Epigenetic Drift, Epigenetic Clocks and Cancer Risk

Epigenomics - Tập 8 Số 5 - Trang 705-719 - 2016
Shiqing Zheng1,2, Martin Widschwendter3, Andrew E. Teschendorff1,3,4
1CAS Key Lab of Computational Biology, CAS-MPG Partner Institute for Computational Biology, Shanghai Institute for Biological Sciences, Chinese Academy of Sciences, Shanghai 200031, China
2University of Chinese Academy of Sciences, 19A Yuquan Road, Beijing 100049, China
3Department of Women's Cancer, University College London, 74 Huntley Street, London, WC1E 6AU, UK
4Statistical Cancer Genomics, UCL Cancer Institute, University College London, 72 Huntley Street, London, WC1E 6BT, UK

Tóm tắt

Từ khóa


Tài liệu tham khảo

10.1038/nature09230

10.1038/nature08514

10.1101/gad.2037511

10.1038/ng.298

10.1038/nature12433

10.1038/nature05918

10.1038/nmeth.1906

10.1038/ng.2418

Horsthemke B . Epimutations in human disease . Curr. Top. Microbiol. Immunol.310 , 45 – 59 ( 2006 ).

10.1038/ng.2442

10.1038/nrg1748

10.1016/j.tig.2008.01.006

10.1038/nbt1010-1026

10.1038/nrg3000

10.1016/j.ygyno.2012.09.027

10.1038/nrg3142

10.1073/pnas.0806560105

10.1038/nrg2045

10.1093/hmg/ddt375

Ahuja N , IssaJP . Aging, methylation and cancer . Histol. Histopathol.15 ( 3 ), 835 – 842 ( 2000 ).

Ahuja N , LiQ , MohanAL , BaylinSB , IssaJP . Aging and DNA methylation in colorectal mucosa and cancer . Cancer Res.58 ( 23 ), 5489 – 5494 ( 1998 ).

10.1073/pnas.0500398102

10.1371/journal.pgen.1000602

10.1101/gr.096826.109

10.1101/gr.103606.109

10.1101/gr.103101.109

10.1073/pnas.1120658109

10.1186/gb-2013-14-9-r102

10.1038/srep01630

10.1186/gb-2012-13-10-r97

10.1111/j.1474-9726.2009.00535.x

10.1016/j.stem.2013.01.017

10.1182/blood-2011-01-331926

10.1016/j.molcel.2012.10.016

10.1371/journal.pone.0014821

10.1186/gb-2013-14-10-r115

10.18632/aging.100395

10.1152/physrev.00026.2007

10.1016/j.forsciint.2010.07.010

10.1016/j.cub.2010.10.022

10.1016/j.mrfmmm.2011.08.003

10.1186/gb-2014-15-2-r24

10.1038/ng.2271

10.1038/ng.2270

10.1038/ng.3441

10.1093/bioinformatics/btp073

10.1371/journal.pgen.1005334

10.1371/journal.pone.0008274

10.1186/1471-2105-13-86

10.1073/pnas.1412759111

10.1371/journal.pone.0119201

10.1093/infdis/jiv277

10.1111/acel.12325

10.1093/ije/dyu277

10.1186/s13059-015-0649-6

10.18632/aging.100809

10.1186/s13059-015-0584-6

10.1186/gm323

10.1172/JCI69735

10.1371/journal.pone.0063812

10.1097/EDE.0b013e31829d5cb3

10.1001/jamaoncol.2015.1053

10.1186/s13148-015-0148-3

10.1289/ehp.1409020

10.1002/ijc.29537

10.1186/gm567

10.1371/journal.pgen.1000971

10.1186/s13059-015-0644-y

Ronn T , VolkovP , GillbergLet al. Impact of age, BMI and HbA1c levels on the genome-wide DNA methylation and mRNA expression patterns in human adipose tissue and identification of epigenetic biomarkers in blood . Hum. Mol. Genet.24 ( 13 ), 3792 – 3813 ( 2015 ).

10.1016/S0140-6736(13)62674-4

10.1126/scitranslmed.3001262

10.1101/gr.138347.112

10.1038/ng.897

Issa JP , AhujaN , ToyotaM , BronnerMP , BrentnallTA . Accelerated age-related CpG island methylation in ulcerative colitis . Cancer Res.61 ( 9 ), 3573 – 3577 ( 2001 ).

10.3389/fgene.2012.00054

10.1093/jnci/dju161

10.1371/journal.pone.0043840

10.1073/pnas.1121249109

10.1101/gr.157743.113

10.1158/0008-5472.CAN-08-1957

10.1016/j.cell.2006.02.043

10.1038/ng1941

10.1038/ng1972

10.1038/ng1950

10.1016/S0140-6736(05)67063-8

10.1093/hmg/ddq122

10.1016/j.cell.2012.01.003

10.1007/s12015-007-9000-2

10.1093/jnci/djt045

10.1186/s13148-015-0104-2

10.1007/s10549-014-3209-y

10.1158/1055-9965.EPI-15-0198

10.1073/pnas.1000834107

10.1101/gr.157529.113

10.1007/s12016-009-8169-3

10.1007/s11357-014-9648-x

10.1371/journal.pgen.1004996

10.3390/nu7115467

10.1186/gb-2013-14-5-r42

10.1101/gr.125187.111

10.1073/pnas.1307242110

10.18632/aging.100610

10.1056/NEJMoa1409405

10.1016/j.stem.2015.05.002

10.1038/sj.bjc.6604259

10.1038/nrc1799

10.1371/journal.pmed.1001551

10.1186/s13073-015-0209-4

10.1093/ije/dyi201

10.1186/gb-2012-13-10-172

10.4161/epi.29024

10.1073/pnas.1221068110

10.1126/science.1260825

10.1093/carcin/bgs006

10.1007/978-1-60327-530-9_5

10.1038/ng.865

10.1073/pnas.0906183107

10.1111/joim.12224

10.1038/ncomms6195

10.1073/pnas.0810276106

10.1038/ng0406-402

10.1371/journal.pcbi.1003709

10.1016/j.ccell.2014.10.012

10.1016/j.ccell.2015.07.012

10.1016/S1521-6616(03)00203-1

10.4161/epi.28575

10.1186/gm419

10.1093/carcin/bgt391

10.1038/nature14248