Nội dung được dịch bởi AI, chỉ mang tính chất tham khảo
Bản đồ chuyển hóa của bộ gen lạp thể đậu Hà Lan
Tóm tắt
Một tập hợp gồm 53 mảnh DNA lạp thể đậu Hà Lan đã được nhân bản, đại diện cho khoảng 90% bộ gen lạp thể, đã được sử dụng để thử nghiệm Northern blot RNA tổng hợp từ đậu Hà Lan, dẫn đến một bản đồ chuyển hóa lạp thể gần như hoàn chỉnh. Các phân tích tương tự được thực hiện cho RNA trích xuất từ cây con đậu Hà Lan được trồng dưới một số chế độ ánh sáng khác nhau. Chúng tôi đã phát hiện ít nhất 85 kb trong tổng số 120 kb bộ gen lạp thể đậu Hà Lan có thể được phát hiện dưới dạng các bản sao RNA. Đối với nhiều vùng của bộ gen, chúng tôi đã phát hiện nhiều bản sao chồng chéo, bao gồm cả RNA nhỏ kích thước gene và các bản sao lớn bao phủ toàn bộ cụm gene. Tất cả các bản sao được phát hiện đều phong phú hơn (được tính theo phần trăm RNA tế bào tổng thể) ở những cây được trồng dưới ánh sáng hơn so với cây hoàn toàn trong bóng tối. Tuy nhiên, các bản sao lớn thường phong phú hơn ở những cây đã được tiếp xúc với chỉ 24 giờ ánh sáng trắng (sau khi nảy mầm trong bóng tối) so với cây được trồng trong ánh sáng liên tục. Nghiên cứu này chỉ ra rằng các gene lạp thể thường được nhóm thành các đơn vị chuyển hóa đa gene có thể đồng chuyển hóa, và sự phát triển lạp thể được kích thích bởi ánh sáng liên quan đến những thay đổi trong sự phong phú tương đối của các RNA chồng chéo với độ dài khác nhau do quá trình chuyển hóa của những gene hoặc cụm gene này.
Từ khóa
#lạp thể #bộ gen #đậu Hà Lan #RNA #ánh sáng #chuyển hóa #gene #cụm geneTài liệu tham khảo
Allmen von J-M, Stutz E (1987) Nucleic Acid Res 15:2387
Alt J, Herrmann RG (1984) Curr Genet 8:551–557
Alt J, Morris J, Westhoff P, Herrmann RG (1984) Curr Genet 8:597–606
Barkan A, Miles D, Taylor WC (1986) EMBO J 5:1421–1427
Berends T, Kubiced Q, Mullet J (1986) Plant Mol Biol 6:125–134
Bird CR, Koller B, Auffret AD, Huttly AK, Howe CJ, Dyer TA, Gray JC (1985) EMBO J 4:1381–1388
Bookjans G, Stummann BM, Rasmussen OF, Henningsen KW (1986) Plant Mol Biol 6:359–366
Boyer SK, Mullet JE (1986) Plant Mol Biol 6:229–243
Christianson T, Rabinowitz M (1983) J Biol Chem 258:14025–14033
Cozens AL, Walker JE (1986) Biochem J 236:453–460
Cozens AL, Walker JE, Phillips AL, Huttly AK, Gray JC (1986) EMBO J 5:217–222
Deng X-W, Gruissem W (1987) Cell 49:379–387
Deno H, Sugiura M (1984) Proc Natl Acad Sci USA 81:405–408
Erion JL (1985) Plant Mol Biol 4:169–179
Fish LE, Kuck U, Bogorad L (1985) J Biol Chem 260:1413–1421
Fromm H, Edelman M, Koller B, Goloubinoff P, Galun E (1986) Nucleic Acids Res 14:883–898
Gorton HL, Briggs WR (1980) Plant Physiol 66:1024–1026
Gruissem W, Zurawski G (1985) EMBO J 4:3375–3383
Heinemeyer W, Alt J, Herrmann RG (1984) Curr Genet 8:543–549
Herrmann RG, Alt J, Schiller B, Widger WR, Cramer WA (1984) FEBS Lett 176:239–244
Herrmann RG, Westhoff P, Alt J, Tittgen J, Nelson N (1985) In: Vloten-Doting L, Groot GSP, Hall TC (eds) Molecular form and function of the plant genome. Plenum Press, New York, London, pp 233–256
Howe CJ, Auffret AD, Doherty A, Bowman CM, Dyer TA, Gray JC (1982) Proc Natl Acad Sci USA 79:6903–6907
Huttly AK, Gray JC (1984) Mol Gen Genet 194:402–409
Jansen RK, Palmer JD (1987) Curr Genet 11:553–564
Kaufman LS, Thompson WF, Briggs WR (1984) Science 226:1447–1449
Koch W, Edwards K, Kossel H (1981) Cell 25:203–213
Koller B, Delius H (1984) Cell 36:613–622
Krebbers ET, Larrinua IM, McIntosh L, Bogorad L (1982) Nucleic Acids Res 10:4985–5002
Lehmbeck J, Rasmussen OF, Bookjans GB, Jepsen BR, Stumann BM, Henningsen KW (1986) Plant Mol Biol 7:3–10
Levens D, Ticho B, Ackerman E, Rabinowitz M (1980) J Biol Chem 256:5226–5232
Link G (1984a) Plant Mol Biol 3:243–248
Link G (1984b) EMBO J 3:1697–1704
Maniatis T, Fritsch EF, Sambrook J (1982) Molecular cloning: a laboratory manual. Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, NY, pp 382–388
Morimoto R, Locker J, Synenki RM, Rabinowitz M (1979) J Biol Chem 254:12461–12370
Morris J, Herrmann RG (1984a) Nucleic Acids Res 12:2837–2851
Morris J, Herrmann RG (1984b) Nucleic Acids Res 12:6547–6558
Mullet JE, Klein RR (1987) EMBO J 6:1517–1579
Mullet JE, Orozco EM Jr, Chua NH (1985) Plant Mol Biol 4:39–54
Neuhaus H, Link G (1987) Curr Genet 11:251–257
Ohyama K, Fukuzawa H, Kohchi T, Shirai H, Sano T, Sano S, Umesono K, Shiki Y, Takeuchi M, Chang Z, Aota S, Inokuchi H, Ozeki H (1986) Nature 322:572–574
Oishi KK, Shapiro DR, Tewari KK (1984) Mol Cell Biol 4:2556–2563
Palmer JD, Thompson WF (1981a) Gene 15:21–26
Palmer JD, Thompson WF (1981b) Proc Natl Acad Sci USA 78:5533–5537
Palmer JD, Jorgensen RA, Thompson WF (1985) Genetics 109:195–213
Palmer JD, Osorio B, Thompson WF (1988) Curr Genet 14:65–74
Phillips AL, Gray JC (1984) Mol Gen Genet 194:477–484
Posno M, van Noort M, Debise R, Groot GSP (1984) Curr Genet 8:147–154
Rasmussen OF, Bookjans G, Stummann BM, Henningsen KW (1984a) Plant Mol Biol 3:191–199
Rasmussen OF, Stummann BM, Henningsen KW (1984b) Nucleic Acids Res 12:9143–9153
Rodermel SR, Bogorad L (1985) J Cell Biol 100:463–476
Shapiro DR, Tewari KK (1986) Plant Mol Biol 6:1–12
Sijben-Muller G, Hallick RB, Alt J, Westhoff P, Herrmann RG (1986) Nucleic Acids Res 14:1029–1044
Shinozaki K, Deno H, Kato A, Sugiura M (1983) Gene 24:147–155
Shinozaki K, Ohme M, Tanaka M, Wakasugi T, Hayashida N, Matsubayashi T, Zaita N, Chunwongse J, Obokata J, Yanaguchi-Shinozaki K, Ohto C, Torazawa K, Meng BY, Sugita M, Deno H, Kamogashira T, Yamada K, Kusuda J, Takaiwa F, Kato A, Tohdoh N, Shimada H, Sugiura M (1986) EMBO J 5:2043–2049
Smith SM, Ellis JR (1981) J Mol Appl Genet 1:127–137
Smith AG, Gray JC (1984) Mol Gen Genet 194:471–476
Stern DB, Gruissem W (1988) Cell (in press)
Tewari KK (1980) In: Davies JW, Hall T (eds) Nucleic acids in plants. CRC Press, Cleveland, pp 41–108
Thompson WF, Everett M, Polans NO, Jorgensen RA, Palmer JD (1983) Planta 158:487–500
Torazawa K, Hayashida N, Obokata J, Shinozaki K, Sugiura M (1986) Nucleic Acids Res 14:3143
Westhoff P (1985) Mol Genet 201:115–123
Westhoff P, Alt J, Herrmann RG (1983) EMBO J 2:2229–2237
Westhoff P, Alt J, Widger WR, Cramer WA, Herrmann RG (1985a) Plant Mol Biol 4:103–110
Westhoff P, Alt J, Nelson N, Herrmann RG (1985b) Mol Gen Genet 199:290–299
Westhoff P, Farchaus JW, Herrmann RG (1986) Curr Genet 11:165–169
Whitfeld PR, Bottomley W (1983) Annu Rev Plant Physiol 34:279–310
Whitfeld P, Atchison BA, Bottomley W, Leaver CJ (1976) In: Bucher Th (ed) Genetics and biogenesis of chloroplasts and mitochondria. Elsevier/North Holland, Amsterdam, pp 361–368
Willey DL, Auffret AD, Gray JC (1984) Cell 36:555–562
Zhu YS, Kung SD, Bogorad L (1985) Plant Physiol 79:371–376
Zurawski G, Bottomley W, Whitfeld PR (1982) Proc Natl Acad Sci USA 79:6260–6264
Zurawski G, Bottomley W, Whitfeld PR (1984) Nucleic Acids Res 12:6547–6558
Zurawski G, Bottomley W, Whitfeld PR (1986a) Nucleic Acids Res 14:3974
Zurawski G, Whitfeld PR, Bottomley W (1986b) Nucleic Acids 14:3975