Nội dung được dịch bởi AI, chỉ mang tính chất tham khảo
Một phương pháp phân loại mới cho một số relatives hoang dã của đậu xanh (Vigna radiata (L.) Wilcz.) dựa trên mối quan hệ phát sinh chủng loại phân tử và sự biến đổi hình thái
Tóm tắt
Đậu xanh (Vigna radiata (L.) Wilcz.) là một loại cây có họ đậu quan trọng được trồng chủ yếu ở châu Á. Các họ hàng hoang dã của nó được coi là nguồn gen hữu ích cho việc lai tạo đậu xanh. Tuy nhiên, lịch sử phân loại của đậu xanh và các họ hàng hoang dã của nó rất phức tạp và một số nhầm lẫn vẫn còn tồn tại trong các tài liệu gần đây. Trong nghiên cứu này, chúng tôi đã khảo sát các trình tự rDNA-ITS và các đặc điểm hình thái của 83 mẫu mã gen có liên quan chặt chẽ đến đậu xanh. Kết quả là, chúng tôi đã phân loại 83 mẫu mã thành năm loài và một mẫu chưa được phân loại. Tên phân loại đúng cho mỗi loài đã được xác định (Vigna grandiflora (Prain) Tateishi và Maxted, Vigna mungo (L.) Hepper, V. radiata, Vigna subramaniana (Babu ex Raizada) Raizada, và Vigna trinervia (Heyne ex Wight và Arn.) Tateishi và Maxted) dựa trên việc xem xét lịch sử phân loại của chúng và so sánh hình thái giữa các mẫu mã gen và mẫu tiêu chuẩn. Một phương pháp phân loại mới được đề xuất và một khóa hình thái đã được chuẩn bị. Trong phương pháp này, Vigna radiata (L.) Wilcz. var. setulosa (Dalz.) Ohwi và Ohashi được coi là đồng nghĩa với Vigna radiata (L.) Wilcz. var. sublobata (Roxb.) Verdc., và Vigna hainiana Babu, Gopinathan và Sharma là một đồng nghĩa của V. subramaniana. Mẫu 'NI1135' đã được tiết lộ là có mối quan hệ gần gũi nhất với, nhưng khác biệt rõ rệt so với, đậu xanh (V. radiata) dựa trên các trình tự rDNA-ITS của nó. Nó cũng có những đặc điểm hình thái phân biệt. Các cây có hình thái và hồ sơ DNA tương tự có thể được phân bổ ở dãy Himalaya của Ấn Độ. Tuy nhiên, vì hiện tại chỉ có một mẫu có sẵn, việc phân loại thuế của 'NI1135' cần được xem xét lại trong tương lai.
Từ khóa
#đậu xanh #Vigna radiata #phân loại #di truyền học #bà con hoang dãTài liệu tham khảo
Aitawade MM, Sutar SP, Rao SR, Malik SK, Yadav SR, Bhat KV (2012) Section Ceratotropis of subgenus Ceratotropis of Vigna (Leguminosae–Papilionoideae) in India with a new species from Northern Western Ghats. Rheedea 22:20–27
Babu CR, Sharma SK, Johri BM (1985) Leguminosae–Papilionoideae: tribe Phaseoleae. Bull Bot Surv India 27:1–28
Bairiganjan GC, Panda PC, Choudhury BP, Patnaik SN (1985) Fabaceae in Orissa. J Econ Taxon Bot 7:249–276
Bisht IS, Bhat KV, Lakhanpaul S, Latha M, Jayan PK, Biswas BK, Singh AK (2005) Diversity and genetic resources of wild Vigna species in India. Genet Resour Crop Evol 52:53–68
Chontira S, Kaga A, Tomooka N, Vaughan D, Srinives P (2007) Genetic diversity of the mungbean (Vigna radiata, Legumiosae) genepool on the basis of microsatellite analysis. Aust J Bot 55:837–847
Dalzell NA (1850) Phaseolus. Hooker’s J Bot Kew Gard Misc 2:33–37
Dixit TM, Sutar SP, Yadav SR, Bhat KV, Rao SR (2011) Vigna indica, a new name for Vigna trilobata var. pusilla and a note on section Aconitifoliae in India. Rheedea 21:1–7
Doi K, Kaga A, Tomooka N, Vaughan DA (2002) Molecular phylogeny of genus Vigna subgenus Ceratotropis based on rDNA ITS and atpB-rbcL intergenic spacer region of cpDNA sequences. Genetica 114:129–145
Gaikwad SP, Gore RD, Randive SD, Garad KU (2014) Vigna yadavii (Leguminosae: Papilionoideae), a new species from Western Ghats, India. Biodivers Data J 2:e4281
Gaikwad SP, Gore RD, Randive SD (2015) Vigna pandeyana (Fabaceae), a new species from northern Western Ghats, India. Biodivers Data J 3:e4606
Hara H (1955) Critical notes on some type specimens of East-Asiatic plants in foreign herbaria 3. J Jpn Bot 30:138–142
Kang YJ, Kim SK, Kim MY, Lestari P, Kim KH, Ha BK, Jun TH, Hwang WJ, Lee T, Lee J, Shim S, Yoon MY, Jang YE, Han KS, Taeprayoon P, Yoon N, Somta P, Tanya P, Kim KS, Gwag JG, Moon JK, Lee YH, Park BS, Bombarely A, Doyle JJ, Jackson SA, Schafleitner R, Srinives P, Varshney RK, Lee SH (2014) Genome sequence of mungbean and insights into evolution within Vigna species. Nat Commun 11:5443
Krishnaraja MV, Mohananj N (2014) Lectotypification of Vigna hainiana (Fabaceae: Papilionoideae). Webbia J Plant Taxon Geogr 69:97–100
Lambrides CJ, James AT, Lawn RJ, Williams RW (1999) Cross fertility of Australian accessions of wild mungbean (Vigna radiata ssp. sublobata) with green gram (V. radiata ssp. radiata) and black gram (V. mungo). Aust J Bot 47:601–610
Latha M, Scariah S, Krishnaraj MV, Presannakumari KT, Bhat KV, Bisht IS, Joseph John K (2014) Vigna konkanensis (Fabaceae: Papilionoideae) a new species from the west coast of India. Webbia J Plant Taxon Geogr 69:49–52
Lawn RJ, Rebetzke GJ (2006) Variation among Australian accessions of the wild mungbean (Vigna radiata ssp. sublobata) for traits of agronomic, adaptive, or taxonomic interest. Crop Pasture Sci 57:119–132
Lodhi MA, Ye GN, Weeden NF, Reisch BI (1994) A simple and efficient method for DNA extraction from grapevine cultivars and Vitis species. Plant Mol Biol Rep 12:6–13
Lukoki L, Maréchal R, Otoul E (1980) Les ancetrès sauvages des haricots cultivés: Vigna radiata (L.) Wilczek et V. mungo (L.) Hepper. Bull Jard Bot Nat Belgique 50:385–391
Maréchal R, Mascherpa JM, Stainer F (1978) Etude taxonomique d’un groupe complexed’espèces des genres Phaseolus et Vigna (Papilionaceae) sur la base de données morphologiques et polliniques, traitées par l’analyse informatique. Boissiera 28:1–273
McCouch S, Baute GJ, Bradeen J, Bramel P, Bretting PK, Buckler E, Burke JM, Charest D, Cloutier S, Cole G, Dempewolf H, Dingkuhn M, Feuillet C, Gepts P, Grattapaglia D, Guarino L, Jackson S, Knapp S, Langridge P, Lawton-Rauh A, Lijua Q, Lusty C, Michael T, Myles S, Naito K, Nelson RL, Pontarollo R, Richards CM, Rieseberg L, Ross-Ibarra J, Rounsley S, Hamilton RS, Schurr U, Stein N, Tomooka N, van der Knaap E, van Tassel D, Toll J, Valls J, Varshney RK, Ward J, Waugh R, Wenzl P, Zamir D (2013) Agriculture: feeding the future. Nature 499:23–24
Niyomdham C (1992) Notes on Thai and Indo-Chinese Phaseoleae (Leguminosae–Papilionoideae). Nord J Bot 12:339–346
Ohwi J, Ohashi H (1969) Adzuki beans of Asia. J Jpn Bot 44:29–31
Palmer JL, Lawn RJ, Adkins SW (2002) An embryo-rescue protocol for Vigna interspecific hybrids. Aust J Bot 50:331–338
Prain D (1897) Some additional Leguminosae. J Asiat Soc Bengal 66:347–517
Roxburgh W (1832) Phaseolus. Flora Indica Descr Indian Plants 3:287–300
Saini A, Reddy SK, Jawali N (2008) Intra-individual and intra-species heterogeneity in nuclear rDNA ITS region of Vigna species from subgenus Ceratotropis. Genet Res Camb 90:299–316
Schrire BD (2005) Tribe Phaseoleae. In: Lewis G, Shrire B, Mackinder B, Lock M (eds) Legume of the world. Royal Botanic Gardens, Kew, pp 393–431
Sharma M (1985) Supplement to the flora of Punjab state (India)-III. J Econ Taxon Bot 6:734–743
Sriphadet S, Lambrides CJ, Srinives P (2007) Inheritance of agronomic traits and their interrelationship in mungbean (Vigna radiata (L.) Wilczek). J Crop Sci Biotechnol 10:249–256
Takahashi Y, Somta P, Muto C, Iseki K, Naito K, Pandiyan M, Natesan S, Tomooka N (2016) Novel genetic resources in the genus Vigna unveiled from gene bank accessions. PLoS ONE 11:e0147568
Tamura K, Stecher G, Peterson D, Filipski A, Kumar S (2013) MEGA6: molecular evolutionary genetics analysis version 6.0. Mol Biol Evol 30:2725–2729
Tateishi Y, Maxted N (2002) New species and combinations in Vigna subgenus Ceratotropis (Piper) Verdc. (Leguminosae, Phaseoleae). Kew Bull 57:625–633
Thompson JD, Higgins DG, Gibson TJ (1994) CLUSTAL W: improving the sensitivity of progressive multiple sequence alignment through sequence weighting, position-specific gap penalties, and weight matrix choice. Nucleic Acids Res 22:4673–4680
Tomooka N, Vaughan DA, Moss H, Maxted N (2002) The Asian Vigna: Genus Vigna subgenus Ceratotropis genetic resources. Kluwer Academic Publishers, Dordrecht
Tomooka N, Kaga A, Vaughan DA (2006) The Asian Vigna (Vigna subgenus Ceratotropis) biodiversity and evolution. In: Sharma AK, Sharma A (eds) Plant genome: biodiversity and evolution 1, part C Phanerogams (Angiosperms-Dicotyledons). Science Publishers, New Hampshire, pp 87–126
Tomooka N, Naito K, Kaga A, Sakai H, Isemura T, Ogiso-anaka E, Iseki K, Takahashi Y (2014) Evolution, domestication and neo-domestication of the genus Vigna. Plant Genet Resour Charact Util 12:S168–S171
Verdcourt B (1970) Studies in the Leguminosae–Papilionoideae for the ‘Flora of Tropical East Africa’ IV. Kew Bull 24:507–569
Wight R, Arnott GAW (1834) Order LVI-Leguminosae. In: Prodromus Florae Peninsulae Indiae Orientalis, containing abridged descriptions of the plants found in the peninsula of British India, arranged according to the natural system. Missouri Botanical Garden, vol 1. Parbury, Allen, & Co., London, pp 178–298