Nội dung được dịch bởi AI, chỉ mang tính chất tham khảo
Các trình tự nucleotide đầy đủ của các đoạn gen RNA nhỏ và trung của virus Kairi (thuộc họ Bunyaviridae)
Tóm tắt
Chúng tôi đã xác định được các trình tự nucleotide hoàn chỉnh của các đoạn gen RNA nhỏ (S) và trung (M) từ một mẫu virus Kairi (KRIV) lấy từ bán đảo Yucatán của Mexico. Đoạn S gồm có 992 nucleotide, trong khi đoạn M có 4.619 nucleotide. Các phân tích phát sinh chủng loại đã được thực hiện trên mỗi đoạn gen, và các dữ liệu này sẽ được thảo luận. Một vùng dài 526 nucleotide của đoạn lớn (L) cũng đã được giải trình tự. Đây là nghiên cứu đầu tiên trình bày dữ liệu trình tự và phát sinh chủng loại cho một mẫu KRIV từ châu Mỹ Latinh.
Từ khóa
#virus Kairi #KRIV #RNA #trình tự nucleotide #phân tích phát sinh chủng loại #BunyaviridaeTài liệu tham khảo
Anderson CR, Aitken TH, Spence LP, Downs WG (1960) Kairi virus, a new virus from Trinidadian forest mosquitoes. Am J Trop Med Hyg 9:70–72
Briese T, Rambaut A, Lipkin WI (2004) Analysis of the medium (M) segment sequence of Guaroa virus and its comparison to other orthobunyaviruses. J Gen Virol 85:3071–3077
Briese T, Kapoor V, Lipkin WI (2007) Natural M-segment reassortment in Potosi and Main Drain viruses: implications for the evolution of orthobunyaviruses. Arch Virol 152:2237–2247
Calisher CH, Oro JG, Lord RD, Sabattini MS, Karabatsos N (1988) Kairi virus identified from a febrile horse in Argentina. Am J Trop Med Hyg 39:519–521
Causey OR, Causey CE, Maroja OM, Macedo DG (1961) The isolation of arthropod-borne viruses, including members of two hitherto undescribed serological groups, in the Amazon region of Brazil. Am J Trop Med Hyg 10:227–249
Dunn EF, Pritlove DC, Elliott RM (1994) The S RNA genome segments of Batai, Cache Valley, Guaroa, Kairi, Lumbo, Main Drain and Northway bunyaviruses: sequence determination and analysis. J Gen Virol 75:597–608
Elliott RM (1990) Molecular biology of the Bunyaviridae. J Gen Virol 71:501–522
Farfan-Ale JA, Lorono-Pino MA, Garcia-Rejon JE, Hovav E, Powers AM, Lin M, Dorman KS, Platt KB, Bartholomay LC, Soto V, Beaty BJ, Lanciotti RS, Blitvich BJ (2009) Detection of RNA from a Novel West Nile-like virus and high prevalence of an insect-specific flavivirus in mosquitoes in the Yucatan Peninsula of Mexico. Am J Trop Med Hyg 80:85–95
Ronquist F, Huelsenbeck JP (2003) MrBayes 3: Bayesian phylogenetic inference under mixed models. Bioinformatics 19:1572–1574
Sanmartin C, Mackenzie RB, Trapido H, Barreto P, Mullenax CH, Gutierrez E, Lesmes C (1973) Venezuelan equine encephalitis in Colombia, 1967. Bol Oficina Sanit Panam 74:108–137
Schmaljohn CS, Nichol ST (2007) Bunyaviridae. In: Knipe DM (ed) Fields virology, 5th edn. Lippincott, Williams & Wilkins, Philadelphia, pp 1741–1789
Tauro LB, Almeida FL, Contigiani MS (2009) First detection of human infection by Cache Valley and Kairi viruses (Orthobunyavirus) in Argentina. Trans R Soc Trop Med Hyg 103:197–199
Zuker M (2003) Mfold web server for nucleic acid folding and hybridization prediction. Nucleic Acids Res 31:3406–3415