Kinetic and structural studies reveal a unique binding mode of sulfite to the nickel center in urease

Maroney, 2014, Chem. Rev., 114, 4206, 10.1021/cr4004488 Mobley, 1989, Microbiol. Rev., 53, 85, 10.1128/MR.53.1.85-108.1989 Karplus, 1997, Acc. Chem. Res., 30, 330, 10.1021/ar960022j Krajewska, 2009, J. Mol. Catal. B Enzym., 59, 9, 10.1016/j.molcatb.2009.01.003 Zambelli, 2011, Acc. Chem. Res., 44, 520, 10.1021/ar200041k Callahan, 2005, J. Am. Chem. Soc., 127, 10828, 10.1021/ja0525399 Follmer, 2008, Phytochemistry, 69, 18, 10.1016/j.phytochem.2007.06.034 Montecucco, 2001, Nat. Rev. Mol. Cell Biol., 2, 457, 10.1038/35073084 Lin, 2012, Infect. Immun., 80, 2771, 10.1128/IAI.06195-11 Young, 1996, J. Bacteriol., 178, 6487, 10.1128/JB.178.22.6487-6495.1996 Cox, 2000, Infect. Immun., 68, 443, 10.1128/IAI.68.2.443-448.2000 Jones, 1990, Infect. Immun., 58, 1120, 10.1128/IAI.58.4.1120-1123.1990 Stangel, 1984, 23 Bremner, 1978 Krajewska, 2001, J. Mol. Catal. B Enzym., 14, 101, 10.1016/S1381-1177(00)00243-5 Zaborska, 2004, J. Enzyme Inhib. Med. Chem., 19, 65, 10.1080/14756360310001650237 Kosikowska, 2011, Expert Opin. Ther. Pat., 21, 945, 10.1517/13543776.2011.574615 Benini, 2014, J. Biol. Inorg. Chem., 19, 1243, 10.1007/s00775-014-1182-x Jabri, 1995, Science, 268, 998, 10.1126/science.7754395 Benini, 1999, Structure, 7, 205, 10.1016/S0969-2126(99)80026-4 Ha, 2001, Nat. Struct. Biol., 8, 505, 10.1038/88563 Balasubramanian, 2010, J. Mol. Biol., 400, 274, 10.1016/j.jmb.2010.05.009 Benini, 1998, J. Biol. Inorg. Chem., 3, 268, 10.1007/s007750050231 Benini, 2000, J. Biol. Inorg. Chem., 5, 110, 10.1007/s007750050014 Benini, 2001, J. Biol. Inorg. Chem., 6, 778, 10.1007/s007750100254 Benini, 2004, J. Am. Chem. Soc., 126, 3714, 10.1021/ja049618p Benini, 2013, J. Biol. Inorg. Chem., 18, 391, 10.1007/s00775-013-0983-7 Ciurli, 1999, Coord. Chem. Rev., 190–192, 331, 10.1016/S0010-8545(99)00093-4 Musiani, 2001, J. Biol. Inorg. Chem., 6, 300, 10.1007/s007750000204 Ciurli, 2007, 241 Benini, 2013, 2287 Riddles, 1983, Biochim. Biophys. Acta Protein Struct. Mol., 743, 115 Zerner, 1991, Bioorg. Chem., 19, 116, 10.1016/0045-2068(91)90048-T Benini, 1996, Soil Biol. Biochem., 28, 819, 10.1016/0038-0717(96)00017-X Ciurli, 1996, Soil Biol. Biochem., 28, 811, 10.1016/0038-0717(96)00020-X Reddie, 2008, Curr. Opin. Chem. Biol., 12, 746, 10.1016/j.cbpa.2008.07.028 Allison, 1976, Acc. Chem. Res., 9, 293, 10.1021/ar50104a003 King, 1997, Inorg. Chim. Acta, 255, 381, 10.1016/S0020-1693(96)05402-3 Martín de Llano, 1992, Electrophoresis, 13, 300, 10.1002/elps.1150130162 Kistiakowsky, 1949, J. Am. Chem. Soc., 71, 2006, 10.1021/ja01174a029 Ambrose, 1950, J. Am. Chem. Soc., 72, 317, 10.1021/ja01157a083 Andrews, 1986 Mazzei, 2014, J. Vis. Exp. Segel, 1993 Cornish-Bowden, 2014, Perspect. Sci., 1, 74, 10.1016/j.pisc.2014.02.006 Kabsch, 2010, Acta Crystallogr. D Biol. Crystallogr., 66, 125, 10.1107/S0907444909047337 Evans, 2006, Acta Crystallogr. D Biol. Crystallogr., 62, 72, 10.1107/S0907444905036693 Murshudov, 1997, Acta Crystallogr. D Biol. Crystallogr., 53, 240, 10.1107/S0907444996012255 Murshudov, 1999, Acta Crystallogr. D Biol. Crystallogr., 55, 247, 10.1107/S090744499801405X Emsley, 2004, Acta Crystallogr. D Biol. Crystallogr., 60, 2126, 10.1107/S0907444904019158 Emsley, 2010, Acta Crystallogr. D Biol. Crystallogr., 66, 486, 10.1107/S0907444910007493 Pettersen, 2004, J. Comput. Chem., 25, 1605, 10.1002/jcc.20084 Neese, 2012, Wiley Interdiscip. Rev.: Comput. Mol. Sci., 2, 73 Becke, 1993, J. Chem. Phys., 98, 1372, 10.1063/1.464304 Lee, 1988, Phys. Rev. B, 37, 785, 10.1103/PhysRevB.37.785 M. J. Frisch, G. W. Trucks, H. B. Schlegel, G. E. Scuseria, M. A. Robb, J. R. Cheeseman, G. Scalmani, V. Barone, B. Mennucci, G. A. Petersson, H. Nakatsuji, M. Caricato, X. Li, H. P. Hratchian, A. F. Izmaylov, J. Bloino, G. Zheng, J. L. Sonnenberg, M. Hada, M. Ehara, K. Toyota, R. Fukuda, J. Hasegawa, M. Ishida, T. Nakajima, Y. Honda, O. Kitao, H. Nakai, T. Vreven, J. A. Montgomery Jr., J. E. Peralta, F. Ogliaro, M. J. Bearpark, J. Heyd, E. N. Brothers, K. N. Kudin, V. N. Staroverov, R. Kobayashi, J. Normand, K. Raghavachari, A. P. Rendell, J. C. Burant, S. S. Iyengar, J. Tomasi, M. Cossi, N. Rega, N. J. Millam, M. Klene, J. E. Knox, J. B. Cross, V. Bakken, C. Adamo, J. Jaramillo, R. Gomperts, R. E. Stratmann, O. Yazyev, A. J. Austin, R. Cammi, C. Pomelli, J. W. Ochterski, R. L. Martin, K. Morokuma, V. G. Zakrzewski, G. A. Voth, P. Salvador, J. J. Dannenberg, S. Dapprich, A. D. Daniels, Ö. Farkas, J. B. Foresman, J. V. Ortiz, J. Cioslowski, D. J. Fox, Gaussian, Inc., Wallingford, CT, USA, 2009. Dunning, 1989, J. Chem. Phys., 90, 1007, 10.1063/1.456153 Spink, 1976, Methods Biochem. Anal., 23, 1 Williams, 1993, J. Org. Chem., 58, 3507, 10.1021/jo00065a010 Todd, 2001, Anal. Biochem., 296, 179, 10.1006/abio.2001.5218 Freyer, 2008, Methods Cell Biol., 79 Pedroso, 2014, J. Biol. Inorg. Chem., 19, 389, 10.1007/s00775-013-1079-0 Marzadori, 1998, Soil Biol. Biochem., 30, 1485, 10.1016/S0038-0717(98)00051-0 Quiroz-Valenzuela, 2008, Arch. Biochem. Biophys., 480, 51, 10.1016/j.abb.2008.09.004 Perrin, 1982 Voegtli, 2000, Biochemistry, 39, 15365, 10.1021/bi0021030 Schenk, 2005, Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A., 102, 273, 10.1073/pnas.0407239102 Antonyuk, 2014, IUCr J., 1, 101, 10.1107/S205225251400400X Vincent, 1997, J. Mol. Struct. THEOCHEM, 394, 1, 10.1016/S0166-1280(96)04917-2 Horner, 1986, Inorg. Chem., 25, 2414, 10.1021/ic00234a026 Eklund, 2012, Dalton Trans., 41, 5209, 10.1039/c2dt12467j Håkansson, 1992, J. Mol. Biol., 227, 1192, 10.1016/0022-2836(92)90531-N Eriksson, 1988, Proteins, 4, 274, 10.1002/prot.340040406 Andreini, 2012, Nucleic Acids Res., 41, D312, 10.1093/nar/gks1063 Desguin, 2015, Science, 349, 66, 10.1126/science.aab2272 Weiss, 2001, J. Appl. Crystallogr., 34, 130, 10.1107/S0021889800018227 Cruickshank, 1999, Acta Crystallogr. D Biol. Crystallogr., 55, 583, 10.1107/S0907444998012645 Winn, 2011, Acta Crystallogr. D Biol. Crystallogr., 67, 235, 10.1107/S0907444910045749