Nội dung được dịch bởi AI, chỉ mang tính chất tham khảo
Mô tả các locus microsatellites từ bạch tuộc hai đốm Octopus bimaculatus Verrill 1883 thông qua các đọc pyrosequencing
Tóm tắt
Chúng tôi đã xác định 22 locus microsatellite mới ở bạch tuộc hai đốm Octopus bimaculatus bằng cách sử dụng các đọc pyrosequencing 454. Tất cả các locus đều có tính đa hình và sẽ được sử dụng trong các nghiên cứu về tính kết nối biển nhằm tăng cường tính bền vững của nguồn tài nguyên. Số lượng alen trung bình mỗi locus là 13,09 (trong khoảng 7–19) và tính đa hình quan sát được dao động từ 0,50 đến 1,00. Bốn cặp locus có liên kết và ba locus đã lệch khỏi cân bằng Hardy–Weinberg. Mười tám và 12 locus có tính đa hình ở Octopus bimaculoides và Octopus hubbsorum, tương ứng.
Từ khóa
#bạch tuộc #microsatellite #Octopus bimaculatus #pyrosequencing #đa hình #Hardy–WeinbergTài liệu tham khảo
Alejo-Plata C, García-Guillén R, Herrera-Galindo J (2012) Octopus bimaculatus paralarvae and juvenile (Cephalopoda: Octopodidae) in the Pacific South of Mexico. Rev Biol Mar Oceanogr 47(2):359–365
Amos W, Hoffman JI, Frodsham A, Zhang L, Best S, Hill AVS (2007) Automated binning of microsatellite alleles: problems and solutions. Mol Ecol Notes 7(1):10–14. doi:10.1111/j.1471-8286.2006.01560.x
López-Rocha JA, Arellano-Martínez M, Ceballos-Vázquez BP, Velázquez-Abunader I, Castellanos-Martínez S, Torreblanca-Ramírez E (2012) Use of length-frequency analysis for growth estimation of the California two-spotted Octopus Octopus bimaculatus Verril 1883 of the Gulf of California. J Shellfish Res 31(4):1173–1181. doi:10.2983/035.031.0428
Meglécz E, Costedoat C, Dubut V, Gilles A, Malausa T, Pech N, Martin J-F (2010) QDD: a user-friendly program to select microsatellite markers and design primers from large sequencing projects. Bioinformatics 26(3):403–404. doi:10.1093/bioinformatics/btp670
Van Oosterhout C, Hutchinson WF, Wills DPM, Shipley P (2004) Micro-checker: software for identifying and correcting genotyping errors in microsatellite data. Mol Ecol Notes 4(3):535–538. doi:10.1111/j.1471-8286.2004.00684.x