Đặc điểm và phân tích chuỗi một phần của hai cypovirus mới được phân lập từ sâu đông Operophtera brumata (Lepidoptera: Geometridae)

Virus Genes - Tập 35 - Trang 463-471 - 2007
Robert I. Graham1,2,3, Shujing Rao4, Steven M. Sait5, Peter P. C. Mertens4, Rosemary S. Hails1, Robert D. Possee1
1NERC Centre for Ecology and Hydrology, Oxford, UK
2School of Biological and Molecular Sciences, Oxford Brookes University, Oxford, UK
3Faculty of Forestry and Environmental Management, University of New Brunswick, Fredericton, Canada
4Institute for Animal Health, Pirbright Laboratory, Woking, Surrey, UK
5Ecology and Evolution Research Group, School of Biology, University of Leeds, Leeds, UK

Tóm tắt

Các chuỗi nucleotide hoàn chỉnh của các đoạn gen S5 đến S10 từ cypovirus 18 của Operophtera brumata (OpbuCPV18), và các chuỗi nucleotide hoàn chỉnh của các đoạn gen S2, S5, S9 và S10 từ cypovirus 19 của Operophtera brumata (OpbuCPV19) đã được xác định. Mỗi đoạn gen chứa một khung đọc mở (ORF) duy nhất. Các động từ bảo tồn 5' (AGUAAA....GUUAGCU) 3' được tìm thấy ở đầu mỗi đoạn của OpbuCPV18, trong khi các động từ bảo tồn 5' (AACAAA....UUUGC) 3' được tìm thấy tại mỗi đoạn cuối của OpbuCPV19. Các protein suy diễn được so sánh với các thành viên khác của họ Reoviridae. Phân tích phát sinh chủng loài sử dụng gen polyhedrin (S10) cho thấy OpbuCPV18 có mối quan hệ gần gũi nhất với cypovirus 1 của Dendrolimus punctatus, trong khi OpbuCPV19 có mối quan hệ gần gũi nhất với cypovirus 15 của Trichoplusia ni. Ngoài ra, phân tích S2, đoạn mã hóa cho gen RNA polymerase phụ thuộc RNA, đã xác nhận OpbuCPV19 thuộc về chi Cypovirus. Sau khi biểu hiện ORF từ OpbuCPV19 S10, sử dụng vector biểu hiện baculovirus, các thể bọc đã được quan sát trong văn hóa tế bào côn trùng. Điều này đã chứng minh rằng đoạn 10 mã hóa cho gen polyhedrin, có khả năng tạo thành một ma trận tinh thể đa diện.

Từ khóa


Tài liệu tham khảo

T. Hukuhara, J.R. Bohami, in Atlas of Invertebrates, ed. by J.R. Adams, J.R. Bohami (CRC Press, Inc., Boca Raton, Fla, 1991), p. 394

L.D. Rothman, J.H. Myers, J. Invertebr. Pathol. 67, 1 (1996)

C.C. Payne, P.P.C. Mertens, in The Reoviridae, ed. by W.K. Joklik (Plenum Press, London, 1983)

C.C. Payne, J. Gen. Virol. 30, 357 (1976)

C.L. Hill et al., J. Virol. Methods 78, 177 (1999)

P.P.C. Mertens et al. J. Gen. Virol. 70, 173 (1989)

P.P.C. Mertens, S. Rao, H. Zhou, in Virus Taxonomy: Eighth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses, ed. by C.M. Fauquet et al. (Elsevier Academic Press, London, 2004)

A.M. Shapiro et al., J. Virol. 79, 9430 (2005)

T.B. Green et al., J. Invertebr. Pathol. 91, 27 (2006)

M. Arella et al., J. Virol. 62, 211 (1988)

H. Mori et al., J. Gen. Virol. 70, 1885 (1989)

U. Sinha-Datta, V.R.M. Chavali, A. Ghosh, Biochem. Biophys. Res. Commun. 332, 710 (2005)

F. Fossiez, S. Belloncik, M. Arella, Virology 169, 462 (1989)

M.S. Galinski et al., J. Gen.Virol. 75, 1969 (1994)

F. Echeverry et al., Gene 197, 399 (1997)

S.L. Zhao et al., Arch. Virol. 148, 1357 (2003)

S.L. Zhao et al., Virus Res. 94, 17 (2003)

J.E. Kerslake et al., Bull. Entomol. Res. 86, 155 (1996)

R.I. Graham et al., J. Invertebr. Pathol. 91, 79 (2006)

T.A. Hall, Nucl. Acids. Symp. Ser. 41, 95 (1999)

J.D. Thompson, D.G. Higgins, T.J. Gibson, Nucl. Acids Res. 22, 4673 (1994)

S. Kumar et al., Bioinformatics 17, 1244 (2001)

J. Kyte, R.F. Doolittle, J. Mol. Biol. 157, 105 (1982)

N. Hulo et al., Nucl. Acids Res. 32, 134 (2004)

L. King, R. Possee, The Baculovirus Expression System, A Laboratory Guide, (Chapman, New York, 1992)

K. Hagiwara et al., Arch. Virol. 146, 181 (2001)

M.D. Ryan, A.M.Q. King, G.P. Thomas, J. Gen. Virol. 72, 2727 (1991)

N.M. Mattion et al., J. Virol. 70, 8124 (1996)

K. Hagiwara, T. Matsumoto, J. Gen. Virol. 81, 1143 (2000)

K. Hagiwara et al., Biochem. Biophys. Res. Commun. 247, 549 (1998)

K. Hagiwara et al., J. Virol. 72, 5762 (1998)

S. Rao et al., Arch. Virol. 148, 209 (2003)

P.P.C. Mertens et al., in Virus Taxomony: Eigth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses, ed. by C.M. Fauquet et al. (Elsevier/Academic Press, London, 2004), p. 447

K. Egwara, M.D. Summers, J. Invertebr. Pathol. 19, 395 (1972)

M.A. Whitt, J.S. Manning, J. Invertebr. Pathol. 51, 278 (1988)

D.L. Jarvis D.A. Bohlmeyer J. Garcia, Virology 185(2), 795 (1991)

G. Rohrmann et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 76, 4976 (1979)

H. Attoui et al., J. Gen. Virol. 81, 1507 (2000)

H. Attoui et al., Arch. Virol. 147, 533 (2002)