Phân Tích Đợt Sóng Khuếch Tán Để Tinh Giản Các Chuỗi Polyme

Ở đây, chúng tôi trình bày một phương pháp tiếp cận thay thế để tinh giản, dựa trên cách tiếp cận sóng khuếch tán đa độ phân giải để nén tác tử, không yêu cầu các ánh xạ từ nguyên tử đến tinh giản rõ ràng. Phương pháp sóng khuếch tán của chúng tôi nhận vào cấu trúc hình học và độ thưa thớt của cấu trúc liên kết phân tử của một hệ thống, và trả về một tập hợp cấp bậc các bậc tự do (DoFs) của các biến tinh giản đặc thù cho hệ thống. Quan trọng là, việc nén cấp bậc cung cấp một khuôn khổ rõ ràng để mô hình hóa ở nhiều quy mô mô hình (cấp độ), vượt ra ngoài mô hình tinh giản hai cấp độ thông thường. Kết quả của chúng tôi cho thấy rằng cấp bậc thu được tách biệt các chế độ cục bộ, chẳng hạn như chế độ dao động C-C đơn lẻ, khỏi các chuyển động có quy mô lớn hơn, ví dụ như các chế độ dao động xương sống phối hợp ở khoảng cách xa. Phương pháp của chúng tôi ghi lại chính xác các đặc điểm hóa học ở quy mô nhỏ, chẳng hạn như cấu trúc vòng cellulose, và các chuỗi bên alkane hoặc các đơn vị CH2, cũng như các đặc điểm quy mô lớn của xương sống. Đặc biệt, các chế độ ở quy mô nhỏ nhất của phương pháp mới mô tả các DoFs tương tự như các mô hình nguyên tử thống nhất và các mô hình CG được định nghĩa hóa học khác. Các chế độ ở các cấp độ thô hơn mô tả các phần kết nối ngày càng lớn của các polymer mục tiêu. Đối với polyethylene và polystyrene, các tọa độ không gian và các lực liên quan đã được nén tới hai bậc độ lớn. Việc nén các lực là điều đặc biệt thú vị vì điều này cho phép các bước thời gian lớn hơn cũng như giảm số lượng DoFs.