Một bảng mở rộng các hợp tử chuột đồng-người cho nhiễm sắc thể 2q

Springer Science and Business Media LLC - Tập 20 - Trang 541-548 - 1994
M. Hafezparast1, C. G. Cole2, G. P. Kaur3, R. S. Athwal3, P. A. Jeggo1
1MRC Cell Mutation Unit, University of Sussex, Brighton, UK
2The Sanger Centre, Cambridge, UK
3The Fels Institute for Cancer Research and Molecular Biology, Temple University Medical School, Philadelphia

Tóm tắt

Một hợp tử chuột đồng-người chỉ chứa cánh q của nhiễm sắc thể 2 đã được sử dụng để xây dựng một bảng các hợp tử mang các vùng giảm của nhiễm sắc thể 2 bằng kỹ thuật chuyển giao gen fusion bức xạ. Nhiễm sắc thể người 2 mang gen Ecogpt và tất cả các hợp tử đã được chọn lọc bằng dấu hiệu này. Gen Ecogpt tích hợp được định vị trong vùng 2q33-34, dẫn đến việc giữ lại chọn lọc vùng này trong các hợp tử. Dữ liệu này đã được kết hợp với một bảng hợp tử trước đó đã được xây dựng chứa các vùng của 2q, được làm giàu cho vùng 2q36-37. Bảng hợp tử kết hợp này hữu ích cho việc xác định các dấu hiệu mới đến các vùng xác định của nhiễm sắc thể 2 và cho việc nhân bản các gen nằm trên 2q bằng một chiến lược định vị.

Từ khóa

#hợp tử chuột đồng-người #nhiễm sắc thể 2q #Ecogpt #chuyển giao gen #chiến lược định vị

Tài liệu tham khảo

Athwal, R.S., and Dhar, V. (1984). InGene Transfer and Cancer, (ed.) Pearson, M.L., and Sternberg, N.L., (Raven Press, New York), p. 21. Athwal, R.S., Smarsh, M., Searle, B.M., and Deo S.S. (1985). Integration of a dominant selectable marker into human chromosomes and transfer of marked chromosomes to mouse cells by microcell fusion.Somat. Cell Mol. Genet. 11:177. Cole, C.G., Dunham, I., Coffey, A.J., Ross, M.T., Meier-Ewert, S., Bobrow, M., and Bentley, D.R. (1992). A random STS strategy for construction of YAC contigs spanning defined chromosomal regions.Genomics 14:256. Florian, F., Hornigold, N., Griffin, D.K., Delhanty, J.D., Sefton, L., Abbott, C., Jones, C., Goodfellow, P.N., and Wolfe, J. (1991). The use of irradiation and fusion gene transfer (IFGT) hybrids to isolate DNA clones from human chromosome region 9q33-q34.Somat. Cell Mol. Genet. 17:445. Goodfellow, P.J., Povey, S., Nevanlinna, H.A., and Goodfellow, P.N. (1990). Generation of a panel of somatic cell hybrids containing unselected fragments of human chromosome 10 by X-ray irradiation and cell fusion: Application to isolating the MEN2A region in hybrid cells.Somat. Cell Mol. Genet. 16:163. Graw, S., Davidson, J., Gusella, J., Watkins, P., Tanzi, R., Neve, R., and Patterson, D. (1988). Irradiation-reduced human chromosome 21 hybrids.Somat. Cell Mol. Genet. 14:233. Green, E.D., and Olson, M.V. (1990). Chromosomal region of the cystic fibrosis gene in yeast artificial chromosomes: A model for human genome mapping.Science 250:94. Coffey, A.J., Roberts, R.G., Green, E.D., Cole, C.G., Butler, R., Anand, R., Giannelli, F., and Bentley, D.R. (1992). Construction of a 2.6-Mb contig in yeast artificial chromosomes spanning the human dystrophin gene using an STS-based approach.Genomics 12:474. Anand, R., Ogilvie, D.J., Butler, R., Riley, J.H., Finniear, R.S., Powell, S.J., Smith, J.C., and Markham, A.F. (1991). A yeast artificial chromosome contig encompassing the cystic fibrosis locus.Genomics 9:124. Vetrie, D., Vorechovsky, I., Sideras, P., Holland, J., Davies, A., Flinter, F., Hammarstrom, L., Kinnon, C., Levinsky, R., Bobrow, M., Smith, C.I.E., and Bentley, D.R. (1993). The gene involved in X-linked agammaglobulinaemia is a member of thesrc family of protein-tyrosine kinases.Nature 361:226. Jeggo, P.A., Hafezparast, M., Thompson, A.F., Kaur, G.P., Sandhu, A.K., and Athwal, R.S. (1993). A hamster-human subchromosomal hybrid cell panel for chromosome 2.Somat. Cell. Mol. Genet. 19:39. Zdzienicka, M.Z., Tran, Q., Van Der Schans, C.P., and Simons, J.W.I.M. (1988). Characterization of an X-ray hypersensitive mutant of V79 chinese hamster cells.Mutat. Res. 194:239. Jeggo, P.A., and Kemp, L.M., (1983). X-ray sensitive mutants of Chinese hamster ovary cell line. Isolation and cross-sensitivity to other DNA damaging agents.Mutat. Res. 112:313. Spurr, N.K., Cox, S., and Naylor, S. (1993). Report of the second international workshop on human chromosome 2 mapping.Cytogenet. Cell Genet. 64:70. Todd, S., and Naylor, S.L. (1991). Dinucleotide repeat polymorphism in the human surfactant-associated protein 3 gene (SFTP3).Nucleic Acids Res. 19:3756. Barr, F.G., Galili, N., Holick, J., Biegel, J.A., Rovera, G., and Emanuel, B.S. (1993). Rearrangement of thePAX3 paired box gene in the paediatric solid tumour alveolar rhabdomyosarcoma.Nature Genet. 3: 113. Harvey, C.B., Fox, M.F., Jeggo, P.A., Mantei, N., Povey, S., and Swallow, D.M. (1993). Regional localization of the lactase-phlorizin hydrolase gene,LCT, to chromosome 2q21.Ann. Hum. Genet. 57:179. Kelley, C.D., Edwards, Y., Johnstone, A.P., Harfst, E., Nogradi, A., Nussey, S.S., Povey, S., and Carter, N.D. (1992). Nucleotide sequence and chromosomal assignment of a cDNA encoding the large isoform of human glutamate decarboxylase.Ann. Hum. Genet. 56:255. Wu, S., Xiang, K., and Bell, G.I. (1991). Dinucleotide repeat polymorphism in the human glucagon gene.Nucleic Acids Res. 19:1163. Spurr, N.K., Cox, S., Bryant, S.P., Attwood, J., Robson, E.B., Shields, D.C., Steinbrueck, T., Jenkins, T., Murray, J.C., Kidd, K.K., Summar, M.L., Tsipouras, P., Retief, A.E., Kruse, T.A., Vergnaud, G., Weber, J.L., McBride, O.W., Doniskeller, H., and White, R.L. (1992). The CEPH consortium linkage map of human chromosome 2.Genomics 14:1055. Weissenbach, J., Gyapay, G., Dib, C., Vignal, A., Morissette, J., Millasseau, P., Vaysseix, G., and Lathrop, M. (1992). A second-generation linkage map of the human genome.Nature 359:794. Barber, T.D., Morell, R., Johnson, D.H., Asher, J.H., and Friedman, T.B. (1993) A highly informative dinucleotide repeat polymorphism at the D2S211 locus linked to ALPP, FN1, and TNP1.Hum. Mol. Genet. 2:88. Hafezparast, M., Kaur, G.P., Zdzienicka, M., Athwal, R.S., Lehmann, A.R., and Jeggo, P.A. (1993). Subchromosomal localisation of a gene (XRCC5) involved in double strand break repair to the region 2q34-36.Somat. Cell Mol. Genet. 19:413. Cox, D.R., Burmeister, M., Price, E.R., Kim, S., and Myers, R.M. (1990). Radiation hybrid mapping: A somatic cell genetic method for constructing high-resolution maps of mammalian chromosomes.Science 250:245. Falk, C.T. (1991). A simple method for ordering loci using data from radiation hybrids.Genomics 9:120. Spurr, N.K., and White, R. (1991). Report of the committee on the genetic constitution of chromosome 2.Cytogenet. Cell Genet. 58:142. NIH/CEPH Collaborative Mapping Group (1992). A comprehensive genetic linkage map of the human genome.Science 258:67.