan troglogdytes), Experimentation Animale, 121
Reed, 2004, The detection of monkeypox in humans in the Western Hemisphere, N Engl J Med, 350, 342, 10.1056/NEJMoa032299
Vaughan, 2020, Human-to-human transmission of monkeypox virus, United Kingdom, October 2018, Emerg Infect Dis, 782
National Centre for Disease Control
Gao, 2018, Genome sequences of Akhmeta virus, an early divergent Old World Orthopoxvirus, Viruses, 10, 252, 10.3390/v10050252
Tcherepanov, 2006, Genome Annotation Transfer Utility (GATU): rapid annotation of viral genomes using a closely related reference genome, BMC Genomics, 7, 150, 10.1186/1471-2164-7-150
Bolger, 2014, Trimmomatic: a flexible trimmer for Illumina sequence data, Bioinformatics, 30, 2114, 10.1093/bioinformatics/btu170
Cohen-Gihon, 2020, Identification and whole-genome sequencing of a Monkeypox virus strain isolated in Israel, Microbiol Resour Announc, 10.1128/MRA.01524-19
Katoh, 2013, MAFFT multiple sequence alignment software version 7: improvements in performance and usability, Mol Biol Evol, 30, 772, 10.1093/molbev/mst010
Huelsenbeck, 2001, MRBAYES: Bayesian inference of phylogenetic trees, Bioinformatics, 17, 754, 10.1093/bioinformatics/17.8.754
Leigh, 2015, popart: full-feature software for haplotype network construction, Methods Ecol Evol, 6, 1110, 10.1111/2041-210X.12410
Kugelman, 2014, Genomic variability of monkeypox virus among humans, Democratic Republic of the Congo, Emerg Infect Dis, 20, 232, 10.3201/eid2002.130118
Adeola, 1992, Importance of wild animals and their parts in the culture, religious festivals, and traditional medicine, of Nigeria, 125
Afolayan, 2009, Erectile dysfunction management options in Nigeria, J Sex Med, 6, 1090, 10.1111/j.1743-6109.2008.01064.x
Soewu, 2008, Wild animals in ethnozoological practices among the Yorubas of southwestern Nigeria and the implications for biodiversity conservation, Afr J Agric Res, 421
Friant, 2015, Drivers of bushmeat hunting and perceptions of zoonoses in Nigerian hunting communities, PLoS Negl Trop Dis, 10.1371/journal.pntd.0003792
Luiselli, 2003, Seasonal incidence, sex-ratio, and population cohorts of hinge-back tortoises (genus Kinixys) in the wild and in bush-meat markets of the Niger Delta, southern Nigeria: are human predation effects random?, Revue d’écologie, 243
Silenou, 2020, Use of surveillance outbreak response management and analysis system for human monkeypox outbreak, Nigeria, 2017-2019, Emerg Infect Dis, 345
Jelinek, 2002, Cluster of African trypanosomiasis in travelers to Tanzanian national parks, Emerg Infect Dis, 8, 634, 10.3201/eid0806.010432
Leder K, 2009, Travelers as a sentinel population: use of sentinel networks to inform pretravel and posttravel evaluation., Curr Infect Dis Rep, 51–8