Nakashima, 1994, J. Mol. Biol., 238, 54, 10.1006/jmbi.1994.1267
Cedano, 1997, J. Mol. Biol., 266, 594, 10.1006/jmbi.1996.0804
Reinhardt, 1998, Nucleic Acids Res., 26, 2230, 10.1093/nar/26.9.2230
Chou, 1999, Protein Eng., 12, 107, 10.1093/protein/12.2.107
Nakai, 1999, Trends Biochem. Sci., 24, 34, 10.1016/S0968-0004(98)01336-X
Emanuelsson, 2000, J. Mol. Biol., 300, 1005, 10.1006/jmbi.2000.3903
Zhou, 2003, Proteins: Struct., Funct., Genet., 50, 44, 10.1002/prot.10251
Matsuda, 2005, Protein Sci., 14, 2804, 10.1110/ps.051597405
Gardy, 2005, Bioinformatics, 21, 617, 10.1093/bioinformatics/bti057
Hoglund, 2006, Bioinformatics, 22, 1158, 10.1093/bioinformatics/btl002
Mundra, 2007, Pattern Recognit. Lett., 28, 1610, 10.1016/j.patrec.2007.04.001
Xu, 2011, IEEE/ACM Trans. Comput. Biol. Bioinf., 8, 748, 10.1109/TCBB.2010.22
Chou, 2011, PLoS One, 6, e18258, 10.1371/journal.pone.0018258
Wu, 2011, Mol. BioSyst., 7, 3287, 10.1039/c1mb05232b
Wu, 2012, Protein Pept. Lett., 19, 4, 10.2174/092986612798472839
Chou, 2012, Mol. BioSyst., 8, 629, 10.1039/C1MB05420A
Li, 2012, Bioinformatics, 28, i32, 10.1093/bioinformatics/bts230
Li, 2012, PLoS One, 7, e31057, 10.1371/journal.pone.0031057
He, 2012, PLoS One, 7, e37155, 10.1371/journal.pone.0037155
Nakai, 2000, Adv. Protein Chem., 54, 277, 10.1016/S0065-3233(00)54009-1
Chou, 2007, Anal. Biochem., 370, 1, 10.1016/j.ab.2007.07.006
Glory, 2007, Dev. Cell, 12, 7, 10.1016/j.devcel.2006.12.007
Millar, 2009, Plant Cell, 21, 1625, 10.1105/tpc.109.066019
Xiao, 2011, J. Theor. Biol., 284, 42, 10.1016/j.jtbi.2011.06.005
Xiao, 2011, PLoS One, 6, e20592, 10.1371/journal.pone.0020592
Ashburner, 2000, Nat. Genet., 25, 25, 10.1038/75556
Chou, 2011, J. Theor. Biol., 273, 236, 10.1016/j.jtbi.2010.12.024
Huang, 2010, Bioinformatics, 26, 680, 10.1093/bioinformatics/btq003
Chou, 2009, Curr. Proteomics, 6, 262, 10.2174/157016409789973707
Wootton, 1993, Comput. Chem., 17, 149, 10.1016/0097-8485(93)85006-X
Nakashima, 1986, J. Biochem., 99, 152, 10.1093/oxfordjournals.jbchem.a135454
Chou, 1995, Proteins: Struct., Funct., Genet., 21, 319, 10.1002/prot.340210406
Chou, 1998, Biochem. Biophys. Res. Commun., 252, 63, 10.1006/bbrc.1998.9498
Chou, 2001, Proteins: Struct., Funct., Genet., 43, 246, 10.1002/prot.1035
Chou, 2001, Proteins: Struct., Funct., Genet., 44, 60, 10.1002/prot.1072
Chou, 2005, Bioinformatics, 21, 10, 10.1093/bioinformatics/bth466
Sahu, 2010, Comput. Biol. Chem., 34, 320, 10.1016/j.compbiolchem.2010.09.002
Mohammad Beigi, 2011, J. Struct. Funct. Genomics, 12, 191, 10.1007/s10969-011-9120-4
Zhang, 2008, Amino Acids, 34, 565, 10.1007/s00726-007-0010-9
Nanni, 2008, Amino Acids, 34, 653, 10.1007/s00726-007-0018-1
Lin, 2011, PLoS One, 6, e24756, 10.1371/journal.pone.0024756
Mohabatkar, 2013, Med. Chem., 9, 133, 10.2174/157340613804488341
Nanni, 2012, IEEE/ACM Trans. Comput. Biol. Bioinf., 9, 467, 10.1109/TCBB.2011.117
Guo, 2011, J. Comput. Chem., 32, 1612, 10.1002/jcc.21740
Mohabatkar, 2011, J. Theor. Biol., 281, 18, 10.1016/j.jtbi.2011.04.017
Zou, 2011, J. Comput. Chem., 32, 271, 10.1002/jcc.21616
Mohabatkar, 2010, Protein Pept. Lett., 17, 1207, 10.2174/092986610792231564
Georgiou, 2009, J. Theor. Biol., 257, 17, 10.1016/j.jtbi.2008.11.003
Zhou, 2007, J. Theor. Biol., 248, 546, 10.1016/j.jtbi.2007.06.001
Esmaeili, 2010, J. Theor. Biol., 263, 203, 10.1016/j.jtbi.2009.11.016
Zhang, 2008, Amino Acids, 35, 591, 10.1007/s00726-008-0086-x
Sun, 2012, Mol. BioSyst., 8, 3178, 10.1039/c2mb25280e
Zia Ur, 2012, Protein Pept. Lett., 19, 890, 10.2174/092986612801619589
Hayat, 2012, Protein Pept. Lett., 19, 411, 10.2174/092986612799789387
Chen, 2012, PLoS One, 7, e47843, 10.1371/journal.pone.0047843
Chen, 2012, Nucleic Acids Res., 10.1093/nar/gks1450
Du, 2012, Anal. Biochem., 425, 117, 10.1016/j.ab.2012.03.015
Shen, 2008, Anal. Biochem., 373, 386, 10.1016/j.ab.2007.10.012
Camon, 2003, Genome Res., 13, 662, 10.1101/gr.461403
Barrell, 2009, Nucleic Acids Res., 37, D396, 10.1093/nar/gkn803
Harris, 2004, Nucleic Acids Res., 32, D258, 10.1093/nar/gkh066
Chou, 2008, Nat. Protocols, 3, 153, 10.1038/nprot.2007.494
Chou, 2010, PLoS One, 5, e11335, 10.1371/journal.pone.0011335
Chou, 2010, PLoS One, 5, e9931, 10.1371/journal.pone.0009931
Scott, 2011, BMC Genomics, 12, 74, 10.1186/1471-2164-12-74
Wang, 2008, Protein Pept. Lett., 15, 915, 10.2174/092986608785849308
Shen, 2009, Anal. Biochem., 394, 269, 10.1016/j.ab.2009.07.046
Chou, 2007, J. Proteome Res., 6, 1728, 10.1021/pr060635i
Schaffer, 2001, Nucleic Acids Res., 29, 2994, 10.1093/nar/29.14.2994
Loewenstein, 2009, Genome Biol., 10, 207, 10.1186/gb-2009-10-2-207
Gerstein, 2003, Curr. Opin. Struct. Biol., 13, 341, 10.1016/S0959-440X(03)00080-0
Chou, 2004, Curr. Med. Chem., 11, 2105, 10.2174/0929867043364667
Ashburner, 2000, Nat. Genet., 25, 25, 10.1038/75556
Shen, 2010, J. Theor. Biol., 264, 326, 10.1016/j.jtbi.2010.01.018
Chou, 1995, FEBS Lett., 363, 123, 10.1016/0014-5793(95)00240-A
Deng, 1989, J. Grey Syst., 1
Tsoumakas, 2007, Int. J. Data Warehousing Min., 3, 13
Cerri, 2009, Adv. Bioinf. Comput. Biol., 5676, 109, 10.1007/978-3-642-03223-3_10
Chen, 2013, J. Theor. Biol., 318, 1, 10.1016/j.jtbi.2012.10.033
Hayat, 2012, J. Theor. Biol., 292, 93, 10.1016/j.jtbi.2011.09.026
Jahandideh, 2012, J. Theor. Biol., 312, 65, 10.1016/j.jtbi.2012.07.013
Nanni, 2012, Amino Acids, 43, 657, 10.1007/s00726-011-1114-9
Niu, 2012, Protein Pept. Lett., 19, 940, 10.2174/092986612802084492
Lin, 2012, PLoS One, 7, e49040, 10.1371/journal.pone.0049040
Mei, 2012, J. Theor. Biol., 293, 121, 10.1016/j.jtbi.2011.10.015
Mei, 2012, J. Theor. Biol., 310, 80, 10.1016/j.jtbi.2012.06.028
Chou, 2010, Nat. Sci., 2, 1090
