Nghiên cứu QSAR dựa trên DFT về alkanol và alkanthiol sử dụng mô hình liên tục phân cực giống như dẫn điện (CPCM)

Journal of Molecular Modeling - Tập 15 - Trang 1509-1515 - 2009
Khaled Azizi1, Mohammad Ali Safarpour2, Maryam Keykhaee1, Ahmad Reza Mehdipour3
1Faculty of Science, University of Kurdistan Department of Chemistry, University of Kurdistan, Sanandaj, Iran
2Department of Physical Chemistry, Faculty of Chemistry, Iran University of Science and Technology (IUST), Tehran, Iran
3Medicinal and Natural Product Chemistry Research Center, Shiraz University of Medicinal Sciences, Shiraz, Iran

Tóm tắt

Tính hữu ích của phương pháp CPCM, được tính toán ở cấp độ lý thuyết DFT sử dụng tập hợp cơ sở 6-311++G** trong nghiên cứu QSAR về hoạt tính gây mê của alkanol(thiol) đã được kiểm tra. Ba loại mô tả phân tử bao gồm AIM, hóa học và hóa học lượng tử đã được sử dụng để mô hình hóa mối quan hệ giữa hoạt tính gây mê và các đặc điểm cấu trúc. Phân tích hồi quy tuyến tính đa biến đã được thực hiện để mô hình hóa mối quan hệ giữa các mô tả phân tử và hoạt tính sinh học của các phân tử này bằng cách sử dụng phương pháp từng bước như một công cụ chọn biến. Một phương trình đa tham số chứa bốn mô tả với các đặc tính thống kê tốt đã được thu được thông qua hồi quy tuyến tính đa biến (MLR) sử dụng phương pháp từng bước.

Từ khóa

#CPCM #DFT #QSAR #alkanol #alkanthiol #hồi quy tuyến tính đa biến

Tài liệu tham khảo

Takano Y, Houk HN (2005) Chem Theory Comput 1:70–77 Cossi M, Rega N, Scalmani G, Barone V (2003) J Comput Chem 24:669–681 Barone V, Cossi M (1998) J Phys Chem 102:1995–2001 Safarpour MA, Hemmateenejad B, Miri R, Jamali M (2003) QSAR Comb Sci 22:997–1005 Hemmateenejad B, Safarpour MA, Miri R, Taghavi F (2004) J Comput Chem 25:1495–1503 Hemmateenejad B, Safarpour MA, Taghavi F (2003) THEOCHEM 635:183–190 Putta S, Eksterowicz J, Lemmen C, Stanton R (2003) J Chem Inf Comput Sci 43:1623–1635 Todeschini R, Consonni V (2000) Handbook of Molecular Descriptors. Wiley, Weinheim Horvath D, Mao B (2003) QSAR Comb Sci 22:498–509 Carbo-Dorca R, Amat L, Besaqlu E, Girones X, Robert D (2000) THEOCHEM 504:181–228 Karelson M, Lobanov VS, Katritzky AR (1996) Chem Rev 96:1027–1044 Thanikaivelan P, Subramanian V, Rao JR, Nair BU (2000) Chem Phys Lett 323:59–70 Par RG, Yang W (1989) In: Density-functional theory of atoms and molecules. Oxford Univ Press, Oxford, pp 47–69 Bernardi F, Bottoni A, Garavelli M (2002) Quant Struct Act Relat 21:128–148 Sulpizi M, Folkers G, Rothlisberger U, Carloni P, Scapozza L (2002) Quant Struct Act Relat 21:173–181 Chermette H (1999) J Comput Chem 20:129–154 Geerlings P, De Proft F, Langenaeker W (2003) Chem Rev 103:1793–1874 Chattaraj PK, Nath S, Maiti B (2003) Reactivity descriptors. In: Tollenaere J, Bultinck P, Winter HD, Langenaeker W (eds) Computational medicinal chemistry and drug discovery. Dekker, New York, pp 295–322 Bader RFW (1990) Atoms in molecules: A quantum theory. Oxford Univ Press, Oxford, pp 179–195 Eger EI II, Ionescu P, Laster MJ, Gong D, Hudlicky T, Kendig JJ, Harris RA, Trudell JR, Pohorille A (1999) Anesth Analg 88:867–876 Fang Z, Ionescu P, Chortkoff BS, Kandel L, Sonner J, Laster MJ, Edmond EI II (1997) Anesth Analg 84:1042–1048 Zhang Y, Trudell JR, Mascia MP, Laster MJ, Gong DH, Harris RA, Eger EI II (2000) Anesth Analg 91:1294–1299 Frisch MJ, Trucks GW, Schlegel HB, Scuseria GE, Robb MA, Cheeseman JR, Zakrzewski VG, Montgomery JA Jr, Stratmann RE, Burant JC, Dapprich S, Millam JM, Daniels AD, Kudin KN, Strain MC, Farkas O, Tomasi J, Barone V, Cossi M, Cammi R, Mennucci B, Pomelli C, Adamo C, Clifford S, Ochterski J, Petersson GA, Ayala PY, Cui Q, Morokuma K, Malick DK, Rabuck AD, Raghavachari K, Foresman JB, Cioslowski J, Ortiz JV, Baboul AG, Stefanov BB, Liu G, Liashenko A, Piskorz P, Komaromi I, Gomperts R, Martin RL, Fox DJ, Keith T, Al-Laham MA, Peng CY, Nanayakkara A, Gonzalez C, Challacombe M, Gill PMW, Johnson B, Chen W, Wong WM, Andres JL, Gonzalez C, Head–Gordon M, Replogle ES, Pople JA (1998) Gaussian 98, Revision A.7. Gaussian Inc, Pittsburgh, PA Becke AD (1993) J Chem Phys 98:5648–5652 Lee C, Yang W, Parr RG (1988) Phys Rev 37:785–789 Mulliken RS (1955) J Chem Phys 23:1833–1840 Reed AE, Weinhold F (1983) J Chem Phys 78:4066–4073 Levine IN (2000) Quantum Chemistry, 5th ed. Prentice Hall, Upper Saddle River, NJ 07458:508–509 Version 7 (2005), Mathwork Inc, http://www.mathworks.com, USA Topliss JG, Costello RJ (1972) J Med Chem 15:1066–1068 Salt DW, Ajmani S, Crichton R, Livingstone D (2007) J Chem Inf Comput Sci 47:143–149 Kubinyi H, Hamprecht FA, Mietzner T (1998) J Med Chem 41:2553–2564 Mehdipour AR, Hemmateenejad B, Miri R (2007) Chem Biol Drug Des 69:362
Thông tin
Thông tin xuất bản

Journal of Molecular Modeling

Tập 15

1509-1515

Thông tin tác giả