Phát hiện và sự xuất hiện của virus đốm vàng trên dưa ở Ecuador: một mối đe dọa mới đối với sản xuất cây có hoa quả thuộc họ bầu bí trong khu vực

Springer Science and Business Media LLC - Tập 140 - Trang 193-197 - 2014
D. F. Quito-Avila1,2, E.L. Peralta1, R.R. Martin3, M.A. Ibarra1, R.A. Alvarez1, A. Mendoza4, M. Insuasti4, J. Ochoa4
1Escuela Superior Politecnica del Litoral, Centro de Investigaciones Biotecnologicas del Ecuador, CIBE-ESPOL, Guayaquil, Ecuador
2Programa Prometeo, Secretaria Nacional de Educacion Superior, Ciencia, Tecnologia e Innovacion, Quito, Ecuador
3USDA-ARS, Horticultural Crops Research Unit, Corvallis, Oregon
4Instituto Nacional Autonomo de Investigaciones Agropecuarias, INIAP, Quito, Ecuador

Tóm tắt

Hơn năm mươi loại virus đã được báo cáo trên các cây họ bầu bí trên toàn thế giới. Tại Ecuador, khoảng 3.000 ha dưa hấu, dưa vàng và dưa chuột được trồng hàng năm, nhưng có rất ít nghiên cứu nhằm xác định các virus chịu trách nhiệm cho các dịch bệnh. Trong nghiên cứu này, việc giải trình tự RNA hai mạch (dsRNA) được chiết xuất từ lá dưa hấu và dưa vàng có triệu chứng giống virus đã phát hiện sự hiện diện của virus đốm vàng dưa (MYSV, họ Tospovirus) và virus endornavirus Cucumis melo (CmEV) được mô tả một phần. Các mồi đặc hiệu, được thiết kế để phát hiện từng loại virus, cho thấy MYSV có mặt trong 40, 64 và 67 % các mẫu dưa hấu, dưa chuột và dưa vàng có triệu chứng tương ứng. Đối với CmEV, 95 % cả cây dưa vàng có triệu chứng và không có triệu chứng đều cho kết quả dương tính. Tuy nhiên, virus không được phát hiện ở dưa hấu hay dưa chuột. Các so sánh chuỗi cho thấy độ tương đồng nucleotide là 97 % và 94 % đối với protein polymase và protein nucleocapsid, tương ứng, giữa MYSV ở Ecuador và MYSV được báo cáo từ Nhật Bản. Đến thời điểm hiện tại, đây là báo cáo đầu tiên về MYSV và CmEV ở Ecuador và châu Mỹ.

Từ khóa

#virus đốm vàng dưa #MYSV #Cucumis melo endornavirus #Ecuador #sản xuất cây họ bầu bí

Tài liệu tham khảo

Brown, J. K., Idris, A. M., Torres-Jerez, I., Banks, G. K., & Wyatt, S. D. (2001). The core region of the coat protein gene is highly useful for establishing the provisional identification and classification of begomoviruses. Archives of Virology, 146, 1581–1598. Coutts, R. H. A. (2005). First report of an endornavirus in the Cucurbitaceae. Virus Genes, 31, 361–362. Espinoza, L., Jama, M., Álvarez, R., Paredes, J., & Peralta, E. L. (2010). Determinacion de generos y especies virales que se encuentran afectando a las cucurbitaceas en la zona de pedro carbo, provincia del Guayas. Revista Tecnológica Espol, 23, 33–40. Froussard, P. (1992). A random-PCR method (rPCR) to construct whole cDNA library from low amounts of RNA. Nucleic Acids Research, 20, 2900. Gu, Q. S., Wu, H. J., Chen, H. Y., Zhang, X. J., Wu, M. Z., Wang, D. M., et al. (2012). Melon yellow spot virus identified in china for the first time. New Disease Reports, 25, 7. Halgren, A., Tzanetakis, I. E., & Martin, R. R. (2007). Identification, characterization, and detection of black raspberry necrosis virus. Phytopathology, 97, 44–50. Kato, K., Hanada, K., & Kameya-Iwaki, M. (2000). Melon yellow spot virus: a distinct species of the genus tospovirus isolated from melon. Phytopathology, 90, 422–426. Lecoq, H., & Desbiez, C. (2012). Viruses of cucurbit crops in the Mediterranean region: an ever-changing picture. Advances in Virus Research, 84, 67–126. Lecoq, H., Wisler, G., & Pitrat, M. (1998). Cucurbit viruses: the classics and the emerging. (In: McCreight J.D. (Ed.). Cucurbitaceae 98, evaluation and enhancement of cucurbit germplasm, (pp. 126–142). ASHS Press, Alexandria, VA, USA). Morris, T. J., & Dodds, J. A. (1979). Isolation and analysis of double-stranded RNA from virus-infected plant and fungal tissue. Phytopathology, 69, 854–858. Peng, J. C., Yeh, S. D., Huang, L. H., Li, J. T., Cheng, Y. F., & Chen, T. C. (2011). Emerging threat of thrips-borne melon yellow spot virus on melon and watermelon in Taiwan. European Journal of Plant Pathology, 130, 205–214. Romay, G., Lecoq, H., Geraud-Pouey, F., Chirinos, D. T., & Desbiez, C. (2014). Current status of cucurbit viruses in Venezuela and characterization of Venezuelan isolates of zucchini yellow mosaic virus. Plant Pathology, 63, 78–87. Zheng, L., Wayper, P. J., Gibbs, A. J., Fourment, M., Rodoni, B. C., & Gibbs, M. J. (2008). Accumulating variation at conserved sites in Potyvirus genomes is driven by species discovery and affects degenerate primer design. PLoS ONE, 3, e1586. Zitter, T. A., Hopkins, D. L., & Thomas, C. E. (1996). Compendium of cucurbit diseases. MN: APS Press St. Paul.