Alan J. Simmons1,2, Amrita Banerjee1,2, Eliot T. McKinley3,2, Cherie’ R. Scurrah1,2, Charles A. Herring4,2, Leslie Gewin1,3,5, Ryota Masuzaki6, Seth J. Karp6, Jeffrey L. Franklin1,2, Michael J. Gerdes7, Jonathan M. Irish8, Robert J. Coffey1,3,2,5, Ken S. Lau1,4,2
1Department of Cell and Developmental Biology, Vanderbilt University Medical Center, Nashville, TN, USA
2Epithelial Biology Center, Vanderbilt University Medical Center, Nashville, TN, USA
3Department of Medicine, Vanderbilt University Medical Center, Nashville, TN USA.
4Department of Chemical and Physical Biology Vanderbilt University Medical Center Nashville TN USA
5Veterans Affairs Medical Center, Tennessee Valley Healthcare System, Nashville, TN, USA
6The Transplant Center and Department of Surgery Vanderbilt University Medical Center Nashville TN USA
7Life Sciences Division GE Global Research Niskayuna NY USA
8Departments of Cancer Biology, and Pathology, Microbiology and Immunology Vanderbilt University Medical Center Nashville TN USA
Tóm tắt
Tóm tắtHiểu biết về hành vi tế bào heterogene trong một mô phức tạp yêu cầu đánh giá các mạng lưới tín hiệu tại độ phân giải tế bào đơn lẻ. Tuy nhiên, việc khảo sát tín hiệu trong các mô biểu mô bằng cách phân tích tế bào đơn lẻ dựa trên lưu lượng kế đã bị làm phức tạp bởi sự cần thiết phải phân tách tế bào đơn lẻ, trong đó việc phá vỡ mối liên kết tế bào - tế bào vô tình làm xáo trộn các trạng thái tín hiệu tế bào bản địa. Tại đây, chúng tôi trình bày một chiến lược mới (Tháo rời để Tín hiệu Nội bào trong Tế bào Biểu mô Đơn lẻ từ Mô—DISSECT) giúp bảo tồn tín hiệu bản địa cho các ứng dụng Lưu lượng kế Thời gian bay (CyTOF) và lưu lượng kế huỳnh quang. Một phân tích 21-plex CyTOF bao gồm các dấu hiệu tín hiệu cốt lõi và dấu hiệu nhận dạng tế bào đã được thực hiện trên biểu mô ruột non sau khi kích thích yếu tố hoại tử khối u alpha toàn thân (TNF‐α). Các phân tích không giám sát và có giám sát đã chọn một cách mạnh mẽ các đặc điểm tín hiệu xác định một tập hợp tế bào biểu mô độc đáo nhạy cảm với sự apoptosis do TNF‐α gây ra trong quần thể tế bào ruột mảnh nhìn như đồng nhất. Cụ thể, p‐ERK và sự apoptosis được điều hòa khác biệt trong các tế bào ruột lân cận trong biểu mô, cho thấy một cơ chế sống phụ thuộc vào tiếp xúc. Phương pháp tế bào đơn lẻ mới của chúng tôi có thể được áp dụng rộng rãi, sử dụng cả CyTOF và lưu lượng kế đa tham số, để điều tra các trạng thái tế bào bình thường và bệnh tật trong nhiều loại mô biểu mô.
