Redox Biocatalysis and Metabolism: Molecular Mechanisms and Metabolic Network Analysis

Antioxidants and Redox Signaling - Tập 13 Số 3 - Trang 349-394 - 2010
Lars M. Blank1, Birgitta E. Ebert1, Katja Bühler1, Bruno Bühler1
1Laboratory of Chemical Biotechnology, Faculty of Biochemical and Chemical Engineering, TU Dortmund, Dortmund, Germany

Tóm tắt

Từ khóa


Tài liệu tham khảo

10.1021/cr040653o

Adam W, 1999, Adv Biochem Eng/Biotech, 63, 73

10.1021/bi002932l

10.1038/203973a0

10.1016/j.ymben.2004.12.003

10.1016/S0167-7799(03)00144-6

Andersen KB, 1977, J Biol Chem, 252, 4151, 10.1016/S0021-9258(17)40245-6

10.1016/j.jmb.2003.09.004

Andreesen JR, 2002, Met Ions Biol Syst, 39, 405

10.1042/bj3200697

10.1016/j.abb.2004.03.038

10.1016/j.ymben.2009.07.001

10.1023/A:1012976615056

10.1007/s00775-003-0466-3

10.1002/anie.200801184

10.1002/abio.370130302

10.1021/cr950244f

10.1002/bit.10441

10.1073/pnas.0807948105

10.1073/pnas.0807529106

10.1021/op800046t

Barton L, 2005, Structural and Functional Relationships in Prokaryotes, 447

10.1016/j.jtbi.2004.01.008

10.1128/AEM.71.12.8587-8596.2005

10.1128/JB.00562-09

Bermejo LL, 1998, Appl Environ Microbiol, 64, 1079, 10.1128/AEM.64.3.1079-1085.1998

10.1016/j.jbiotec.2006.01.026

10.1016/0003-2697(73)90094-8

10.1006/mben.2002.0229

10.1016/S0014-5793(00)01130-3

10.1128/JB.183.22.6707-6709.2001

10.1099/mic.0.26845-0

10.1186/gb-2005-6-6-r49

10.1016/j.femsyr.2004.09.008

10.1002/bit.20466

10.1002/bit.21837

10.1111/j.1742-4658.2008.06648.x

10.1021/bi0485124

10.1128/AEM.00429-09

10.1016/j.jinorgbio.2006.01.022

10.1016/j.cbpa.2009.03.018

10.1128/JB.00428-07

10.1002/(SICI)1097-0290(19960505)50:3<299::AID-BIT9>3.0.CO;2-B

10.1016/S0167-7799(97)01067-6

Boonstra B, 1999, J Bacteriol, 181, 1030, 10.1128/JB.181.3.1030-1034.1999

10.1128/jb.171.6.2956-2962.1989

10.1002/adsc.200505033

10.1039/B513226F

10.1098/rsif.2008.0521.focus

10.1021/ja016376+

10.1021/bi027429i

10.1016/j.abb.2004.03.034

10.1002/bit.10899

10.1016/j.ymben.2005.09.007

10.1021/ja071364v

10.1039/b707179p

10.1016/j.cbpa.2007.12.007

10.1074/jbc.275.14.10085

10.1128/AEM.68.2.560-568.2002

10.1002/bit.10512

10.1002/bit.10637

10.1016/j.jbiotec.2004.03.027

Bühler B, 2005, Handbook of C-H Transformations, 516

10.1021/op060028g

10.1021/op060028g

10.1128/AEM.02234-07

Bühler B, 2009, The Metabolic Pathway Engineering Handbook: Tools and Applications, 21, 1

10.1002/bit.1127

10.1002/bit.10803

10.1016/j.tibtech.2003.10.006

10.1006/jtbi.2001.2463

10.1016/j.biotechadv.2009.05.001

10.1002/bit.22060

10.1002/anie.200351434

10.1046/j.0014-2956.2001.02617.x

10.1007/BF01569955

10.1146/annurev.pharmtox.45.120403.100030

10.1002/bit.260190106

10.1021/cr020628n

10.1074/jbc.M201691200

10.1016/j.ymben.2005.09.006

10.1042/0264-6021:3400639

10.1006/jmbi.1999.3290

10.1021/bi048020r

10.1099/00221287-142-4-755

10.1128/AEM.68.4.1760-1771.2002

10.1016/j.abb.2004.03.022

10.1016/j.cbpa.2005.02.012

10.1016/S0040-4020(03)00701-4

Dols M, 1997, Appl Environ Microbiol, 63, 2159, 10.1128/AEM.63.6.2159-2165.1997

10.1002/yea.1383

Drauz K, 2002, Enzyme Catalysis in Organic Synthesis, 1559

10.1099/00221287-143-2-489

10.1002/biot.200500046

10.1021/bi00685a022

10.1016/j.bbrc.2005.08.221

10.1038/84379

Eklund H, 1982, J Biol Chem, 257, 14349, 10.1016/S0021-9258(19)45387-8

10.1002/pro.5560060305

10.1021/bi970691k

10.1074/jbc.M310163200

10.1006/mben.1998.0109

10.1007/s00253-004-1765-5

10.1021/ja074446s

106. Fell D. Understanding the Control of Metabolism. London: Portland, 1997, p. 301.

10.1016/j.bbrc.2005.08.222

10.1046/j.1432-1033.2003.03448.x

10.1074/jbc.M307968200

10.1016/j.ab.2003.10.036

10.1021/bi035656u

10.1002/9783527618262.ch16a

10.1186/1475-2859-4-30

10.1021/ja00015a061

10.1128/JB.187.5.1581-1590.2005

10.1128/JB.01523-08

10.1007/s002030050675

10.1046/j.1432-1033.2003.03946.x

10.1021/bi951793i

10.1021/bi960985q

10.1002/bit.21014

10.1128/JB.183.4.1441-1451.2001

10.1016/j.bbagen.2006.08.019

10.1002/anie.199313981

10.1126/science.1096897

10.1016/j.cbpa.2009.02.028

127. Guengerich FP.Mammalian cytochromes P450. Boca Raton, FL CRC Press, 1987, p. 484.

10.1016/S0003-9861(02)00415-0

10.1016/j.jbiotec.2007.06.022

10.1111/j.1365-2672.2006.02866.x

10.1038/sj.jim.7000191

10.1080/10409230490440541

10.1529/biophysj.105.071720

10.1529/biophysj.106.093138

10.1007/s00253-003-1455-8

10.1002/elsc.200720203

10.1099/mic.0.030213-0

10.1128/AEM.01754-07

Hille R, 2002, Met Ions Biol Syst, 39, 187

10.1016/j.cbpa.2009.02.025

10.1002/bit.10098

10.1007/s00253-006-0417-3

10.1007/BF03028629

10.1016/0006-291X(76)90544-1

10.1042/bj1750345

10.1016/0014-5793(85)80359-8

Hsu HF, 1999, J Inorg Biochem, 74, 168

10.1007/BF00170916

10.1007/BFb0103304

10.1016/0922-338X(94)90172-4

10.1016/j.theochem.2009.01.004

10.1126/science.284.5422.1961

10.1016/S0014-5793(99)01644-0

10.1038/msb.2008.8

10.1002/jobm.3620250910

10.1529/biophysj.107.124784

10.1128/JB.183.15.4536-4542.2001

10.1038/21395

10.1073/pnas.78.7.4226

10.1186/1752-0509-2-60

10.1016/j.cbpa.2008.01.029

10.1007/s00253-006-0804-9

10.1099/mic.0.2007/012682-0

10.1002/adsc.200303014

10.1016/j.abb.2005.07.020

10.1126/science.1096485

10.1021/ja00337a049

10.1021/ja00211a033

10.1021/cb7002434

10.1534/genetics.109.105254

10.1002/anie.199207741

Kiener A, 1995, Chemtech, 25, 31

10.1038/nsb889

10.1021/cr950047g

10.1074/jbc.M101679200

10.1042/BA20070132

10.1128/JB.182.17.4738-4743.2000

10.1007/s00775-005-0624-x

10.1016/S1367-5931(02)00366-6

10.1002/bit.20004

10.1126/science.1134697

10.1021/ar700052v

10.1038/nchembio.71

10.1021/bi801459q

Kragl U, 1996, Bioprocess Engineering, 14, 291

10.1021/ar700066p

10.1016/S0300-9084(80)80097-6

10.1007/PL00000820

10.1186/1471-2105-7-512

10.1186/1471-2091-9-11

10.1006/abbi.1999.1629

10.1080/10242420802393519

Lee S-K, 1993, J Biol Chem, 268, 21569, 10.1016/S0021-9258(20)80579-1

10.1016/S0098-1354(00)00323-9

10.1021/bi982712w

Lee SY, 2002, Genome Inform, 13, 214

10.1016/j.abb.2008.01.027

10.1074/jbc.M808202200

Lenich A, 1986, J Biol Chem, 261, 4090, 10.1016/S0021-9258(17)35627-2

10.1128/JB.00167-06

Liese A, 2006, Industrial Biotransformations, 423

10.1016/0003-2697(79)90039-3

10.1007/BF01570144

Lowry OH, 1961, J Biol Chem, 236, 2756, 10.1016/S0021-9258(19)61730-8

Lowry OH, 1961, J Biol Chem, 236, 2746, 10.1016/S0021-9258(19)61729-1

10.1016/j.chroma.2007.02.034

10.1016/j.ymben.2003.09.002

10.1016/S0168-1656(98)00095-9

Massey V, 1994, J Biol Chem, 269, 22459, 10.1016/S0021-9258(17)31664-2

10.1042/0300-5127:0280283

10.1002/(SICI)1097-0290(19990820)64:4<459::AID-BIT9>3.0.CO;2-C

10.1099/00221287-94-2-333

10.1007/s00253-001-0851-1

10.1016/S0969-2126(97)00245-1

10.1016/0141-0229(86)90004-9

10.1016/S1367-5931(99)80025-8

10.1002/1521-3773(20010803)40:15<2782::AID-ANIE2782>3.0.CO;2-P

10.1074/jbc.274.27.19072

10.1021/cr020443g

10.2174/138527206777698002

10.1073/pnas.0711626105

10.1073/pnas.0636619100

10.1002/1615-4169(200212)344:10<1023::AID-ADSC1023>3.0.CO;2-T

10.1016/S0968-0004(02)02086-8

10.1039/B604190F

10.1007/BF00248844

10.1128/AEM.68.12.6332-6342.2002

Neves AR, 2005, FEMS Microbiol Rev, 29, 531

10.1016/S0003-9861(02)00445-9

10.1073/pnas.0708299105

10.1007/978-1-4757-4645-7

10.1016/0003-2697(69)90025-6

10.1016/j.bej.2008.12.017

10.1093/jb/mvh147

10.4014/jmb.0807.447

10.1042/bst022070s

10.1073/pnas.0400973101

Ortiz de Montellano PR, 1998, Drug Metab Dispos, 26, 1185

10.1021/bi970609l

10.1128/JB.186.16.5292-5302.2004

10.1002/yea.878

Panke S, 1998, Appl Environ Microbiol, 64, 2032, 10.1128/AEM.64.6.2032-2043.1998

10.1002/(SICI)1097-0290(20000705)69:1<91::AID-BIT11>3.0.CO;2-X

10.1002/bit.10346

10.1002/bit.21037

10.1002/bit.20825

Patel RN, 2008, Chem Rev, 252, 659

10.1021/ja0562651

10.1021/bi0607554

10.1128/JB.187.9.3171-3179.2005

10.1016/j.bcp.2007.05.010

10.1093/jat/33.4.190

10.1016/j.forsciint.2008.12.001

10.1074/jbc.M908728199

Peterson JA, 1966, J Biol Chem, 241, 5162, 10.1016/S0021-9258(18)99684-5

10.1016/S0065-2911(00)43005-5

10.1042/bj3010625

10.1039/a902197c

10.1038/nrmicro1023

10.1007/s00775-007-0231-0

10.1038/73270

10.1021/ja00300a009

10.1021/bi050525+

10.1021/bi0609016

10.1007/BF01574775

10.1099/00221287-146-3-551

10.1038/42990

10.1002/bit.260221202

10.1016/0923-2508(96)83998-2

10.1038/366537a0

10.1042/BST0361134

10.1006/abio.1998.2656

10.1021/bi020698o

10.1016/j.tibs.2006.05.003

10.1016/S1367-5931(02)00302-2

10.1021/bp050375u

Sauer U, 1996, Appl Environ Microbiol, 62, 3687, 10.1128/AEM.62.10.3687-3696.1996

10.1002/(SICI)1097-0290(19990920)64:6<750::AID-BIT15>3.0.CO;2-S

Sauer U, 1999, J Bacteriol, 181, 6679, 10.1128/JB.181.21.6679-6688.1999

10.1074/jbc.M311657200

10.1038/msb4100109

10.1016/S0022-5193(05)80161-4

10.1016/S0022-5193(05)80596-X

10.1007/s00253-009-1976-x

10.1126/science.287.5458.1615

10.1038/35051736

10.1002/(SICI)1097-0290(19970920)55:6<831::AID-BIT2>3.0.CO;2-H

10.1016/j.jbiotec.2007.08.003

10.1016/j.ymben.2009.08.006

10.1002/bit.22390

10.1038/msb4100162

10.1111/j.1432-1033.1976.tb10108.x

10.1021/ja800654d

10.1002/adsc.200390049

10.1021/bi802279d

10.1016/S1389-1723(01)80033-5

10.1271/bbb.64.746

10.1126/science.275.5299.515

10.1073/pnas.78.10.6271

10.1073/pnas.0404922101

10.1128/JB.184.6.1733-1742.2002

10.1021/cr950046o

10.1021/cr9900275

10.1039/b800799c

10.1021/cr9500500

Stephanopoulos G, 1998, Metabolic Engineering: Principles and Methodologies, 725

Steuer R, 2009, Adv Chem Phys, 142, 105

Stewart JD, 1998, Curr Org Chem, 2, 195, 10.2174/1385272802666220128191443

Stouthamer AH, 1979, International Review of Biochemistry: Microbial Biochemistry, 1

10.1016/S0958-1669(02)00360-9

10.1089/omi.1.1999.4.173

10.1074/jbc.272.39.24257

10.1128/jb.173.5.1690-1695.1991

10.1038/nbt775

10.1002/mas.20191

10.1111/j.1567-1364.2005.00021.x

Tempest DW, 1987, Escherichia coli and Salmonella typhimurium cellular and molecular biology, 797

Tishkov VI, 2004, Biochemistry, 69, 1252

10.1111/j.1432-1033.1997.00155.x

10.1007/s00018-007-6362-1

10.1007/s00253-003-1514-1

10.1016/j.tibtech.2006.05.002

10.1016/j.cbpa.2006.02.001

10.1080/10409230600817422

10.1016/S1074-5521(02)00149-7

10.1021/ja9839522

10.1016/0141-0229(94)90066-3

10.1016/j.copbio.2005.04.005

10.1128/JB.187.1.85-91.2005

10.1016/j.jbiotec.2006.03.044

10.1016/S0167-7799(00)01529-8

10.1016/S1381-1177(00)00062-X

10.1002/1615-4169(200108)343:6/7<515::AID-ADSC515>3.0.CO;2-U

10.1016/S0040-4020(97)00477-8

10.1002/bit.260480617

10.1128/AEM.70.5.2898-2905.2004

10.1016/S0958-1669(00)00143-9

10.1002/bit.260430104

10.1002/bit.260420109

10.1007/s00253-006-0680-3

10.1128/AEM.68.4.1715-1727.2002

10.1021/bi0265325

10.1128/JB.186.7.1945-1958.2004

10.1002/bp060156o

10.1016/S0141-0229(02)00129-1

10.1021/cr9500489

10.1021/bi002298b

Wang HY, 1979, Biotechnol Bioeng Symp, 9, 13

348a.Webster's Encyclopedic Unabridged Dictionary of the English Language. New York: Gramercy Books, 1996, p. 2230.

10.1007/s10529-004-3746-2

10.1016/0003-9861(76)90149-1

10.1007/s002530000381

10.1002/bit.260231213

Wichmann R, 2005, Adv Biochem Eng Biotechnol, 92, 225

10.1016/0006-291X(77)90995-0

10.1006/mben.2001.0187

10.1042/bst0310493

Wimpenny JW, 1972, J Bacteriol, 11, 24, 10.1128/JB.111.1.24-32.1972

10.1002/adsc.200800775

10.1128/AEM.68.12.5843-5859.2002

10.1016/S0065-2164(06)60001-4

10.1042/BST0340301

Wu JT, 1986, Clin Chem, 32, 314, 10.1093/clinchem/32.2.314

Wubbolts MG, 1990, J Biol Chem, 265, 17665, 10.1016/S0021-9258(18)38215-2

10.1016/0141-0229(94)90127-9

10.1021/ac802249m

10.1016/j.compchemeng.2009.03.008

10.1016/j.ab.2006.02.017

10.1007/BF00762784

10.1021/bi701370e

10.1016/j.jphotobiol.2008.12.010

10.2174/138920006776873472

10.1016/S1096-7176(03)00007-7

10.1128/JB.186.14.4528-4534.2004

10.1016/j.copbio.2003.09.007

10.1073/pnas.021547498

10.1081/DMR-120005650

Zilberstein D, 1984, J Bacteriol, 158, 246, 10.1128/JB.158.1.246-252.1984