Nội dung được dịch bởi AI, chỉ mang tính chất tham khảo
Phân tích cụm từ ma trận tương đồng phân tử bằng cách sử dụng mạng nơ-ron phi tuyến
Tóm tắt
Mô hình mạng nơ-ron phi tuyến được trình bày để thực hiện phân tích cụm. Nó cung cấp một thuật toán song song hiệu quả để giải quyết nhiệm vụ nhận dạng mẫu này, về mặt toán học, bản chất của nó là một bài toán tối ưu tổ hợp. Một kỹ thuật phân loại mới được thảo luận nhằm trực quan hóa các mẫu cụm trong một tập phân tử, thông qua phân tích số học của ma trận tương đồng. Như một ví dụ về ứng dụng của mô hình mạng nơ-ron đã báo cáo, một nghiên cứu về độ tương đồng phân tử lượng tử trong lĩnh vực mối quan hệ cấu trúc-hoạt tính sinh học được báo cáo. Một tập hợp phân tử gồm mười tám quinolon được sử dụng làm ví dụ. Phân phối cụm thu được cho thấy sự tương quan định tính tốt giữa dữ liệu tương đồng và hoạt tính sinh học.
Từ khóa
#mạng nơ-ron phi tuyến #phân tích cụm #ma trận tương đồng phân tử #tương đồng phân tử #cấu trúc-hoạt tính sinh họcTài liệu tham khảo
R.Carbó, M. Arnau and L. Leyda, Int. J. Quantum Chem. 7 (1980) 1185.
R. Carbó and B. Calabuig, J. Chem. Inf. Comput. Sci. 32 (1992) 600.
R. Carbó and B. Calabuig, Int. J. Quantum Chem. 42 (1992) 1681.
R. Carbó and E. Besalú, in:Molecular Similarity and Reactivity: From Quantum Chemical to Phenomenological Approaches, ed. R. Carbó (Kluwer Academic, 1995) p. 3.
E. Besalú, R. Carbó, J. Mestres and M. Solá, in:Topics in Current Chemistry 173, eds. J.D. Dunitz, K. Hafner, S. Ito, J.M. Lehn, K.N. Raymond, C.W. Rees, J. Thiem and F. Vögtle (Springer, 1995) p. 31.
A.C. Good, E.E. Hodgking and W.G. Richards, J. Chem. Inf. Comput. Sci. 32 (1992) 188.
A.C. Good, S. Sung-Sau and W.G. Richards, J. Med. Chem. 36 (1993) 433.
R. Carbó and B. Calabuig, Int. J. Quantum Chem. 42 (1992) 1695.
P. Brucker, in:Optimierung und Operations Research, Lectures Notes in Economics and Mathematical System, eds. R. Henn, B. Korte and W. Oletti (Springer, Berlin, 1978).
M.R. Garey and D.S. Johnson,Computers and Intractibility: A Guide to the Theory of NP-Completeness (Freeman, 1979).
C.H. Papadimitriou, SIAM J. Comput. 10 (1981) 542.
J.J. Hopfield and D.W. Tank, Biolog. Cybern. 52 (1985) 141.
Y. Takefuji,Neural Network Parallel Computing (Kluwer Academic, 1992).
P.M. Pardalos and J.B. Rosen, in:Lecture Notes in Computer Sciences 268, eds. G. Goss and J. Hartmanis (Springer, Berlin, 1987).
B. Llorente, N. Rivero, R. Carrasco and R.S. Martinez, Quant. Struct. Act. Relat. 13 (1994) 419.
J.J.P. Stewart, QCPE 455.
R. Carbó, B. Calabuig, E. Besalú and A. Martinez, Molec. Eng. 2 (1992) 43.
G.M. Downs and P. Willet, J. Chem. Inf. Comput. Sci. 34 (1994) 1094.