Nội dung được dịch bởi AI, chỉ mang tính chất tham khảo
Virut Asystasia mosaik Madagascar: một virut begomovirus bipartite mới gây nhiễm thực vật dại Asystasia gangetica tại Madagascar
Tóm tắt
Chúng tôi báo cáo lần đầu tiên chuỗi gen hoàn chỉnh của một virut begomovirus bipartite mới tại Madagascar, được phân lập từ cây dại Asystasia gangetica (họ Acanthaceae), với tên tạm thời được đề xuất là virut mosaik Asystasia Madagascar (AMMGV). Các chuỗi nucleotide của DNA-A và DNA-B của AMMGV chỉ có mối quan hệ xa với các chuỗi virut begomovirus đã biết và chia sẻ mức độ đồng nhất nucleotide cao nhất là 72.9 % (DNA-A) và 66.9 % (DNA-B) với một virut begomovirus bipartite gần đây được mô tả gây nhiễm Asystasia sp. ở Tây Phi. Phân tích phát sinh chủng loài cho thấy virut mới này từ Madagascar thuộc một nhánh mới của các virut begomovirus bipartite thuộc thế giới cũ.
Từ khóa
#begomovirus #Asystasia gangetica #Madagascar #DNA-A #DNA-B #phân tích phát sinh chủng loàiTài liệu tham khảo
Arguello-Astorga GR, Ruiz-Medrano R (2001) An iteron-related domain is associated to Motif 1 in the replication proteins of geminiviruses: identification of potential interacting amino acid-base pairs by a comparative approach. Arch Virol 146:1465–1485
Delatte H, Martin DP, Naze F, Goldbach R, Reynaud B, Peterschmitt M, Lett JM (2005) South West Indian Ocean islands tomato begomovirus populations represent a new major monopartite begomovirus group. J Gen Virol 86:1533–1542
Guindon S, Dufayard JF, Lefort V, Anisimova M, Hordijk W, Gascuel O (2010) New algorithms and methods to estimate maximum-likelihood phylogenies: assessing the performance of PhyML 3.0. Syst Biol 59:307–321
Harimalala M, Lefeuvre P, De Bruyn A, Tiendrebeogo F, Hoareau M, Villemot J, Ranomenjanahary S, Andrianjaka A, Reynaud B, Lett J-M (2012) A novel cassava-infecting begomovirus from Madagascar: cassava mosaic Madagascar virus. Arch Virol 157:2027–2030
Harimalala M, Chiroleu F, Giraud-Carrier C, Hoareau M, Zinga I, Randriamampianina JA, Velombola S, Ranomenjanahary S, Andrianjaka A, Reynaud B, Lefeuvre P, Lett JM (2014) Molecular epidemiology of cassava mosaic disease in Madagascar. Plant Pathol. doi:10.1111/ppa.12277
Jones RAC (2009) Plant virus emergence and evolution: origins, new encounter scenarios, factors driving emergence, effects of changing world conditions, and prospects for control. Virus Res 141:113–130
Lefeuvre P, Martin DP, Hoareau M, Naze F, Delatte H, Thierry M, Varsani A, Becker N, Reynaud B, Lett JM (2007) Begomovirus ‘melting pot’ in the south-west Indian Ocean islands: molecular diversity and evolution through recombination. J Gen Virol 88:3458–3468
Martin DP, Lemey P, Lott M, Moulton V, Posada D, Lefeuvre P (2010) RDP3: a flexible and fast computer program for analyzing recombination. Bioinformatics 26:2462–2463
Rojas MR, Hagen C, Lucas WJ, Gilbertson RL (2005) Exploiting chinks in the plant’s armor: evolution and emergence of geminiviruses. Annu Rev Phytopathol 43:361–394