Nội dung được dịch bởi AI, chỉ mang tính chất tham khảo
Các dấu hiệu microsatellite bổ sung cho việc lập bản đồ gen của chuột
Tóm tắt
Thông tin chuỗi gen của chuột từ các cơ sở dữ liệu EMBL và GenBank, các chuỗi đã được công bố và các clone gen đã được phân tích để tìm các yếu tố lặp lại đơn giản hoặc microsatellite. Mỗi microsatellite đã được khuếch đại bằng phản ứng chuỗi polymerase (PCR) như một dấu hiệu của vị trí riêng lẻ. Các mồi PCR đã được thiết kế từ chuỗi đặc biệt bao quanh mỗi lặp lại. Sự biến đổi kích thước của các sản phẩm PCR có kích thước dưới 750 cặp bazơ (bp) giữa các chủng chuột đã được xác định bằng cách sử dụng gel acrylamide hoặc agarose nhuộm ethidium bromide. Một số 74 microsatellite mới đã được đặc trưng ở trong bài báo này, nâng tổng số microsatellite chúng tôi đã phân tích lên 185. Trong số này, 157/185 (85%) có hơn một alen, 143/178 (80%) có sự khác biệt về chiều dài giữa C57BL/6J và Mus spretus, và 82/168 (49%) có sự khác biệt giữa DBA/2J và C57BL/6J. Microsatellite cung cấp các dấu hiệu vị trí đơn lẻ thông tin cho phân tích liên kết trong việc xây dựng bản đồ gen của bộ gen chuột.
Từ khóa
#microsatellite #chuột #bản đồ gen #PCR #alenTài liệu tham khảo
Aitman, T.J., Hearne, C.M., McAleer, M.A., and Todd, J.A.: Mononucleotide repeats are an abundant source of length variants in mouse genomic DNA. Mammalian Genome 1: 000–000, 1991.
Cattanach, B.M., Iddon, C.A., Charlton, H.M., Chiappa, S.A. and Fink, G.: Gonadotrophin-releasing hormone deficiency in a mutant mouse with hypogonadism. Nature 269:338–340, 1977.
Church, G.M. and Gilbert, W.: Genomic sequencing. Proc Natl Acad Sci USA 81: 1991–1995, 1984.
Cornall, R.J., Aitman, T.J., Hearne, C.M. and Todd, J.A.: The generation of a library of PCR-analysed microsatellite variants for genetic mapping of the mouse genome. Genomics, in press, 1991.
Hamada, H., Petrino, M.G. and Kakunaga, T.: A novel repeat element with Z-DNA-forming potential is widely found in evolutionarily diverse eukaryotic genomes. Proc Natl Acad Sci USA 79: 6465–6469, 1982.
Hillyard, A.L., Doolittle, D.P., Davisson, M.T. and Roderick, T.H.: Locus map of mouse with comparative map points of human on mouse. The Jackson Laboratory, Bar Harbor, Maine, November 1990.
Kaestner, K.H., Christy, R.J., McLenithan, J.C., Braiterman, L.T., Cornelius, P., Pekala, P.H., and Lane, M.D.: Sequence, tissue distribution, and differential expression of mRNA for a putative insulin-responsive glucose transporter in mouse 3T3-L1 adipocytes. Proc Natl Acad Sci USA 86:3150–3154, 1989.
Litt, M. and Luty, J.A.: A hypervariable microsatellite revealed by in vitro amplification of a dinucleotide repeat within the cardiac muscle actin gene. Am J Hum Genet 44: 397–401, 1989.
Love, J.M., Knight, A.M., McAleer, M.A. and Todd, J.A.: Towards construction of high resolution map of the mouse genome using PCR-analysed microsatellites. Nucl Acids Res 18: 4123–4130, 1990.
Magyar, J.P. and Schachner, M.: Genomic structure of the adhesion molecule on glia (AMOG, Na/K-ATPase β2 subunit). Nucl Acids Res 18: 6695, 1991.
Montagutelli, X., Serikawa, T. and Gueńet, J.-L.: PCR-analyzed microsatellites: Data concerning laboratory and wild-derived mouse inbred strains. Mammalian Genome 1: 255–259, 1991.
Neumann, P.E.: Two-locus linkage analysis using the recombinant inbred strains and Bayes' theorem. Genetics 126: 277–284, 1990.
Novak, T., White, P.M. and Rothenberg, E.L.: Regulatory anatomy of the murine interleukin-2 gene. Nucl Acids Res 18: 4523–4533, 1990.
Staden, R.: Methods to define and locate patterns of motifs in sequences. CABIOS 4: 53–60, 1988.
Tautz, D.: Hypervariability of simple sequences as a general source for polymorphic DNA markers. Nucl Acids Res 17: 6463–6471, 1989.
Taylor, B.A.: Recombinant inbred strains. In M.F. Lyon and A.G. Searle (eds.); Genetic Variants and Strains of the Laboratory Mouse, Second Edition pp. 773–796, Oxford University Press, New York, 1989.
Waye, M.M.Y., Verhoeyen, M.E., Jones, P.T., and Winter, G.: Eco K selection vectors for shotgun cloning into M13 and deletion mutagenesis. Nucl Acids Res 13: 8561–8570, 1985.
Weber, J.L.: Informativeness of human (dC-dA)n.(dG-dT)n polymorphisms. Genomics 7: 524–530, 1990.
Weber, J.L. and May, P.E.: Abundant class of human DNA polymorphisms which can be typed using the polymerase chain reaction. Am J Hum Genet 44:388–396, 1989.
Zhang, K., Bosron, W.F. and Edenberg, H.J.: Structure of the mouse Adh-1 gene and identification of a deletion in a long alternating purine-pyrimidine sequence in the first intron of strains expressing low alcohol dehydrogenase activity. Gene 57: 27–36, 1987.