Nội dung được dịch bởi AI, chỉ mang tính chất tham khảo
Đặc điểm hóa các locus vi điều hòa đa hình ở ba loài bướm đồng (Lycaena spp.)
Tóm tắt
Chi họ Lycaena được sử dụng rộng rãi trong nghiên cứu tiến hóa lịch sử sống, thích nghi địa phương, sinh học ứng phó với stress và hành vi. Hơn nữa, một số loài hiện đang suy giảm và do đó được xem là mối quan tâm về bảo tồn. Để cung cấp cơ sở phân tử cho di truyền dân số và sinh học bảo tồn, chúng tôi báo cáo sự phát triển của 36 dấu hiệu vi điều hòa cho các loài Lycaena. Các locus đã được sàng lọc ở 21 cá thể mỗi loài, sử dụng cá thể từ Greifswald, miền đông bắc Đức (L. tityrus) hoặc từ dãy Alps của Ý và Áo (L. hippothoe và L. virgaureae). Mười, mười sáu và mười locus vi điều hòa đa hình được xác định ở L. tityrus, L. hippothoe, và L. virgaureae tương ứng. Số lượng alen mỗi locus dao động từ ba đến 20 và độ hoá hợp lệ dự kiến từ 0,37 đến 0,94. Mười chín trong số 36 locus đã được khuếch đại chéo thành công ở ít nhất một loại khác, dẫn đến tổng cộng 13 locus cho L. tityrus tityrus, 14 cho L. tityrus subalpinus, 20 cho L. hippothoe và 18 cho L. virgaureae. Những dấu hiệu này sẽ hữu ích trong việc giải quyết các vấn đề di truyền dân số ở L. tityrus, L. hippothoe và L. virgaureae, và có thể cả các loài bướm đồng khác.
Từ khóa
#Lycaena #dấu hiệu vi điều hòa #di truyền dân số #bảo tồn #bướm đồngTài liệu tham khảo
Fischer K, Fiedler K (2001) Resource-based territoriality in the butterfly Lycaena hippothoe and environmentally induced behavioural shifts. Anim Behav 61:723–732. https://doi.org/10.1006/ANBE.2000.1662
Haaland C (2015) Abundances and movement of the Scarce Copper butterfly (Lycaena virgaureae) on future building sites at a settlement fringe in southern Sweden. J Insect Conserv 19:255–264. https://doi.org/10.1007/s10841-014-9708-7
Karl I, Janowitz SA, Fischer K (2008) Altitudinal life-history variation and thermal adaptation in the copper butterfly Lycaena tityrus. Oikos 117:778–788. https://doi.org/10.1111/j.0030-1299.2008.16522.x
Fischer K, Karl I (2010) Exploring plastic and genetic responses to temperature variation using copper butterflies. Clim Res 43:17–30. https://doi.org/10.2307/24870346
Brunzel S, Bussmann M, Obergruber H (2008) Deutliche Veränderungen von Tagfalterzönosen als Folge von Ausbreitungsprozessen. Erste Ergebnisse eines Monitorings über 17 Jahre. Nat und Landschaft 83:280–287
Settele J, Kudrna O, Harpke A et al (2008) Climatic risk atlas of European butterflies. BioRisk 1:1–712. https://doi.org/10.3897/biorisk.1
Õunap E, Tartes U (2014) Eesti päevaliblikad [Estonian butterflies]. Varrak, Tallinn
Ebert G, Rennwald E (1991) Die Schmetterlinge Baden Württembergs, 2nd edn. Ulmer, Stuttgart
Tolman T, Lewington R (2008) Collins butterfly guide: the most complete field guide to the butterflies of Britain and Europe. HarperCollins, London
Tuzov VK (2000) Guide to the butterflies of Russia and adjacent territories. Pensoft, Sofia
Binot-Hafke M, Balzer S, Becker N, et al (2011) Rote Liste gefährdeter Tiere, Pflanzen und Pilze Deutschlands. Wirbellose Tiere (part 1) 3. Bundesamt für Naturschutz, Bonn
Bräu M, Bolz R, Kolbeck H et al (2013) Tagfalter in Bayern. Ulmer, Stuttgart
Magoc T, Salzberg SL (2011) FLASH: fast length adjustment of short reads to improve genome assemblies. Bioinformatics 27:2957–2963. https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btr507
Kofler R, Schlötterer C, Lelley T (2007) SciRoKo: a new tool for whole genome microsatellite search and investigation. Bioinformatics 23:1683–1685. https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btm157
Peakall R, Smouse PE (2006) GenAlEx 6: genetic analysis in Excel. Population genetic software for teaching and research. Mol Ecol Notes 6:288–295. https://doi.org/10.1111/j.1471-8286.2005.01155.x
Peakall R, Smouse PE (2012) GenAlEx 6.5: genetic analysis in Excel. Population genetic software for teaching and research-an update. Bioinformatics 28:2537–2539. https://doi.org/10.1093/bioinformatics/bts460
Raymond M, Rousset F (1995) GENEPOP (Version 1.2): population genetics software for exact tests and ecumenicism. J Hered 86:248–249. https://doi.org/10.1093/oxfordjournals.jhered.a111573
Rousset F (2008) GENEPOP’007: a complete re-implementation of the GENEPOP software for Windows and Linux. Mol Ecol Resour 8:103–106. https://doi.org/10.1111/j.1471-8286.2007.01931.x
Holm S (1979) A simple sequentially rejective multiple test procedure. Scand J Stat 6:65–70
Ewers-Saucedo C, Zardus JD, Wares JP (2016) Microsatellite loci discovery from next-generation sequencing data and loci characterization in the epizoic barnacle Chelonibia testudinaria (Linnaeus, 1758). PeerJ 4:e2019. https://doi.org/10.7717/peerj.2019
Meglecz E, Petenian F, Danchin E et al (2004) High similarity between flanking regions of different microsatellites detected within each of two species of Lepidoptera: Parnassius apollo and Euphydryas aurinia. Mol Ecol 13:1693–1700. https://doi.org/10.1111/j.1365-294X.2004.02163.x
Ziehe M, Gregorius H-R (1985) The significance of over- and underdominance for the maintenance of genetic polymorphisms: I. Underdominance and stability. J Theor Biol 117:493–504. https://doi.org/10.1016/S0022-5193(85)80157-0
Habel JC, Finger A, Meyer M et al (2008) Polymorphic microsatellite loci in the endangered butterfly Lycaena helle (Lepidoptera: Lycaenidae). Eur J Entomol 105:361–362. https://doi.org/10.14411/eje.2008.043
Flanagan SP, Wilson WH, Jones KL, Lance SL (2010) Development and characterization of twelve polymorphic microsatellite loci in the Bog Copper, Lycaena epixanthe. Conserv Genet Resour 2:159–161. https://doi.org/10.1007/s12686-010-9206-5
Harr B, Zangerl B, Brem G, Schlötterer C (1998) Conservation of locus-specific microsatellite variability across species: a comparison of two Drosophila sibling species, D. melanogaster and D. simulans. Mol Biol Evol 15:176–184. https://doi.org/10.1093/oxfordjournals.molbev.a025913