Nội dung được dịch bởi AI, chỉ mang tính chất tham khảo
Phân Tích Các Đột Biến Dị Thường Của Gen Bệnh Huntington Trong Các Dân Tộc Ở Khu Vực Volga–Ural
Tóm tắt
Mười một quần thể của khu vực Volga–Ural đã được phân tích liên quan đến ba đột biến nội gen của gen bệnh Huntington (IT15), bao gồm đột biến cực kỳ đa hình (CAG)n và đột biến đa hình ở mức độ vừa (CCG)n của exon 1, và đột biến trung tính del2642 của exon 58. Đối với (CAG)n, đã quan sát 101 kiểu gen, với số lượng kiểu gen thay đổi từ 15 ở người Bashkir Đông Nam đến 34 ở người Mari. Độ đa dạng alen RS dao động từ 9.70 ở người Bashkir Đông Nam đến 18.00 ở người Chuvash, trung bình là 13.79 ± 2.12. Phân bố tần suất alen (CAG)n là đơn điệu và có cực đại tại (CAG)17. Đối với (CCG)n, đã quan sát thấy sáu alen có 6–12 lần lặp. RS là 4.13 ± 0.44, dao động từ 3.73 ở người Udmurt đến 4.99 ở người Tatar. Đối với del2642, alen del– được phát hiện với tần suất từ 0.830 ở người Mari đến 0.932 ở người Udmurt. Trong số tất cả các quần thể dân tộc Volga–Ural, các dân tộc Phần-Ugric đã chứng tỏ là đa dạng nhất liên quan đến ba đột biến này, trong khi đó các quần thể Turkic và, đặc biệt, người Bashkir lại có tính đồng nhất. Sự vi phân nhỏ của các quần thể Volga–Ural phù hợp với kiểu châu Âu.
Từ khóa
#bệnh Huntington #đa hình gen #quần thể dân tộc #khu vực Volga–Ural #alen.Tài liệu tham khảo
Gusella J.F., Wexler N.S., Conneally P.M. et al. 1983. A polymorphic DNA marker genetically linked to Huntington's disease. Nature. 306, 234–238.
Huntington's disease collaborative research group. 1993. A novel gene containing a trinucleotide repeat that is expanded and unstable on Huntington's disease chromosomes. Cell. 72, 971–983.
Andrew S.E., Goldberg Y.P., Kremer B. et al. 1993. The relationship between trinucleotide (CAG) repeats length and clinical features of Huntington's disease. Nature Genet. 4, 398–403.
Noveletto A., Persichetti F., Sabbadini G. et al. 1994. Polymorphism analysis of Huntington gene in Italian families affected with Huntington disease. Hum. Mol. Gen. 3, 1129–1132.
Mathew C.C. 1984. The isolation of high molecular weight eucaryotic DNA. In: Methods Mol. Biol. 2, 31–34.
Malysheva O.V. Molecular genetic analysis of the IT15 and DMPK genes in populations and in families with myotonic dystrophy or Huntington's disease. Cand. Sci. (Biol.) Dissertation. St. Petersburg. 2000.
Goldberg Y.P., Andrew S.E., Clarke L.A., Hayden M.R. 1993. A PCR method for accurate assessment of trinucleotide repeats expansion in Huntington disease. Hum. Mol. Genet. 2, 635–636.
Rubinsztein D.C., Barton D.E., Davison B.C., Ferguson-Smith M.A. 1993. Analysis of a trinucleotide-length polymorphism in the region of the gene that contains two CCG-rich stretches and a correlation between decreased age of onset of Huntington's disease and CAG repeat number. Hum. Mol. Genet. 2, 1713–1715.
Warner J.P., Barron L.H., Brock D.J.H. 1993. A new PCR assay for the trinucleotide repeat that is unstable and expanded on Huntington's disease chromosomes. Mol. Cell. Probes. 7, 235–239.
Rychlik W. 2002. Oligo primer analysis software ver. 6. // Molecular Biology Insights Inc., Cascade, CO. http://www.oligo.net.
Rousset F. 2001. Inferences from spatial population genetics. In: Handbook of Statistical Genetics. Balding D., Bishop M., Cannings C. Eds. John Wiley & Sons, 239–269.
Goudet J. 2001. FSTAT, a program to estimate and test gene diversities and fixation indices. http://www.unil.ch/ izea/softwares/fstat.html.
Marshall T.C., Slate J., Kruuk L.E.B., Pemberton J.M. 1998. Statistical confidence for likelihood-based paternity inference in natural populations. Mol. Ecol. 7, 639–655.
StatSoft, Inc. STATISTICA for Windows (Computer program manual). Tulsa, OK: StatSoft, Inc., 1999. WEB: http://www.statsoft.com.
Rubinsztein D.C., Amos W., Leggo J. et al. 1994. Mutational bias provide a model for the evolution of Huntington's disease and predicts a general increase in disease prevalence. Nature Genet. 7, 525–530.
Watkins W., Bamshad M., Jorde L. 1995. Population genetics of trinucleotide repeat polymorphisms. Hum. Mol. Genet. 4, 1485–1491.
Vegnaud G. 1991. The use of synthetic tandem repeats to isolate new VNTR loci: cloning of a human hypermutable sequence. Genomics. 1, 135–144.
Goldberg Y.P., McMurray C.T., Zeisler J. et al. 1995. Increased instability of intermediate alleles in families with sporadic Huntington disease compared to similar sized intermediate alleles in the general population. Hum. Mol. Genet. 4, 1911–1918.
Chong S.S., Almqvist E., Telenius H. et al. 1997. Contribution of DNA sequence and CAG size to mutation frequencies of intermediate alleles for Huntington disease: evidence from single sperm analyses. Hum. Mol. Genet6, 301–309.
Leeflang E., Zhang L., Tavare S. et al. 1995. Single sperm analysis of the trinucleotide repeats in the Huntington's disease gene: Quantification of the mutation frequency spectrum. Hum. Mol. Genet. 4, 1519–1526.
Rubinsztein D., Leggo J., Coles R. et al. 1996. Pheno-typic characterization of individuals with 30-40 CAG repeats in the Huntington disease gene reveals HD cases with 36 repeats and apparently normal elderly individu-als with 36-39 repeats. Am. J. Hum. Genet. 59, 16–22.
Brinkman R.R., Mezei M.M., Theilmann J. et al. 1997. The likelihood of being affected with Huntington disease by a particular age, for a specific CAG size. Am. J. Hum. Genet. 60, 1202–1210.
McNeil S., Novelletto A., Srinidhi J. et al. 1997. Reduced penetrance of the Huntington's disease mutation. Hum. Mol. Genet. 6, 775–779.
Squitieri F., Andrew S.E., Goldberg Y.P. et al. 1994. DNA haplotype analysis of Huntington disease reveals clues to the origins and mechanisms of CAG expansion and reasons for geographic variation of prevalence. Hum. Mol. Genet. 3, 2103–2114.
Almqvist E., Spence N., Nichol K. et al. 1995. Ancestral differences in the distribution of the Δ2642 glutamic acid polymorphism is associated with varying CAG repeat lengths on normal chromosomes: insight into the genetic evolution of Huntington disease. Hum. Mol. Gen. 4, 207–214.