Acinetobacter baumannii trong đơn vị chăm sóc đặc biệt: Hệ thống mới để nghiên cứu mối quan hệ clon giữa các chủng vi khuẩn

BMC Infectious Diseases - Tập 8 - Trang 1-9 - 2008
Carla Fontana1,2, Marco Favaro1, Silvia Minelli2, Maria Cristina Bossa2, Gian Piero Testore3, Francesca Leonardis4, Silvia Natoli4, Cartesio Favalli1,2
1Department of Experimental Medicine and Biochemical Sciences, "Tor Vergata" University of Rome, Rome, Italy
2Clinical Microbiology Laboratories, Polyclinic of Tor Vergata, Rome, Italy
3Public Health Department, Infectious Diseases, Polyclinic of Tor Vergata, Rome, Italy
4Department of Surgery, Intensive Care Unit – Polyclinic of Tor Vergata, Rome, Italy

Tóm tắt

Hệ thống giám sát nhiễm trùng bệnh viện phải hoạt động hiệu quả, đặc biệt là trong những khu vực có tính chất nghiêm trọng, chẳng hạn như Đơn vị Chăm sóc Tích cực (ICU). Những khu vực này thường xuyên là tâm điểm dịch tễ học cho sự lây truyền của các tác nhân kháng đa thuốc, như Acinetobacter baumannii. Khi một đợt dịch bùng phát xảy ra, điều quan trọng là phải xác nhận hoặc loại trừ mối quan hệ di truyền giữa các chủng trong thời gian ngắn. Có nhiều hệ thống phân loại phân tử được sử dụng với mục đích này. Phương pháp PCR dựa trên chuỗi lặp lại (REP-PCR) đã được công nhận là một phương pháp hiệu quả và mới đây đã được điều chỉnh theo dạng tự động được gọi là hệ thống DiversiLab. Trong nghiên cứu hiện tại, chúng tôi đã đánh giá sự kết hợp của một gói phần mềm mới được giới thiệu nhằm kiểm soát nhiễm trùng bệnh viện (VIGI@ct) với hệ thống DiversiLab. Để đánh giá độ tin cậy của DiversiLab, kết quả của nó cũng được so sánh với những kết quả thu được bằng phương pháp f-AFLP. Sự kết hợp giữa VIGI@ct và DiversiLab đã cho phép nhận diện sớm một cụm dịch A. baumannii, thông qua việc xác nhận mối quan hệ di truyền giữa các chủng. Cụm này bao gồm 56 chủng A. baumannii kháng đa thuốc từ nhiều mẫu vật được thu thập từ 13 bệnh nhân khác nhau nhập viện tại ICU trong một khoảng thời gian mười tháng. Các chủng A. baumannii này có liên quan clon, với mức độ tương đồng nằm trong khoảng 97 đến 100%. Các kết quả của DiversiLab đã được xác nhận thông qua phân tích f-AFLP. Việc nhận diện sớm ổ dịch đã dẫn đến việc áp dụng kịp thời các quy trình và biện pháp để tránh sự lây lan của tác nhân gây bệnh. Đến thời điểm hiện tại, sau 6 tháng kể từ khi có chủng A. baumannii cuối cùng, không có trường hợp nào khác liên quan đã được xác định.

Từ khóa

#Acinetobacter baumannii #Đơn vị Chăm sóc Tích cực #kháng đa thuốc #hệ thống DiversiLab #giám sát nhiễm trùng bệnh viện

Tài liệu tham khảo

Joly-Guillon ML: Clinical impact and pathogenicity of Acinetobacter. Clin Microbiol Infect. 2005, 11: 868-873. 10.1111/j.1469-0691.2005.01227.x. Vincent JL, Bihari DJ, Suter PM, Bruining HA, White J, Nicholas-Chainone MH: The prevalence of nosocomial infection in intensive care units in Europe. Results of the European prevalence of infection in intensive care (EPIC) study. EPIC International Advisory Committee. JAMA. 1995, 274: 639-644. 10.1001/jama.274.8.639. Wagenvort JHT, De Brauwer EIGB, Toenbreaker HMJ, Linden van der CJ: Epidemic: Acinetobacter baumannii strain with MRSA-like behaviour carried by healthcare staff. Eur J Clin Microbiol Infect Dis. 2002, 21: 326-327. 10.1007/s10096-002-0716-2. Agodi A, Zarrilli R, Barchitta M, Anzaldi A, Di Popolo A, Mattaliano A, Ghiraldi E, Travali S: Alert surveillance of intensive care unit-acquired Acinetobacter infections in a Sicilian hospital. Clin Microbiol Infect. 2006, 12: 241-247. 10.1111/j.1469-0691.2005.01339.x. Koeleman JG, Stoof J, Bijl van der MW, Vanderbrouckr-Grauls CMJE, Savelkoul PHM: Identification of epidemic strains of Acinetobacter baumannii by integrase gene PCR. J Clin Microbiol. 2001, 39: 8-13. 10.1128/JCM.39.1.8-13.2001. Zarrilli R, Crispino M, Bagattini M, Barretta E, Di Popolo A, Triassi M, Villari P: Molecular epidemiology of sequential outbreaks of Acinetobacter baumannii in an intensive care unit show the emergence of carbapenem resistance. J Clin Microbiol. 2004, 42: 946-953. 10.1128/JCM.42.3.946-953.2004. Villari P, Iacuzio L, Vozzella EA, Bosco U: Unusual genetic heterogeneity of Acinetobacter baumannii isolates in a university hospital in Italy. American J Infec Control. 1999, 27: 247-253. 10.1053/ic.1999.v27.a96961. Healy M, Houng J, Bittner T, Lising M, Frye S, Raza S, Schrock R, Manry J, Renwick A, Nieto R, Woods C, Versalovic J, Lupski R: Microbial DNA typing by automated repetitive-sequence-based PCR. J Clin Microbiol. 2005, 43: 199-207. 10.1128/JCM.43.1.199-207.2005. Fontana C, Favaro M, Pistoia ES, Minelli S, Bossa MC, Altieri A, Testore GP, Leonardis F, Natoli S, Favalli C: The Combined Use of VIGI@ct® (bioMèrieux) and Fluorescent Amplified Length Fragment Polymorphisms. J Hosp Infect. 2007, 66: 262-268. 10.1016/j.jhin.2007.04.004. Strulens MJ, De Gheldre Y, Deplano A: Comparative and library epidemiological typing systems: outbreak investigations versus surveillance systems. Infect Control Hosp Epidemiol. 1998, 19 (8): 565-569. Denton M, Wilcox MH, Parnell P, Green D, Keer V, Hawkey PM, Evans I, Murphy P: Role of environmental cleaning in controlling an outbreak of Acinetobacter baumannii on a neurosurgical intensive care unit. J Hosp Infect. 2004, 56: 106-110. 10.1016/j.jhin.2003.10.017. Docquier JD, Riccio ML, Mugnaioli C, Luzzaro F, Endimiani A, Toniolo A, Amicosante G, Rossolini GM: IMP-12, a new plasmid-encoded metallo-β-lactamase from a Pseudomonas putida clinical isolate. Antimicrob Agents Chemother. 2003, 47: 1522-1528. 10.1128/AAC.47.5.1522-1528.2003. Héritier C, Dubouix A, Poirel L, Marty N, Nordmann P: A nosocomial outbreak of Acinetobacter baumannii isolates expressing the carbapenem-hydrolyzing oxacillinase OXA-58. J Antimicrob Chemother. 2005, 55: 115-118. 10.1093/jac/dkh500. Koeuth T, J Versalovic, JR Lupiski: Differential subsequence conservation of interspaced repetitive Streptococcus pneumoniae BOX elements in diverse bacteria. Gen Res. 1995, 5: 408-18. 10.1101/gr.5.4.408. Aygün G, Demirkiran O, Utku T, Mete B, Urkmez S, Yilmaz M, Yaşar H, Dikmen Y, Oztürk R: Environmental contamination during a carbapenemic-resistant Acinetobacter baumannii outbreak in an intensive care unit. J Hosp Infect. 2002, 52: 259-262. 10.1053/jhin.2002.1300. Beggs CB, KG Kerr, PA Sleigh: Acinetobacter spp and the clinical environment. Indoor Built Environ. 2006, 15: 19-24. 10.1177/1420326X06062501. Heriteau F, Alberti C, Cohen Y, Troche G, Moine P, Timsit JF: Nosocomial infection and multidrug-resistant bacteria surveillance in intensive care units: a survey in France. Infec Control Hosp Epidemiol. 2005, 26: 13-20. 10.1086/502482. Lamma E, Mello P, Nanetti A, Riguzzi F, Storaci S, Velastro G: Artificial intelligence techniques for monitoring dangerous infections. IEEE Trans Inf Technol Biomed. 2006, 10: 143-145. 10.1109/TITB.2005.855537. Brossette SE, Hacek DM, Gavin PJ, Kamdar MA, Gadbois KD, Fisher AG, Peterson LR: A laboratory-based, hospital wide, electronic marker for nosocomial infection: future of infection control surveillance. Am J Clin Pathol. 2006, 125: 34-39. 10.1309/502A-UPR8-VE67-MBDE. The pre-publication history for this paper can be accessed here:http://www.biomedcentral.com/1471-2334/8/79/prepub