Sự tiến hóa của các gen NS của virus cúm A. I. Mối quan hệ di truyền của các gen NS của virus cúm động vật

Virus Genes - Tập 4 - Trang 5-13 - 1990
Katsuhisa Nakajima1, Eri Nobusawa1, Takashi Ogawa2, Setsuko Nakajima3
1Institute of Medical Science, Tokyo, Japan
2National Institute of Animal Health, Ibaraki, Japan.
3Institute of Public Health, Tokyo, Japan

Tóm tắt

Chúng tôi đã so sánh các trình tự nucleotide của các gen NS của 13 virus cúm động vật thuộc về virus người, lợn, gia cầm, và ngựa để nghiên cứu mối liên quan di truyền của các gen NS trong virus cúm động vật. Các gen NS của ba chủng virus A/gà/Brescia/02, A/ngựa/Prague/56, và A/ngựa/Miami/63 đã được giải trình tự mới. Tần số đồng nhất của trình tự nucleotide giữa các gen NS của virus gia cầm, người, lợn, và virus A/ngựa/Miami/63 đạt 87,8% trở lên. Mặt khác, trình tự nucleotide của gen NS của virus A/ngựa/Prague/56 khác biệt rõ rệt so với các virus khác được phân tích trong nghiên cứu này. Chúng tôi đã xây dựng một mô hình cây di truyền của các gen NS của virus cúm gia cầm và ngựa bằng phương pháp Farris đã được sửa đổi. Để so sánh các gen NS giữa virus người và virus gia cầm, chúng tôi đã ước tính tốc độ thay thế nucleotide của các gen NS virus cúm gia cầm. Tốc độ này có phần ổn định, mặc dù các biến đổi không xảy ra theo trình tự. Tốc độ thay thế nucleotide của các gen NS của virus cúm gia cầm chỉ bằng một phần ba đến một phần tư so với virus cúm người. Chúng tôi suy luận thời gian phân tách giữa các gen NS của virus cúm người và virus cúm gia cầm trong quá trình tiến hóa.

Từ khóa

#virus cúm #gen NS #mối liên quan di truyền #cúm gia cầm #cúm ngựa

Tài liệu tham khảo

Tateno Y., Masatoshi N. and Tajima F., J Mol Evol 18, 387–404, 1982. Baez M., Taussig R., Zarza J.J., Young J.F., Palese P., Reisfield A. and Skalka A.M., Nucl Acids Res 8, 5845–5858, 1980. Nakajima K., Nobusawa E., Ogawa T. and Nakajima S., Virology 158, 465–468, 1987. Gammelin M., Mandler J. and Scholtissek C., Virology 170, 71–80, 1989. Buonagurio D.A., Nakada S., Parvin J.D., Krystal M., Palese P. and Fitch W.M., Science 232, 980–982, 1986. Nakajima S., Nakajima K., Takeuchi Y. and Sugiura A., J Infect Dis 142, 492–502, 1980. Porter A.G., Smith J.C. and Emtage J.S., Proc Natl Acad Sci USA 77, 1857–1861, 1980. Baez M., Zarza J.J., Elliot R.M., Young J.F. and Palese P., Virology 113, 397–402, 1981. Krystal M., Buonagurio D., Young J.F. and Palese P., J Virol 45, 547–554, 1983. Lamb R.A. and Lai C-J., Cell 21, 475–485, 1980. Nakajima K., Nobusawa E. and Nakajima S., Virology 139, 194–198, 1984. Easterday B.C. in Kilbourne E.D. (ed.) The Influenza Viruses and Influenza. Academic Press, New York, 1976, pp. 449–482. McQueen J.L., Steele J.H. and Robinson R.Q., Adv Veter Sci 12, 285–336, 1968. Kaplan M.M., Bull World Health Org 41, 485–486, 1969. Desselberger U., Nakajima K., Alfino P., Pederson F.S., Haseltin W.A., Hannoun C. and Palese P., Proc Natl Acad Sci USA 75, 3341–3345, 1978. Sriram G., Bean W.J.J., Hinshaw V.S. and Webster R.G., Virology 105, 592–599, 1980.