Điều chỉnh theo giới tính và mức độ anti-CCP trong phân tích liên kết của viêm khớp dạng thấp

BMC Proceedings - Tập 1 - Trang 1-5 - 2007
Jérémie JP Lebrec1,2, Quinta Helmer1, Iryna Nishchenko1, Hans C van Houwelingen1
1Department of Medical Statistics and Bioinformatics, Leiden University Medical Center, Leiden, The Netherlands
2Laboratoire de Biostatistiques et Informatique Médicale and INSERM U613, Faculté de Médecine, 22 avenue C. Desmoulins, Université de Bretagne Occidentale, Brest, France

Tóm tắt

Chúng tôi kết hợp các tác động quần thể của giới tính và kháng thể hướng đến các peptid citrullinated vòng (anti-CCP) vào phân tích liên kết của viêm khớp dạng thấp (RA) với dữ liệu microsatellite được cung cấp bởi Tổ chức Viêm khớp dạng thấp Bắc Mỹ trong Hội thảo Phân tích Di truyền 15. Phương pháp này xuất phát từ một mô hình tổng quát tuyến tính hỗn hợp, bao gồm các tác động quần thể biên của các biến quan trọng. Phép thử cho sự liên kết được dựa trên một phép thử điểm trong một khả năng giả định của mô hình này. Sự suy diễn toán học được mô tả ở nơi khác, nhưng bài thử có dạng đơn giản và hấp dẫn: nó phân bổ trọng số cho sự chia sẻ do di sản thừa giữa các cặp cá nhân có liên quan dựa trên các giá trị biến cụ thể của cá nhân và kiểu hình của họ. Mặc dù RA phổ biến gấp ba lần ở phụ nữ so với nam giới, nhưng các trọng số thu được cho các cặp anh chị em nam-nam, nam-nữ, và nữ-nữ bị ảnh hưởng lại rất tương đồng và phân tích điều chỉnh theo giới tính hầu như không khác biệt so với phân tích không điều chỉnh. Mức độ anti-CCP cao đã được biết đến là có khả năng dự đoán mạnh mẽ RA. Phép thử của chúng tôi phân bổ trọng số rất nhỏ cho các cặp mà có mức anti-CCP cao ở cả hai anh chị em, trong khi các cặp anh chị em với hai mức anti-CCP thấp là những đối tượng đóng góp nhiều nhất cho bằng chứng về sự liên kết. So sánh giữa các phân tích không điều chỉnh và phân tích điều chỉnh theo anti-CCP xác định các đỉnh tiếp tục phân bố về các vùng có thể quy vào một 'chiều kích' của RA độc lập với anti-CCP.

Từ khóa

#viêm khớp dạng thấp #phân tích liên kết #giới tính #anti-CCP #tác động quần thể

Tài liệu tham khảo

Olson J: A general conditional-logistic model for affected-relative pair linkage studies. Am J Hum Genet. 1999, 65: 1760-1769. 10.1086/302662. Lebrec JJP, van Houwelingen HC: Score test for linkage in generalized linear models. Hum Hered. 2007, 64: 5-15. 10.1159/000101418.