Xây dựng và đặc trưng hóa các nhiễm sắc thể vòng tâm và nhiễm sắc thể thẳng không tâm trong nấm men phân khối

Current Genetics - Tập 18 - Trang 323-330 - 1990
Tomohiro Matsumoto1, Shin Murakami1, Osami Niwa1, Mitsuhiro Yanagida1
1Department of Biophysics, Faculty of Science, Kyoto University, Kyoto, Japan

Tóm tắt

Việc làm gián đoạn gen và sửa chữa khoảng trống của DNA nhiễm sắc thể đã trở thành những kỹ thuật thường được sử dụng trong di truyền học nấm men. Để mở rộng khả năng sử dụng các thao tác gen này cho các vùng gen lớn hơn, chúng tôi đã khảo sát kích thước tối đa của DNA nhiễm sắc thể bị gián đoạn hoặc sửa chữa trong điều kiện sống. Tại đây, chúng tôi báo cáo một phương pháp đơn giản, tiềm năng có thể áp dụng rộng rãi, để chọn lọc xóa bỏ một vùng rộng 150 kb, hoặc làm đầy khoảng trống 100 kb trong hệ gen của nấm men phân khối. Điều này cho phép tạo ra các nhiễm sắc thể thẳng không tâm bằng cách xóa bỏ hoặc nhân bản các DNA chức năng lớn có tâm vào các nhiễm sắc thể vòng nhỏ bằng cách làm đầy khoảng trống. Độ trung thực của việc làm đầy khoảng trống thu được rất cao, dựa trên việc lập bản đồ tiêu hóa một phần của các DNA đã sửa chữa khoảng trống. Bằng cách phân tích một loạt các nhiễm sắc thể vòng nhỏ như vậy, chúng tôi kết luận rằng chỉ một phần của vùng tâm lặp lại, bao gồm miền trung tâm, là cần thiết cho việc phân ly nhiễm sắc thể trong quá trình nguyên phân và giảm phân. Mặc dù các nhiễm sắc thể thẳng không tâm không ổn định, nhưng vẫn có thể được duy trì, cho thấy rằng có thể xây dựng một vector không tâm cho các đoạn DNA lớn trong sinh vật này.

Từ khóa

#nấm men phân khối; gián đoạn gen; sửa chữa khoảng trống; nhiễm sắc thể thẳng không tâm; nhiễm sắc thể vòng

Tài liệu tham khảo

Allshire RC, Cranston G, Gosden JR, Maule JC, Hastie ND, Fantes PA (1987) Cell 50:391–403 Burke DT, Carle GF, Olson MV (1987) Science 236:806–812 Capecchi MR (1989) TIG 5:70–76 Chikashige Y, Kinoshita N, Nakaseko Y, Matsumoto T, Murakami S, Niwa O, Yanagida M (1989) Cell 57:739–751 Clarke L, Amstutz H, Fishel B, Carbon J (1986) Proc Natl Acad Sci USA 83:8253–8257 Fan J-B, Chikashige Y, Smith CL, Niwa O, Yanagida M, Cantor CR (1988) Nucleic Acids Res 17:2801–2818 Fishel B, Amstutz H, Baum M, Carbon J, Clarke L (1988) Mol Cell Biol 8:754–763 Frohman MA, Martin GR (1989) Cell 56:145–147 Greider CW, Blackburn EH (1989) Nature 337:331–337 Hahnenberger KM, Baum MP, Polizzi CM, Carbon J, Clarke L (1989) Proc Natl Acad Sci USA 86:577–581 Heyer W-D, Sipiczki M, Kohli J (1986) Mol Cell Biol 6:80–89 Hottinger H, Pearson D, Yamao F, Gamulin V, Coolley L, Copper T, Soll D (1982) Mol Gen Genet 188:219–224 Matsumoto T, Fukui K, Niwa O, Sugawara N, Szostak JW, Yanagida M (1987) Mol Cell Biol 7:4424–4430 Murray AW, Szostak JW (1983) Cell 34:961–970 Nakaseko Y, Niwa O, Yanagida M (1984) J Bacteriol 157:334–336 Nakaseko Y, Adachi Y, Funabashi S, Niwa O, Yanagida M (1986) EMBO J 5:1011–1021 Nakaseko Y, Kinoshita N, Yanagida M (1987) Nucleic Acids Res 15:4705–4715 Niwa O, Matsumoto T, Yanagida M (1986) Mol Gen Genet 203:397–405 Niwa O, Matsumoto T, Chikashige Y, Yanagida M (1989) EMBO J 8:3045–3052 Orr-Weaver TL, Szostak JW, Rothstein RJ (1981) Proc Natl Acad Sci USA 78:6354–6358 Orr-Weaver TL, Szostak JW, Rothstein RJ (1983) Methods Enzymol 101:228–245 Pluta AF, Zakian VA (1989) Nature 337:429–433 Rothstein RJ (1983) Methods Enzymol 101:202–211 Schwartz DC, Cantor CR (1984) Cell 37:67–75 Surosky RT, Tye B-C (1985) Proc Natl Acad Sci USA 82:2106–2110 Toda T, Adachi Y, Hiraoka Y, Yanagida M (1984) Cell 37:233–242